Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 574,383 | G→A | intergenic (+44/+146) | quuD → / ← nmpC | DLP12 prophage; putative antitermination protein/DLP12 prophage; truncated outer membrane porin (pseudogene);IS, phage, Tn; Phage or Prophage Related; outer membrane porin protein; locus of qsr prophage |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 574,383 | 0 | G | A | 100.0% | 579.1 / NA | 147 | intergenic (+44/+146) | quuD/nmpC | DLP12 prophage; putative antitermination protein/DLP12 prophage; truncated outer membrane porin (pseudogene);IS, phage, Tn; Phage or Prophage Related; outer membrane porin protein; locus of qsr prophage |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (77/70); total (77/70) |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
ATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAATCAGAT > NC_000913/574236‑574529 | atatCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACg < 3:432553/151‑1 (MQ=255) tatCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGc > 1:47349/1‑151 (MQ=255) atCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGcc < 4:667795/151‑1 (MQ=255) tCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGccc > 1:174473/1‑151 (MQ=255) ggAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCa < 2:467754/151‑1 (MQ=255) ggAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCa < 1:947701/151‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCa > 2:346241/1‑150 (MQ=255) aaaaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCaaa < 4:1190325/151‑1 (MQ=255) aaaaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCaa > 2:21409/1‑150 (MQ=255) aaaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCaaaa < 1:858128/151‑1 (MQ=255) aaaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCaaa > 1:1848449/1‑150 (MQ=255) aaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCaaaaa < 4:1639200/151‑1 (MQ=255) aaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCaaaa > 4:678115/1‑150 (MQ=255) aaGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCACCCaaaaa < 4:592654/151‑1 (MQ=255) aCAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAgg > 4:378147/1‑151 (MQ=255) aGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAggg > 1:856692/1‑150 (MQ=255) aGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGt > 4:564576/1‑151 (MQ=255) aGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGt > 1:491037/1‑151 (MQ=255) gAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTa < 4:553417/151‑1 (MQ=255) aaGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTaa < 4:1878405/151‑1 (MQ=255) aGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAat > 2:420716/1‑151 (MQ=255) ggCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAata < 3:391843/151‑1 (MQ=255) tGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAatatat > 2:176700/1‑151 (MQ=255) tGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAatatat > 4:1042495/1‑151 (MQ=255) gAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAatatat > 1:605330/1‑150 (MQ=255) gAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAAtatata < 1:30840/151‑1 (MQ=255) aGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATaa < 4:368156/151‑1 (MQ=255) aGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATaa < 1:1778454/151‑1 (MQ=255) aaTTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAgg < 4:706418/151‑1 (MQ=255) aTTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGt > 1:919437/1‑151 (MQ=255) ttGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGtt > 1:1379446/1‑151 (MQ=255) tGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGttt > 4:1624724/1‑151 (MQ=255) tGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGtt > 4:937898/1‑151 (MQ=255) tGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGtt > 4:1902923/1‑151 (MQ=255) aaTGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGa < 1:776278/150‑1 (MQ=255) aaTGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGa < 1:1710417/150‑1 (MQ=255) aTGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAg < 2:358063/151‑1 (MQ=255) cATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCa > 1:1652416/1‑149 (MQ=255) aTTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAgg > 4:1913473/1‑151 (MQ=255) aTTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAgg < 4:1905177/151‑1 (MQ=255) ttAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAgg > 4:409244/1‑150 (MQ=255) aGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTtg < 1:391260/151‑1 (MQ=255) atatCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTtgtg < 1:1296915/151‑1 (MQ=255) atatCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTtgtg < 4:26045/151‑1 (MQ=255) tatCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGc > 1:1258192/1‑151 (MQ=255) atCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCt > 4:1508096/1‑151 (MQ=255) ccGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTc < 4:1839056/151‑1 (MQ=255) ggTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTa < 4:1508100/151‑1 (MQ=255) gagaTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAgg > 1:120735/1‑150 (MQ=255) agaTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGa > 4:823850/1‑150 (MQ=255) agaTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGa > 1:1537744/1‑150 (MQ=255) agaTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGa > 1:789919/1‑150 (MQ=255) aTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAg < 1:178918/150‑1 (MQ=255) ggATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTgg < 4:1849169/151‑1 (MQ=255) atCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTg > 3:450458/1‑151 (MQ=255) cGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTg > 4:1301686/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTg > 4:1638145/1‑149 (MQ=255) gttgttAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAgg < 1:918534/151‑1 (MQ=255) tgttAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAggg > 1:296135/1‑150 (MQ=255) gttAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAggg > 4:832646/1‑149 (MQ=255) gttAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGa < 1:1246836/150‑1 (MQ=255) taataaCTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGcc > 4:1101515/1‑151 (MQ=255) aataaCTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGcc > 4:12017/1‑150 (MQ=255) taaCTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACt > 4:383516/1‑151 (MQ=255) ctAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTatat > 4:343000/1‑151 (MQ=255) taattaatATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATg > 1:1008213/1‑151 (MQ=255) taattaatATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATg > 4:280815/1‑151 (MQ=255) attaatATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGtt > 2:384107/1‑151 (MQ=255) taatATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGtt > 4:439930/1‑149 (MQ=255) atatGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTgggg < 4:1361239/151‑1 (MQ=255) atGACAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTgggg > 3:331184/1‑149 (MQ=255) tGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAgg > 1:988292/1‑151 (MQ=255) gCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGc > 4:961948/1‑151 (MQ=255) ccAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCa < 1:1087354/151‑1 (MQ=255) aaTTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCaa > 1:103648/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGACAACg > 1:54854/1‑151 (MQ=255) aTTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTCGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAAc < 4:485748/150‑1 (MQ=255) ttGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACg < 4:528137/150‑1 (MQ=255) ttGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGc > 2:89850/1‑151 (MQ=255) tGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGc < 1:119619/150‑1 (MQ=255) tGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGc < 4:605583/150‑1 (MQ=255) tACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTccc > 1:599180/1‑151 (MQ=255) aatAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATTAAGGGTAATATATAACAGGAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGGCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTccc > 1:562806/3‑150 (MQ=255) aaaaaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCa < 3:5500/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCa > 4:1336672/1‑150 (MQ=255) aaaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAAc > 2:521777/1‑150 (MQ=255) aaaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACa < 4:259910/151‑1 (MQ=255) aaaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACa < 1:211336/151‑1 (MQ=255) aaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACat < 4:1422602/151‑1 (MQ=255) aaTTATTAAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACat < 1:1478275/151‑1 (MQ=255) ttatt‑aAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGTCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACatat < 3:446923/150‑1 (MQ=255) taAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCttt > 4:1294277/1‑151 (MQ=255) taAAAATGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCttt > 3:177072/1‑151 (MQ=255) aaTGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCg > 1:1715469/1‑151 (MQ=255) aTGGGGCGTTGCAACGCCCCCCAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGt < 4:744243/151‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGt < 1:1867252/151‑1 (MQ=255) gggCGTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAAt < 4:1430829/151‑1 (MQ=255) gTTGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAATCAGa < 1:1368003/151‑1 (MQ=255) tGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAGTCAGAt < 1:867881/150‑1 (MQ=255) tGAAACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAATCAGAt < 4:1071860/150‑1 (MQ=255) | ATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAATCAGAT > NC_000913/574236‑574529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |