| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 304,834 | A→G | R124R (CGT→CGC) | ecpE ← | ECP production pilus chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 304,834 | 0 | A | G | 98.8% | 286.1 / ‑3.7 | 80 | R124R (CGT→CGC) | ecpE | ECP production pilus chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (42/37); total (43/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 | |||||||||||
TTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCACCATCCACCGGTC > NC_000913/304688‑304979 | ttGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCg > 2:397318/1‑149 (MQ=255) ccAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTgg < 1:316667/151‑1 (MQ=255) tgtTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGAc > 2:373382/1‑151 (MQ=255) ttacCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTcgcg > 2:1374676/1‑151 (MQ=255) tacCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTcgc < 1:654536/149‑1 (MQ=255) cGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAAt > 1:606738/1‑151 (MQ=255) gTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATg < 2:930799/151‑1 (MQ=255) gTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATg > 1:588041/1‑151 (MQ=255) gTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATg > 1:159838/1‑151 (MQ=255) ttCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATg > 1:1025072/1‑150 (MQ=255) tCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATg > 1:291026/1‑149 (MQ=255) ccTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATg > 1:596639/1‑148 (MQ=255) cTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGAc > 1:323207/1‑151 (MQ=255) tGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGAcc > 1:201165/1‑151 (MQ=255) cTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGgt > 1:642465/1‑149 (MQ=255) tGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGgtag < 2:1368956/149‑1 (MQ=255) tGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGgtag < 2:702884/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGgtagt > 2:19416/1‑149 (MQ=255) gAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAgcgc > 2:486475/1‑151 (MQ=255) gAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAgcgc > 1:932751/1‑151 (MQ=255) ggACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTcg > 1:1417946/1‑151 (MQ=255) gACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTcgc > 2:417612/1‑151 (MQ=255) ttAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTa < 1:1083848/150‑1 (MQ=255) aaaCTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATcc > 2:67465/1‑151 (MQ=255) aaCTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATccc > 1:484047/1‑151 (MQ=255) cTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCg < 2:1468113/150‑1 (MQ=255) gAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTgg < 1:927829/151‑1 (MQ=255) gAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTgg < 2:323167/151‑1 (MQ=255) gAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTg < 1:1090796/150‑1 (MQ=255) aaCCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTgg > 1:1024570/1‑150 (MQ=255) ccTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGAcc > 2:1472886/1‑151 (MQ=255) tGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCAt > 2:1309934/1‑151 (MQ=255) tGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCAt > 1:1300498/1‑151 (MQ=255) gACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCa < 1:691821/149‑1 (MQ=255) gACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCAt < 1:937509/150‑1 (MQ=255) gACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATg < 2:1337877/151‑1 (MQ=255) aCGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATg > 2:518365/1‑150 (MQ=255) gTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGAt > 1:1359647/1‑150 (MQ=255) gTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATa < 2:1422212/151‑1 (MQ=255) ggTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAg < 2:1351267/150‑1 (MQ=255) gTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTa < 2:660676/151‑1 (MQ=255) cGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTaaa < 2:558509/151‑1 (MQ=255) tacCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAAttt > 1:1194003/1‑150 (MQ=255) acCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTaa < 1:906196/151‑1 (MQ=255) acCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTaa < 1:223643/151‑1 (MQ=255) ccAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTaaa < 1:702444/151‑1 (MQ=255) ccAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTaa < 1:935823/150‑1 (MQ=255) aGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAAt > 1:576011/1‑151 (MQ=255) gAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATa < 2:1428625/151‑1 (MQ=255) aaTGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATAc < 2:606666/151‑1 (MQ=255) aTGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACt > 1:1144532/1‑151 (MQ=255) aTGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACt < 2:1258431/151‑1 (MQ=255) aTGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACt > 1:876940/1‑151 (MQ=255) ggTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCg < 2:159817/151‑1 (MQ=255) aTCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGct < 2:175241/150‑1 (MQ=255) cATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCa < 1:618731/151‑1 (MQ=255) ccaccaccGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAg < 2:527772/150‑1 (MQ=255) caccaccGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGcc > 2:339166/1‑151 (MQ=255) ccaccGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTCTCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTg > 2:319739/1‑151 (MQ=255) caccGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGc > 1:35335/1‑151 (MQ=255) ccGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCa > 1:607538/1‑150 (MQ=255) cGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAAc > 2:71678/1‑151 (MQ=255) cGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAAc > 1:238506/1‑151 (MQ=255) tCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGcc > 1:1285208/1‑150 (MQ=255) gTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCt > 2:629130/1‑151 (MQ=255) gCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTg < 2:116640/150‑1 (MQ=255) gCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTg < 1:914492/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCgggggg > 2:409811/1‑151 (MQ=255) aCGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAATAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCgggggg < 2:364445/151‑1 (MQ=255) gccgccGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCg < 2:596568/151‑1 (MQ=255) ccgccgGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGa < 1:457119/151‑1 (MQ=255) cgccgGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGa > 2:984995/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGc > 1:304924/1‑151 (MQ=255) gTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGc > 2:765939/1‑150 (MQ=255) gggCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGt < 1:1069998/150‑1 (MQ=255) cTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCAc > 2:368754/1‑151 (MQ=255) cGTCTTGTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCACCAt < 2:874856/151‑1 (MQ=255) cGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCACCa > 2:726352/1‑150 (MQ=255) gTATGGTTGCGAGTGGGGACCTCGGGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCCCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACACCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCACCATcc < 1:490887/147‑1 (MQ=255) ggTTGCGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCACCATCCACCGGTc < 2:1288690/150‑1 (MQ=255) | TTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGGGGGGCGAAAAGCAGTTCACCATCCACCGGTC > NC_000913/304688‑304979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |