Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 172,368 | A→G | M303V (ATG→GTG) | fhuB → | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 172,368 | 0 | A | G | 99.1% | 422.7 / ‑4.3 | 112 | M303V (ATG→GTG) | fhuB | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (50/61); total (51/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.14e-01 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATCGGCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCC > NC_000913/172221‑172515 | aTCGGCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTgtgggtgg < 2:306786/151‑1 (MQ=255) tCGGCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGtgggtg > 2:1095908/1‑149 (MQ=255) cGGCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGtgggtgga > 1:1189889/1‑150 (MQ=255) ggCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGtgggtgga > 2:1493353/1‑149 (MQ=255) gCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAgt < 1:92064/151‑1 (MQ=255) tttATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAgtgt > 2:827696/1‑151 (MQ=255) tttATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAgtgt > 2:263898/1‑151 (MQ=255) ttATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAgtgt < 2:1158466/150‑1 (MQ=255) ttATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTc > 2:1051928/1‑151 (MQ=255) tATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTc < 1:1225165/150‑1 (MQ=255) tCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCAc > 2:817888/1‑151 (MQ=255) cGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCAc < 1:1181025/150‑1 (MQ=255) gggTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCg > 1:83904/1‑151 (MQ=255) 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aTGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTgcgc < 2:1027000/151‑1 (MQ=255) gggCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCgctgct > 1:185106/1‑151 (MQ=255) cggcgTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgt < 2:1189979/151‑1 (MQ=255) cggcgTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgt > 2:206335/1‑151 (MQ=255) ggcgTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACtgtg > 2:1160331/1‑151 (MQ=255) 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tCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCgg > 1:1705036/1‑149 (MQ=255) aaTCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGaa < 1:1323308/151‑1 (MQ=255) ctcCTCTGGCTGACTCGAGTGTGGGTGGAAGTGTCGACCGGTTCGCTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCTTTAGCGCGCCGGCGATGCAGGGCAACGATCGTGTCTCGGCCGAACGcc > 1:411367/2‑151 (MQ=255) ctctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCaa > 1:1104371/1‑150 (MQ=255) ctctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCaa > 1:1465243/1‑150 (MQ=255) tctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAAc > 1:1690689/1‑150 (MQ=255) ctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAAc < 2:1301505/149‑1 (MQ=255) ctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAAc < 2:602339/149‑1 (MQ=255) ctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAAc < 1:150025/149‑1 (MQ=255) ctGGCTGACTCGCGTGTGGGTGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACAt > 2:1235384/1‑151 (MQ=255) 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gtgggtggAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGcc > 2:542753/1‑151 (MQ=255) tgggtggaAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGccc > 2:1425413/1‑151 (MQ=255) | ATCGGCTTTATCGGGTTGTTCGCGCCGCTGCTGGCAAAAATGCTGGGGGCGCGGCGTCTGCTGCCACGACTGATGCTGGCGTCGTTGATTGGTGCGCTGATCCTCTGGCTTTCCGATCAAATCATCCTCTGGCTGACTCGCGTGTGGATGGAAGTGTCCACCGGTTCGGTCACTGCGTTGATCGGTGCGCCGCTGCTACTGTGGCTGTTGCCGCGTTTACGCAGCATTAGCGCGCCGGATATGAAGGTCAACGATCGTGTCGCGGCTGAACGCCAACATGTGCTGGCGTTTGCCC > NC_000913/172221‑172515 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |