Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 944,912 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+16/+14) | dmsC → / ← ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | 139 (0.920) | 109/292 | 0.3 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | 944912 = | 0 (0.000) | intergenic (+16/+19) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608160‑608008 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCTGATAACC < NC_000913/944917‑944774 GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 4:1648846/151‑1 GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 4:293350/1‑151 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2:29284/1‑151 CATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGG > 4:1495720/1‑151 TACGTGCCGAAGCATCCAGTTCTTCGTGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATTGTGAGAGCAATTCATCGGGACGTTAAATCATATCAGGCGTAGTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTT > 1:158241/1‑150 ACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTG < 4:514174/150‑1 CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTT < 4:756320/151‑1 CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTT > 1:1684708/1‑151 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3:38651/151‑1 CAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGA < 1:1305048/150‑1 AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGAT > 4:1407478/1‑150 GGCGTAATTCCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATA < 1:1165060/150‑1 GGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATAC < 4:828065/151‑1 GGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATAC > 2:524155/1‑151 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGA < 4:1368460/151‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATAC > 4:394607/1‑148 TACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGT > 4:1575604/1‑151 TACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAG > 1:1802419/1‑150 CCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGT > 1:765960/1‑149 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAA < 2:44981/151‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACC > 4:47117/1‑151 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACC > 3:540040/1‑151 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCG > 2:239081/1‑151 TTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGC > 4:1759140/1‑151 AAGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCA < 2:473388/150‑1 AGTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGG > 4:294552/1‑151 GTTAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGC > 4:946397/1‑151 TAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCT < 1:1184887/150‑1 TAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCT < 4:704073/150‑1 TAGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCT < 4:525586/150‑1 AGCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCTGA < 2:117178/151‑1 GCGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCTGAT < 4:1790631/151‑1 CGCTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGTCTGATA < 4:206886/151‑1 CTTATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCTGATAA < 1:266361/150‑1 TATGGGCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCTGATAACC < 2:79878/150‑1 GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608160‑608008 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCGAAACCCCGGTTGTTATGATTAGCTTGCGACGGCCATCCCCACGGTCATATGCAAACCATAGAATACGCCGCGACCGATTAATTCCCCTGCCAGAAGCAGAATGAATGATACAGAAAGTAGCGGAACCGCAGGCTGATAACC < NC_000913/944917‑944774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |