Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,474,735 | C→T | A172V (GCG→GTG) | ydbC → | putative NAD(P)‑binding oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,474,735 | 0 | C | T | 97.8% | 337.7 / NA | 91 | A172V (GCG→GTG) | ydbC | putative NAD(P)‑binding oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (48/40); minor base G (2/0); total (50/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTAACCTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGCGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGCAATCG > NC_000913/1474588‑1474880 | ttAACCTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGgtgcg > 2:855335/1‑151 (MQ=255) tAACCTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGgtgcgc > 2:113506/1‑151 (MQ=255) tAACCTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGgtgcg < 2:740260/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCGCGGTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACAACGACGCAGGTTGCAGAGgtgcg > 1:3832/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCa > 2:357175/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCa > 1:612637/1‑148 (MQ=255) gcgcGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGAtt < 1:886032/151‑1 (MQ=255) gcgcGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGAtt < 2:410040/151‑1 (MQ=255) cgcgTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTg < 1:280170/151‑1 (MQ=255) tgatgGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGaaa < 2:326042/150‑1 (MQ=255) gatgGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAAtt > 1:416296/1‑151 (MQ=255) atgGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTg > 1:670847/1‑151 (MQ=255) atgGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGGGCGCAAGATTGCCGAAATTg > 2:229869/1‑151 (MQ=255) ggggATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCt > 2:505676/1‑151 (MQ=255) gggATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCtg < 2:553726/151‑1 (MQ=255) gATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCtgtg < 1:346899/151‑1 (MQ=255) gATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCtgtg > 1:418897/1‑151 (MQ=255) ggTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCtgtgtg < 2:1021606/150‑1 (MQ=255) 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ccTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCtgatga < 1:655611/150‑1 (MQ=255) cTGACCGAGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTgatgat > 1:669893/1‑150 (MQ=255) gACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGc > 1:77019/1‑150 (MQ=255) gACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGc > 2:350704/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCaa < 1:1275812/151‑1 (MQ=255) 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acaaGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTCGGCCCACg > 1:12766/1‑149 (MQ=255) caaGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATg > 1:819042/1‑151 (MQ=255) aaGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATgg > 2:1223654/1‑151 (MQ=255) aaGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATgg > 2:170145/1‑151 (MQ=255) aGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGc > 2:1270490/1‑151 (MQ=255) 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gTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCggg > 2:556789/1‑150 (MQ=255) cacaCCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCggggg < 2:916999/150‑1 (MQ=255) cacaCCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGc > 1:417556/1‑151 (MQ=255) cacaCCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGc > 1:1218942/1‑151 (MQ=255) cacaCCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGc < 2:1036869/151‑1 (MQ=255) acacCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCt < 2:8512/151‑1 (MQ=255) acCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCttt > 2:751947/1‑151 (MQ=255) acCGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGCGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCttt < 1:338854/151‑1 (MQ=255) ccGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTa < 2:1050451/151‑1 (MQ=255) ccGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTa < 2:763390/151‑1 (MQ=255) cGACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTac > 2:302142/1‑151 (MQ=255) gACGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTac > 2:487709/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACAcc > 1:956928/1‑151 (MQ=255) cGCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACAcc > 2:548071/1‑151 (MQ=255) gCAGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCg > 1:881119/1‑151 (MQ=255) aGGTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATAGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCTGCTCGGGGGCTTTACAcc > 1:876616/1‑148 (MQ=255) ggTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTg > 2:1188317/1‑151 (MQ=255) gTTGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGc > 2:376426/1‑151 (MQ=255) tGCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGCa < 2:361146/150‑1 (MQ=255) gCAGAGGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGCAAt > 1:688371/1‑151 (MQ=255) agagGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGCAATCg < 1:806707/151‑1 (MQ=255) agagGTGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGCAATCg > 1:1200170/1‑151 (MQ=255) | TTAACCTGCGCGTTATGATGGGGGATGGTCATGGCCCAGCGGAAGGATCGATTGAGGCCAGCCTGACCGTGCTGGCAGAGATGCAACAACAAGGCCTGGTAAAACATATTGGCCTGAGCAACGTCACACCGACGCAGGTTGCAGAGGCGCGCAAGATTGCCGAAATTGTCTGTGTGCAAAACGAATACAACATCGCGCACCGTGCTGATGATGCAATGATTGATGCTTTGGCCCACGATGGCATTGCCTACGTGCCGTTCTTCCCGCTCGGGGGCTTTACACCGCTGCAATCG > NC_000913/1474588‑1474880 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |