Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,516,435 | G→A | S81S (AGC→AGT) | fecA ← | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,516,435 | 0 | G | A | 99.1% | 432.0 / ‑4.5 | 111 | S81S (AGC→AGT) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (59/51); total (60/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATACGTCGTTTTCACGCGCATCACCCAGCCAGTCGCCGACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCA > NC_000913/4516287‑4516582 | aCGTCGTTTTCACGCGCATCACCCAGCCAGTCGCCGACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCActct > 2:649216/1‑151 (MQ=255) aCGTCGTTTTCACGCGCATCACCCAGCCAGTCGCCGACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCActct < 1:772630/151‑1 (MQ=255) gtTTTCACGCGCATCACCCAGCCAGTCGCCGACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCACTCTCGAcg > 2:363556/1‑151 (MQ=255) 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cAGGCCACTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTgca < 1:649290/151‑1 (MQ=255) gCCACTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGGAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTgca < 2:431274/148‑1 (MQ=255) | ATACGTCGTTTTCACGCGCATCACCCAGCCAGTCGCCGACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCA > NC_000913/4516287‑4516582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |