| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 40.3% | 115.9 / 10.7 | 73 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative DASS family tricarboxylate or dicarboxylate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/14); new base C (0/29); total (29/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTG > NC_000913/801973‑802267 | cGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAa‑ccacc < 1:1067586/151‑1 (MQ=255) gAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCCATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCAccg > 1:376976/1‑151 (MQ=255) gCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTAt > 2:906916/1‑151 (MQ=255) gCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTAt < 2:1181855/151‑1 (MQ=255) gTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCg > 2:1130418/1‑151 (MQ=255) cTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGtt > 1:632674/1‑151 (MQ=255) ttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTActc > 1:1189830/1‑151 (MQ=255) ttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTActc > 1:129586/1‑151 (MQ=255) tGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTActct > 1:888270/1‑151 (MQ=255) tttttCCCTGGGGGCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCTTTTCCG‑GA‑ACCCTGTCGTCCTGTTAATTGCCGTTGCTCCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAATTTACCCGAGGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCtt < 2:560023/147‑1 (MQ=255) aTTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:629010/1‑149 (MQ=255) ttACCTGGCGGACATTGTGGGGATGGTTATCAAGCATTTCCC‑GG‑AACATGTCGTACTGTTAATTGACGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGAGCGTTTAAAA‑CCACCGTCGTATTAAGCGGTAActct > 1:847182/1‑145 (MQ=255) ttACCGGGCGGCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAACCCTTCCCC‑GG‑AACCTGTCGTTTTGTTAATTCCGGTTTCTGCCTCATTGGGGGTGTTGGGTAACTTATCCGCCGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAgg < 1:1276115/150‑1 (MQ=255) ccgggcggcCTTTGGGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑ACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt < 2:308013/145‑1 (MQ=255) ccgggcggcCTTTGGGGGGCTGGTTACCAAGCCTTCCCC‑GG‑ACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTa < 2:1268356/146‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCGATTGGGGGGCTGTTTATCAACCCTTCCCG‑GG‑AACCTGTCGTACTTTTAATTGCTGTTGCCCCCTCAAGGGTGGTGGTGGGTAATTTATCCGGGGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTa < 1:895614/149‑1 (MQ=255) ggcgccCTTTGGGGGGCTGGTTATCAACCTTTTCCC‑GG‑ACCCTGTCGTACTGTTATTTGCCGTTGCTCCCTCATTGGGGTTGGTGGTTAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTacc < 2:1012624/148‑1 (MQ=255) ggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctgg > 2:516960/1‑151 (MQ=255) aTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctgg > 2:400741/1‑151 (MQ=255) gtgGGGCGGTTTAGCACTCTTTCCCC‑GA‑ACCCTGTCGTACTTTTATTTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTATCTTCCCCGACGTTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgtg < 1:1254773/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTATCAAGCTTTCCCC‑GG‑ACCCTGTCGTATTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGTTAACTTACCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtctc < 2:1012670/150‑1 (MQ=255) ttATCAAGCCTTCCCG‑GG‑AACTTTTCGTATTGTTAATGGCCGTTGCTGCCTAAGTGTGGGTGGTCGGTAATTTATCCGAGGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCg < 1:1132434/146‑1 (MQ=255) aTCAAGCCTTTCCC‑GG‑ACCCTGTCTTACTTTTATTGCCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGGCGGTGCGTTAAAAC‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGtt < 1:715582/149‑1 (MQ=255) aTCAAGCCTTTCCC‑GG‑ACCCTGTCGTCTTTTTAATTGCCTTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTa < 2:554859/151‑1 (MQ=255) aTCAACCCTTCCCC‑GG‑ACCCTGTCGTACTTTTAATTCCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGGGGTCGGTACCTTACCCGCGGGTGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTa < 2:475188/151‑1 (MQ=255) tCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAc > 2:203618/1‑151 (MQ=255) acgCCTTCCCC‑GG‑ACCCTGTCGTACTTTTAATTCCCGTTGCGGCCTCAGGGGTGGTGGTCGGTACCTTACCCGCCGGTGCTTTAAAAC‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAc < 2:1237605/147‑1 (MQ=255) cTTTCCC‑GGAAACCTGTCGTTTTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGTTAACTTACCCGGGGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCtt < 1:891586/149‑1 (MQ=255) cTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa > 2:1153668/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGG‑AACCTGTCGTACTTTTATTTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGGGGTGGTGGGTATCTTCTCCGACGGTGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTaa < 1:846484/149‑1 (MQ=255) ccc‑GG‑CACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGCGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgcc > 1:397325/1‑151 (MQ=255) cc‑GG‑ACCCGGTCGTCCTGTTAAGTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGGGGTGGGTACTTTGCCCGGGGGTGCTTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccg < 2:888929/151‑1 (MQ=255) cc‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgccg > 2:700943/1‑151 (MQ=255) accctgccttccttttAATTGCCGTTGCTCCCTCAAGGGGGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAt < 2:436761/136‑1 (MQ=255) tggcgtggttttAATAGCTGTTCCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTCGCCGGCGGTGTGTTAAAAC‑CCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAttt < 2:218318/138‑1 (MQ=255) gtcgtttttttATTTGCCGTTGCGCCCTAAGTGGTGGTGGTCTTTATCTTAGCCGTGGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt < 2:131365/140‑1 (MQ=255) cGTACTTTTATTGGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGac < 2:400844/150‑1 (MQ=255) gTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacc > 2:18163/1‑150 (MQ=255) tACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGCCGGTGCTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgtg < 2:164863/146‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTTGCTGCCTCATTGGTGGTGGTGGTTAATTTACCCGACGTTGGTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCgg < 1:1213508/149‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCgg < 2:946782/149‑1 (MQ=255) tAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt > 1:764595/1‑151 (MQ=255) tAAGTGCCGTTGCTCCCTAAGTGGGGGTGGTCGGTATCTTTCCCAACGGTGGTTTTAAAC‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCTCCGGt < 1:327693/149‑1 (MQ=255) aaTTGCCTTTGCTGCCTCATGGGGGGGGGTCGTTACCTTATCCGCCGGTGCTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGtt < 2:65681/149‑1 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTACCTTATCCGACGGTGCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTa < 2:131376/151‑1 (MQ=255) ttGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAACGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAgg > 1:343761/1‑151 (MQ=255) ccGTTGCTGCCTCATTGGTGGGGGTTGGTAACTTACCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 2:1158976/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCGTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGt < 2:1224441/149‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTaa > 1:624126/1‑150 (MQ=255) gctgcCTCAATGGTGGTGGGCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGt < 2:970111/150‑1 (MQ=255) tgcCCCAGTGGGGGGGGTCGGTAATTTCTCCTACGGT‑CGTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCTCCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 2:1146562/143‑1 (MQ=255) cTCAAGGGTGGTGGTCGTTACTTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAt < 2:955538/147‑1 (MQ=255) tCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCt > 2:282756/1‑151 (MQ=255) atgggtggtggtCGTAAGTTTATCCGGCGGTGCGTTTAAAG‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTTCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTa < 1:1258756/140‑1 (MQ=255) aagggtggtggtCGGTAACTTATCCGAGGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGcc < 2:717838/145‑1 (MQ=255) aaTGGGGGTGGTCGGTAACTTACCCGGCGGTGCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa < 2:806333/150‑1 (MQ=255) gggggtggtCGGTATCTTACCCGACGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATct < 2:392916/147‑1 (MQ=255) gggggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATct < 2:402726/147‑1 (MQ=255) 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ggTATCTTACCCGAGGGTGCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt < 2:1225463/150‑1 (MQ=255) aaCTTATCCGCCGGTGCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTa < 2:997034/148‑1 (MQ=255) aaCTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa > 1:117583/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGGGTGTTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATc < 1:601774/150‑1 (MQ=255) aTCCGACGGTGCGTTCAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGt > 2:843218/1‑151 (MQ=255) 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tAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgg > 1:586220/1‑149 (MQ=255) aaac‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtc < 2:415752/151‑1 (MQ=255) aaa‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtct > 1:31972/1‑151 (MQ=255) aa‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtctg > 2:607183/1‑151 (MQ=255) aa‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctgggtctg > 1:423589/1‑151 (MQ=255) | CGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTTCCC‑GG‑AACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGGTCTG > NC_000913/801973‑802267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |