Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 4,284,437 | (CCA)4→3 | coding (464‑466/1650 nt) | actP ← | acetate transporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4284431 = | 1 (0.020) | 42 (1.110) | 39/280 | 0.1 | 97.7% | coding (472/1650 nt) | actP | acetate transporter |
? | NC_000913 | = 4284427 | 1 (0.030) | coding (476/1650 nt) | actP | acetate transporter |
TTACTCGCTGGGCTTCCTGGTGGGCTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4284588‑4284431 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggtggtggCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTGGCGACCAC < NC_000913/4284427‑4284289 TTACTCGCTGGGCTTCCTGGTGGGCTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCT < 2:289779/150‑1 TACTCGCTGGGCTTCCTGGTGGGCTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGG > 1:350641/1‑151 TGGGCTTCCTGGTGGGCTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGC > 2:416118/1‑151 TCCTGGTGGGCTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTT > 1:129845/1‑150 CTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCC > 1:17963/1‑151 TGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCC > 2:271261/1‑151 CATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTG > 1:538938/1‑151 TTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGC > 1:371210/1‑149 TTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACT > 2:623568/1‑151 CCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGAT > 1:96564/1‑151 CCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGAT > 1:236520/1‑151 CTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGCGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGC > 1:460774/1‑148 GCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTG < 1:207058/148‑1 AACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTG < 2:75418/151‑1 AACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTT < 1:245154/150‑1 ACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGG > 1:335616/1‑151 GGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTA < 1:288284/151‑1 GCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAAC < 2:86385/151‑1 TACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGGGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATC > 2:393244/1‑151 ACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTAT < 1:560570/149‑1 CACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCAC < 2:253019/151‑1 CCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACA < 1:299092/150‑1 TTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTAATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTG > 2:367690/1‑151 TTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATT < 2:324085/149‑1 GCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGG > 2:399133/1‑151 CGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTG < 2:248555/151‑1 GATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGG > 2:569775/1‑151 GGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTG > 1:337024/1‑151 ACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTACCTATCACATTGCGGTGGTGTTGGTCG > 2:217028/1‑147 ACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCG < 1:572440/150‑1 CCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTG < 2:225995/151‑1 ACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATG < 2:388154/151‑1 CAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATG > 1:117564/1‑150 GGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTA < 1:395510/151‑1 ATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCC > 2:458628/1‑151 CGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGT > 2:330347/1‑151 CGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGT > 1:553362/1‑151 GGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATG > 1:422397/1‑151 CCTGTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCT < 2:335609/151‑1 GTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTGGC > 1:59882/1‑151 GTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTG < 2:142535/149‑1 GTGGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTG < 1:99385/149‑1 GGTTCTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTGGCGA < 2:129842/151‑1 CTCTGGTGGTGGCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTGGCGACCAC > 1:22385/1‑151 TTACTCGCTGGGCTTCCTGGTGGGCTGGCCGATCATTTTGTTCCTGATTGCCGAACGTCTGCGTAACCTGGGGCGCTACACCTTTGCCGATGTGGCCTCTTACCGTCTGAAACAAGGGCCGATTCGTATTCTTTCGGCCTGTGGTTCTCTGGTGGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4284588‑4284431 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggtggtggCGCTTTACCTTATCGCCCAGATGGTGGGCGCAGGTAAACTGATCGAGCTGCTGTTTGGCCTTAACTATCACATTGCGGTGGTGCTGGTCGGCGTGCTGATGATGATGTACGTCCTGTTCGGCGGCATGCTGGCGACCAC < NC_000913/4284427‑4284289 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |