Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,671,415 | 0 | C | T | 43.4% | 97.7 / 43.6 | 76 | K160K (AAG→AAA) | yhjB | putative DNA‑binding transcriptional response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/3); new base T (0/33); total (40/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-18 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCCTGCTGGCTGTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCC > NC_000913/3671266‑3671559 | tCCTGCTGGCTGTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTcc < 1:855540/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCTGTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCtt > 2:744043/1‑150 (MQ=255) ggctgTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTAttt < 2:529178/149‑1 (MQ=255) gctgTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGAt < 2:1404906/151‑1 (MQ=255) gctgTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGAt > 2:66592/1‑151 (MQ=255) aaaaTTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTcgc < 1:113518/150‑1 (MQ=255) aTTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTcgcccgc > 2:366700/1‑151 (MQ=255) aTCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCTTTATTTGATTCGCccgccg < 2:1240470/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCGGGGTGCGTTTTTTCCCTGCCAGACGGCGATACGGGGTTTCCAGATGCGTTTTTCCCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCTTTTTTTGATTCTCCcgccgc < 2:595336/149‑1 (MQ=255) ctctTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTa > 2:992145/1‑150 (MQ=255) aggaggAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGt > 2:816476/1‑151 (MQ=255) ggagATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTaa > 1:759482/1‑150 (MQ=255) agaTATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAAt > 2:1195924/1‑151 (MQ=255) atTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTcc > 1:1227235/1‑151 (MQ=255) atTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTcc > 2:308927/1‑151 (MQ=255) tttAACATCTTGCCCGCTGGGGTGCTTTTTTTCCCTCCCAGAGGGAGATACAGGGATTCCAGATGCGTTTTTCCCTTCCCGG‑TACTGATTTTCAGCGCTCTGCCGTTCTCTTTTTTTGTTCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTcc < 1:851458/150‑1 (MQ=255) tttAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTccc > 2:1287205/1‑151 (MQ=255) tAACATCATTGCCGCCTGGGAGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGc > 2:227102/1‑151 (MQ=255) tAACATCATTGCCGCCGGGGTGGTTTTTTTCCCTCCCAGACGGCGATACGGGGATTCCAGATGCGTTTTTCCCGTTCCGG‑TACTGATATTCGGCGCTCTGCCGATCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCg < 1:230036/150‑1 (MQ=255) aaCATCATTGCCGCCGGGGTGCGTTTTTCCACTCCCAGCCGGCGATACAGGGATCCCAGATGCGTTTTTCCCTTTCCGG‑TCCTGATATCCGGCGCTCTGCCGTTCTCTTTTTTTGTTCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGc < 2:529197/150‑1 (MQ=255) catcatTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTgg > 2:983606/1‑151 (MQ=255) tcatTGCCGCCTGGGTGCGTTTTTTCACTCCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCTTTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCTTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggc < 1:608923/150‑1 (MQ=255) tcatTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcg > 2:686713/1‑151 (MQ=255) catTGCCGCGTGGGTGCTTTTTTTCACTCCCAGACGGCGATACAGGTATTCCAGATGCGTTTTTCCCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCTTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggc < 1:1100421/149‑1 (MQ=255) catTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgg > 1:1021972/1‑151 (MQ=255) ttGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggc > 1:340254/1‑151 (MQ=255) tGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggcg > 1:493178/1‑151 (MQ=255) tGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggc > 2:1072308/1‑150 (MQ=255) ccgctgggttgctttttttCCCTCCCAGAGGGCGATACAGGGATTCCAGTTGCTTTTTTCCCGTTCGGT‑TATTTATATCCAGCGCTCTGCCGTTCTCTTTATTTGTTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTggcgggcg < 1:642066/135‑1 (MQ=255) tGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACg > 1:44788/1‑151 (MQ=255) ggttgtttttttcCACTCCCAGCCGGCGATACAGGTTTCCCAGATGCGTTTTTCCCGTTCCGG‑TACTGATTTTCAGCTCTCTGCCGTTCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAAc < 2:333104/141‑1 (MQ=255) gggTGCTTTTTTTCCCTCCCAGACGGCGATACAGGGATCCCAGATGCGTTTTTCCCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTCCCGATCTCTTTATTTGTTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGa < 1:398574/151‑1 (MQ=255) gggTGCGTTTTTCCCCTCCCAGAGGGCGATACGGGGATCCCAGTTGCTTTTTTCCCTTCCCGT‑TACTGTTATCCAGCGCTCTCCCGTTCTCTTTTTTTTTTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCtt < 2:839332/146‑1 (MQ=255) gggTCCGTTTTTTCCCTTCCAGACGGCGATACGGGGATTCCAGATGCTTTTTTCCCGTCCCGG‑TCCTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACg < 1:1251402/150‑1 (MQ=255) gCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTg > 1:1199397/1‑151 (MQ=255) cGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTg > 1:989644/1‑150 (MQ=255) gATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTg > 2:881152/1‑149 (MQ=255) gATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTg > 1:1082482/1‑149 (MQ=255) ttttcCCCTCCCAGACGGCAATACAGGGTTTCCAGATGCGTTTTTCCCGTCCCGG‑TACTGATATCCAGCGCTCTGCCGTTCTCTTTTTTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTga < 1:1066077/148‑1 (MQ=255) ttttCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTg > 2:1367247/1‑146 (MQ=255) ttCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATg > 2:1414993/1‑151 (MQ=255) cgaggcGGAGATACAGGTATCCAAGTTTCGTTTTCACCGTTCCGG‑TATTGATATACCGCGCTCTGCCGTTCTTTTTTTTTGTTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAAt < 2:544787/143‑1 (MQ=255) ccAGCCGGCAATACAGGGATCCAAGATGCGTTTTTCCCGTCCCGT‑TACTAATATCCAGCGCTCTGCCGTTCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTaa < 1:1011726/147‑1 (MQ=255) aGACGGCGATACGGGGATTCCAGATGCGCTTTTCCCGTTCCGT‑TACTGATATTCAGCGCTCTCCCGATCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGt < 2:1082382/148‑1 (MQ=255) aGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCt > 1:1437182/1‑151 (MQ=255) gACGGCGATACGGGGATCCAAGTTGCGCTTTTCCCGTCCCGT‑TACTTATTTTCAGCGCTCTGCCTTTCTTTTTTTTTTTTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTc < 2:577192/148‑1 (MQ=255) ggggATACGGGGATTCCAGATGCTTTTTTCCCGTCCCGT‑TATTGATATCCAGCCCTTTGCCGTTCTCTTTTTTTGTTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCtttt < 1:895193/147‑1 (MQ=255) ggCGATAGGGGAATTCCAGGGGCTTTTTTCCCTTCCCGG‑TAGTAATATCCAGGGCTCGCCCGGTCTCTTTTTTTGTTCCCCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTaa < 2:1115829/141‑1 (MQ=255) ggCGATACGGGGTTTCCAGTTGCTTTTTTCCCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCTTTTTTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCttt < 1:66602/149‑1 (MQ=255) ggCAATACAGGGATTCCAGATGCGTTTTTCCCGTCCCGG‑TATTGATATCCAGCCCTCTGCCGTTCTCTTTTTTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTcc < 1:1356626/146‑1 (MQ=255) gCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTcc > 1:97707/1‑151 (MQ=255) cGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCg > 2:966583/1‑151 (MQ=255) aaTACAGGGATCCCAGATGCTTTTTTCCCGTCCCGG‑TACTGATTTTCGGCCCTCGCCCGTTCTCTTTTTTTGATCCCCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCgg < 2:989550/150‑1 (MQ=255) aTACGGGAATCCCAGATGCTTTTTTCCCGTTCCGT‑TACTATTATTCATCGCTCTGCCTTTCTCTTTTTTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTcc < 1:1214829/148‑1 (MQ=255) aTACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGc > 1:986978/1‑151 (MQ=255) acggtgttcccAGATCCGTTTTTCCCTTTCGGG‑TACATAGATACGGCGCTCGGCCGTTCTCTTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGcgt < 2:363963/142‑1 (MQ=255) acgggtaTTCCAGTTCCTTTTTTCCCTTCCCGG‑TACTAATATCCAGCGCTCTGCCTTTCTCTTTTTTTTATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCgg < 2:256420/142‑1 (MQ=255) aCAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGcgt > 2:869518/1‑151 (MQ=255) ggtattcaagtggcgttttTCCCTTCCGGTTATTTATATACGGCGCTCTCCCTATCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGcgtcg < 1:771647/135‑1 (MQ=255) tcccagactcttttttCCCGTTCCGG‑CCCTTTTCTTCCGCCCTCGCCCGATCTTTTTTTTTTATCCCCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTcc < 2:1189066/137‑1 (MQ=255) ccAGATGCGTTTTTCCCGTCCCGT‑TACTGATATTCAGCGCTCTCCCGATCTCTTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCa < 1:24467/151‑1 (MQ=255) ccAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGcc > 1:116743/1‑150 (MQ=255) aGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGt > 1:216436/1‑151 (MQ=255) ggtgcctttttCCCTTGCCGG‑TCCTGATATCCGCCGCTCTCCCGTTTTCTTTTTTTTTCTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAg < 2:494481/142‑1 (MQ=255) ttttCCCGTTCCGG‑TATTGATATCCGGCGCTCTCCCTTTCTTTTTTTTTGTTCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCa < 2:236022/148‑1 (MQ=255) tttccccttcccGG‑TACTAATTTCCGGCGCTCTGCCTTTCCCTTTTTTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCa < 1:960671/138‑1 (MQ=255) aCCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGa > 1:1044566/1‑150 (MQ=255) cGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAAc > 2:481480/1‑151 (MQ=255) ttCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAAcat > 1:1307319/1‑151 (MQ=255) ttCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAAcat > 1:530210/1‑151 (MQ=255) gg‑TACTGATATTCGGCGCTCTGCCGATCTCTTTTTTTGATCCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAAcatc < 1:578194/148‑1 (MQ=255) aCTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATcccc > 1:654309/1‑151 (MQ=255) cgcTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACt > 2:666996/1‑150 (MQ=255) ctctGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTAtt > 1:1088998/1‑151 (MQ=255) ctctGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTAtt > 2:1412141/1‑151 (MQ=255) ccGTTCTCTTTTTTTGTTCCCCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCa < 1:408731/141‑1 (MQ=255) aTCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGcc > 2:810841/1‑150 (MQ=255) | TCCTGCTGGCTGTAAAATTATCCTCTTCAGGAGGAGATATTTAACATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGG‑TACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCC > NC_000913/3671266‑3671559 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |