Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,629,237 | T→C | intergenic (‑299/‑53) | yfgF ← / → yfgG | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic/uncharacterized protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,629,237 | 0 | T | C | 99.1% | 398.3 / ‑4.1 | 107 | intergenic (‑299/‑53) | yfgF/yfgG | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic/uncharacterized protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (50/56); total (51/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.01e-01 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATCTTCTTCTTTGGC > NC_000913/2629090‑2629382 | ccTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGcc > 1:324481/1‑151 (MQ=255) cTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCt > 1:1495596/1‑151 (MQ=255) tGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCtt > 1:211657/1‑151 (MQ=255) tGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCtt > 2:213193/1‑151 (MQ=255) gATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCtt < 2:1405972/150‑1 (MQ=255) aTTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTaa < 1:836213/151‑1 (MQ=255) tAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAAt < 2:614601/150‑1 (MQ=255) aaTGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATg < 1:144086/150‑1 (MQ=255) tGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTa > 1:368050/1‑150 (MQ=255) gAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTaa < 2:581679/150‑1 (MQ=255) gAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTa > 2:752149/1‑149 (MQ=255) gAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAg < 2:1583330/151‑1 (MQ=255) tattaCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTAcc > 2:76743/1‑151 (MQ=255) tattaCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTAc < 2:863522/150‑1 (MQ=255) attaCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTAcc < 1:343668/150‑1 (MQ=255) attaCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCg > 1:1619679/1‑151 (MQ=255) taCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTc > 1:231439/1‑151 (MQ=255) cGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTcc > 1:485239/1‑150 (MQ=255) cGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCca < 1:1006437/151‑1 (MQ=255) ttATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCcaca < 2:1282583/150‑1 (MQ=255) tATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAg < 1:1343800/150‑1 (MQ=255) tATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAg < 2:1125323/150‑1 (MQ=255) aTGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTgg > 1:1443235/1‑151 (MQ=255) aTGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTgg > 1:1321148/1‑151 (MQ=255) gTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGa < 1:1488337/151‑1 (MQ=255) gTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGa < 1:19708/151‑1 (MQ=255) tAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGAc > 2:1707549/1‑150 (MQ=255) tAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGATGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGAc > 1:1615996/1‑150 (MQ=255) aaTTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACAt < 1:1020265/151‑1 (MQ=255) aTTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACAt > 2:1657105/1‑150 (MQ=255) tcatcaTTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACt > 1:1539980/1‑151 (MQ=255) catcatTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACtt < 1:1431083/151‑1 (MQ=255) catcatTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACt < 1:1482287/150‑1 (MQ=255) tcatTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTc > 1:41214/1‑150 (MQ=255) attaCATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGaa < 2:390412/151‑1 (MQ=255) aCATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCt < 2:540945/151‑1 (MQ=255) atcatTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTtgt < 1:1284158/151‑1 (MQ=255) catTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGa < 1:507520/151‑1 (MQ=255) tGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTc > 2:479494/1‑151 (MQ=255) gTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTc > 2:1392540/1‑150 (MQ=255) gTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCa < 1:1449774/151‑1 (MQ=255) gTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCa < 1:1042254/151‑1 (MQ=255) gTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCa < 2:464877/151‑1 (MQ=255) aaaTAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAgg > 2:585680/1‑151 (MQ=255) ataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGc > 1:501136/1‑150 (MQ=255) ataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCa < 2:85434/151‑1 (MQ=255) attaaCTTCCATAACATTAAAATATCTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTAt < 1:659835/151‑1 (MQ=255) ttaaCTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCGGGCAACCAGTATg > 2:449977/1‑151 (MQ=255) taaCTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGc > 1:1095681/1‑151 (MQ=255) ccATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAc < 1:1493175/151‑1 (MQ=255) ccATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAAc < 2:907875/151‑1 (MQ=255) cATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACg > 2:1679197/1‑151 (MQ=255) cATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACg > 1:1217962/1‑151 (MQ=255) tAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGac > 1:873998/1‑151 (MQ=255) tAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGa < 1:1359423/150‑1 (MQ=255) aaaaTATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGAtt < 1:1246191/151‑1 (MQ=255) aaTATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGAttt > 1:320307/1‑150 (MQ=255) aaTATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGAttt > 2:1369408/1‑150 (MQ=255) atGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACGTACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAAc < 1:1143959/150‑1 (MQ=255) tGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAAct < 2:1657992/150‑2 (MQ=255) gTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAg < 1:415915/150‑1 (MQ=255) gTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAg < 1:1308279/150‑1 (MQ=255) gTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGt < 2:906411/151‑1 (MQ=255) aTCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCg > 1:940119/1‑151 (MQ=255) aTCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCg > 1:740691/1‑151 (MQ=255) aTCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCG‑CTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCg < 2:272735/150‑1 (MQ=255) tCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGc > 2:1238840/1‑151 (MQ=255) tCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGc > 1:764293/1‑151 (MQ=255) ccACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCa < 1:602389/151‑1 (MQ=255) cTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATg > 2:1288293/1‑150 (MQ=255) cTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATg > 2:1256022/1‑150 (MQ=255) tGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGAc > 1:678119/1‑151 (MQ=255) cGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCg < 1:76740/151‑1 (MQ=255) ttttttACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTAt > 1:796420/1‑151 (MQ=255) ttttttACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTAt > 2:1043236/1‑151 (MQ=255) ttttACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCg > 2:1608009/1‑151 (MQ=255) tttACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGt > 2:1575574/1‑151 (MQ=255) ttACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGt < 2:713034/150‑1 (MQ=255) ttACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGt > 2:1342602/1‑150 (MQ=255) aCATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACt < 2:433176/151‑1 (MQ=255) aCATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACt < 1:592849/151‑1 (MQ=255) cGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCtcat < 2:327026/151‑1 (MQ=255) agaaTTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAg < 2:1230309/151‑1 (MQ=255) aaTTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCt < 1:1187786/151‑1 (MQ=255) aaTTGACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCt > 2:73823/1‑151 (MQ=255) gACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTa < 2:989800/150‑1 (MQ=255) gACCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTa < 2:1076693/150‑1 (MQ=255) aCCATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtc < 2:1204411/151‑1 (MQ=255) ccATTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtct > 1:326795/1‑151 (MQ=255) aTTTTGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtcttc > 1:986797/1‑151 (MQ=255) ttttGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtcttct > 2:783811/1‑151 (MQ=255) ttGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtcttctt < 1:213175/150‑1 (MQ=255) tGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtcttcttct > 2:639710/1‑151 (MQ=255) tGTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtcttcttct > 2:321943/1‑151 (MQ=255) gTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTAtcttcttct < 1:485723/150‑1 (MQ=255) gTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATcttcttctt < 2:1397680/151‑1 (MQ=255) gTCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATcttcttctt < 1:1052974/151‑1 (MQ=255) tCCTGTTGCGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATCTTCTTCttt > 2:887473/1‑151 (MQ=255) tgttgcGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATCTTCTTCTTTGGc > 2:673028/1‑151 (MQ=255) gttgcGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATCTTCTTCTTTGGc < 1:665378/150‑1 (MQ=255) | CCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACGAAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTTTATCTTCTTCTTTGGC > NC_000913/2629090‑2629382 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |