Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,894,752 | T→C | intergenic (‑21/‑53) | yoaH ← / → pabB | UPF0181 family protein/aminodeoxychorismate synthase, subunit I |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,894,752 | 0 | T | C | 99.1% | 414.8 / NA | 111 | intergenic (‑21/‑53) | yoaH/pabB | UPF0181 family protein/aminodeoxychorismate synthase, subunit I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (60/50); minor base A (1/0); total (61/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ACGCAGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGTTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGAT > NC_000913/1894606‑1894899 | aGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTa < 1:1091861/151‑1 (MQ=255) tcttctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAatt > 1:890422/1‑151 (MQ=255) tctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAattat < 2:1012196/150‑1 (MQ=255) tctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAatta < 1:1395772/149‑1 (MQ=255) tctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAatt < 1:575457/148‑1 (MQ=255) gCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCa < 1:215211/151‑1 (MQ=255) ccaccaGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCa < 2:600803/150‑1 (MQ=255) caccaGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCAt > 1:866417/1‑150 (MQ=255) caccaGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATg > 2:1166213/1‑151 (MQ=255) caGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTa < 2:1068455/151‑1 (MQ=255) aGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTAc < 1:1285693/151‑1 (MQ=255) gcgATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCg > 1:759898/1‑151 (MQ=255) cgATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCgg < 2:421080/151‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGc > 2:357701/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGcac > 2:348797/1‑151 (MQ=255) cagCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGca > 2:944621/3‑150 (MQ=255) tGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGcac > 1:1067616/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGcaca < 2:1135308/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACAt > 2:1264749/1‑151 (MQ=255) ccTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATa < 1:1349062/151‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGc > 1:754486/1‑151 (MQ=255) ggCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGcc < 1:1120556/151‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCa < 1:1259095/151‑1 (MQ=255) cGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGt > 1:1362362/1‑151 (MQ=255) gctCATCCCTTGTGCCTTCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAAGTATTGCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag < 2:798939/149‑1 (MQ=255) gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTagag < 1:408128/151‑1 (MQ=255) gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag > 1:685383/1‑149 (MQ=255) gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag > 1:866587/1‑149 (MQ=255) gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag > 1:45880/1‑149 (MQ=255) cATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCa < 1:618750/151‑1 (MQ=255) aTCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTc > 2:1176106/1‑149 (MQ=255) tCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAgg > 1:253606/1‑151 (MQ=255) cccTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGa < 2:1323199/151‑1 (MQ=255) ccTCGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAACCATTGTTAACCCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCTCATAGCCAGTAGAGTCAgg < 2:117041/149‑1 (MQ=255) tgtgCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACt < 2:883701/149‑1 (MQ=255) tgCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCCGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACtgat > 2:447152/1‑150 (MQ=255) ccATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACGGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGaa < 1:913312/151‑1 (MQ=255) aTCAGTTCCTGGATTCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATGTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGa < 2:1307417/151‑1 (MQ=255) cAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACg > 2:296492/1‑151 (MQ=255) aGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGt > 1:699938/1‑151 (MQ=255) aGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGt > 1:489377/1‑151 (MQ=255) gTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCCGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGtt > 1:293665/1‑151 (MQ=255) ccTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTAtc > 2:158402/1‑151 (MQ=255) aTCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCg > 1:221976/1‑151 (MQ=255) ccGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCt < 2:814515/151‑1 (MQ=255) cGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtg > 2:1186996/1‑151 (MQ=255) cGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtg < 1:984259/151‑1 (MQ=255) gCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtgt > 2:1471265/1‑151 (MQ=255) cTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtgtg > 1:1410585/1‑151 (MQ=255) cGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAt < 2:789287/151‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttact > 1:426864/1‑151 (MQ=255) gCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttactt > 1:1106350/1‑151 (MQ=255) tttttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttacttt > 2:653639/1‑150 (MQ=255) ttttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGACGACGTTATCTCCCGCTGTGAttacttta > 2:331425/1‑150 (MQ=255) tttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttactttact > 1:481271/1‑151 (MQ=255) ttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTActc > 1:1213297/1‑151 (MQ=255) gctgctGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTActct < 1:944710/150‑1 (MQ=255) gctgctGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTg > 2:287620/1‑151 (MQ=255) gctgctGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTg < 1:194792/151‑1 (MQ=255) tgctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGc > 1:53358/1‑151 (MQ=255) tgctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGc > 1:239742/1‑151 (MQ=255) gctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTgg < 1:528124/149‑1 (MQ=255) gctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGc < 2:866499/150‑1 (MQ=255) tCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAgg > 2:1384464/1‑151 (MQ=255) tCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAgg > 1:1001498/1‑151 (MQ=255) gggTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGAcg < 1:180573/150‑1 (MQ=255) gtgagtgaAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGAcgccg > 2:923816/1‑151 (MQ=255) aaGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAAtt > 1:1100560/1‑151 (MQ=255) ggTAAACCTGCAAACATAGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTATAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTATCGCTGCTTTACTCTCGCGTCATGACGCCGCTGAGtttt < 2:460122/151‑1 (MQ=255) tAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAt > 2:1111027/1‑151 (MQ=255) aaaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAtt > 1:759986/1‑151 (MQ=255) aaaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAtt > 2:197415/1‑151 (MQ=255) aaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAttt > 1:596287/1‑151 (MQ=255) aaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAttt < 2:430711/151‑1 (MQ=255) aaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAttt > 1:890594/1‑151 (MQ=255) ccTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTtct > 1:673324/1‑151 (MQ=255) gCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTtctc < 1:166649/149‑1 (MQ=255) cAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCg < 1:1314991/151‑1 (MQ=255) cAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCg > 2:410795/1‑151 (MQ=255) cAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCg < 1:469912/151‑1 (MQ=255) aaCATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCt > 2:1275006/1‑151 (MQ=255) aCATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCtt < 1:331467/151‑1 (MQ=255) cATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTa < 2:614066/151‑1 (MQ=255) cATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTa < 2:890334/151‑1 (MQ=255) aTTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTaa < 1:389797/151‑1 (MQ=255) ttAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGcc > 2:1472444/1‑150 (MQ=255) ttAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATCATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACGCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGcc < 1:111937/150‑1 (MQ=255) tAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCAc > 2:1395047/1‑151 (MQ=255) tAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCAc > 1:1082308/1‑151 (MQ=255) tAACTCCTGCTAAATTGATGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCa > 1:996018/1‑150 (MQ=255) aaCTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTAACCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCAcc > 2:161337/1‑151 (MQ=255) aCTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCt < 1:1264850/151‑1 (MQ=255) cTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTg > 2:439765/1‑151 (MQ=255) tCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGc > 2:1315298/1‑151 (MQ=255) gCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCCCCTGCCGTg < 2:1025088/151‑1 (MQ=255) cTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTgg > 1:448812/1‑151 (MQ=255) tAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGt < 2:65803/148‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGc < 2:1285539/151‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCg < 2:685307/151‑1 (MQ=255) ttgctgGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGAt > 1:982451/1‑151 (MQ=255) | ACGCAGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGTTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGAT > NC_000913/1894606‑1894899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |