| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 165,917 | C→T | A396A (GCC→GCT) | mrcB → | fused glycosyl transferase and transpeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 165,917 | 0 | C | T | 98.8% | 342.7 / ‑4.4 | 86 | A396A (GCC→GCT) | mrcB | fused glycosyl transferase and transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (38/47); total (38/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
AGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTGACTCG > NC_000913/165769‑166061 | agGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCTAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCg < 1:90073/151‑1 (MQ=255)agGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCg < 1:694680/151‑1 (MQ=255) cgcTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTcc < 2:469074/151‑1 (MQ=255) cgcTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTcc < 1:978664/151‑1 (MQ=255) gcTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCg < 2:552630/151‑1 (MQ=255) tCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGt > 2:240324/1‑151 (MQ=255) tCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGt > 2:750798/1‑151 (MQ=255) cGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGtt < 2:947991/151‑1 (MQ=255) gTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCa < 2:1462069/151‑1 (MQ=255) gTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCa < 2:374806/151‑1 (MQ=255) aTGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAg < 2:44863/150‑1 (MQ=255) aTGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGc < 2:100973/151‑1 (MQ=255) aTGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGc > 2:36224/1‑151 (MQ=255) ggTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGcc < 2:755094/150‑1 (MQ=255) tGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCcgcg > 1:532358/1‑151 (MQ=255) aaGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCgg > 1:731850/1‑151 (MQ=255) aaGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCgg > 2:172757/1‑151 (MQ=255) aGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCgg > 2:788037/1‑150 (MQ=255) aGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGt > 1:786229/1‑151 (MQ=255) ggggCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTg < 2:1030389/151‑1 (MQ=255) gggCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTgg < 1:1094566/151‑1 (MQ=255) cGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGt < 1:1714443/151‑1 (MQ=255) gTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTg > 2:1353006/1‑151 (MQ=255) tCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTg > 1:1159102/1‑150 (MQ=255) cATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGAtc < 1:478641/151‑1 (MQ=255) tACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGAtctctc > 1:686548/1‑151 (MQ=255) aCAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGAtctctc < 1:1507092/150‑1 (MQ=255) aaCCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTctcctc > 1:106149/1‑151 (MQ=255) cccGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTcag < 2:462372/151‑1 (MQ=255) gTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTcagcca < 2:1003528/151‑1 (MQ=255) cGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCt < 2:7554/151‑1 (MQ=255) aaCCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCttt > 2:818448/1‑150 (MQ=255) aaCCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCttt < 1:1090864/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACt > 2:1474353/1‑151 (MQ=255) ggCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGt < 1:1093395/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTgg < 2:990261/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGc < 1:1137125/151‑1 (MQ=255) ggAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTc > 1:1612662/1‑149 (MQ=255) ggAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCa < 2:271075/150‑1 (MQ=255) gAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGGGCGTCAgg > 1:1528993/1‑151 (MQ=255) aGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGa < 1:1056533/151‑1 (MQ=255) cGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGc > 1:1016408/1‑151 (MQ=255) gACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCt > 2:778831/1‑151 (MQ=255) 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ctATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACt > 1:1618957/1‑151 (MQ=255) tATGACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACt > 2:619839/1‑150 (MQ=255) gACATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTAcc < 2:1305362/150‑1 (MQ=255) cATGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCttt > 1:1327310/1‑151 (MQ=255) aTGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTg > 1:120017/1‑151 (MQ=255) aTGTTGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTg > 2:1078784/1‑151 (MQ=255) tGAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTGACt < 1:685152/150‑1 (MQ=255) gAGTGCTCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTGACTCg < 2:1612760/151‑1 (MQ=255) | AGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGCCGCGCGGTGGGGTGATCTCTCCTCAGCCAGCCTTTATGCAACTGGTGCGTCAGGAGCTGCAGGCAAAACTGGGCGATAAGGTAAAAGATCTCTCCGGCGTGAAGATCTTCACTACCTTTGACTCG > NC_000913/165769‑166061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |