| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 121,578 | (T)7→6 | intergenic (‑27/‑514) | aroP ← / → pdhR | aromatic amino acid transporter/pyruvate dehydrogenase complex repressor; autorepressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 121,572 | 0 | T | . | 88.0% | 496.3 / 45.5 | 133 | intergenic (‑21/‑520) | aroP/pdhR | aromatic amino acid transporter/pyruvate dehydrogenase complex repressor; autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/0); new base . (45/72); total (61/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CGGACTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTGTTTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATGCACCCGCTT > NC_000913/121422‑121717 | ggACTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGgttgtt < 1:1142537/151‑1 (MQ=255) gACTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAAGGCCCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGGTGTTGACCCTTCATCATGAAAACTCGTGCGGGGGGTGttt > 4:354820/1‑151 (MQ=255) aTTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTGttttttgat < 1:55559/151‑4 (MQ=255) aTTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAAACCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGCGCTGTTTACCTTCCATCATGAAACCTCCTGCGGGGGGTGgttttt > 4:284876/1‑148 (MQ=255) aCGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTa < 3:596327/151‑1 (MQ=255) aGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCa < 4:327605/151‑1 (MQ=255) aGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCa < 1:1363285/151‑1 (MQ=255) aGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCa < 2:1166080/151‑1 (MQ=255) aCCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGAt < 2:1604543/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGAt < 2:1453872/149‑1 (MQ=255) ccAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCgt < 2:1562701/151‑1 (MQ=255) ccAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGACGCgt < 3:562339/151‑1 (MQ=255) aGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTTAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGGCCTTCCCTCATGAAAACCCCTGCGGGGGGTGTTTTTTT‑ATCTACGCCGTGGTGCg > 2:1337589/1‑148 (MQ=255) aaTAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTa < 1:215987/151‑1 (MQ=255) aaTAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAAGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGGGGGTGTTTTTTT‑ATCTACGCAGTGATGCgtgtgt > 2:99459/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGGGGGTGTTTTTTT‑ATCTACGCAGTGATGCGTGTGTaa > 3:251596/1‑149 (MQ=255) cGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTg < 1:589685/150‑1 (MQ=255) ggTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCa < 2:714223/151‑1 (MQ=255) ggTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCa < 2:1568878/151‑1 (MQ=255) gTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCaa < 3:228391/151‑1 (MQ=255) gTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCaa < 2:898978/151‑1 (MQ=255) cccTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAAtt < 1:597282/151‑1 (MQ=255) aTCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTcc < 3:322338/149‑1 (MQ=255) aTCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGt < 1:1661983/151‑1 (MQ=255) aTCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGt < 1:1336840/151‑1 (MQ=255) aTCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGt < 1:560204/151‑1 (MQ=255) cgcgCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGttt < 3:192029/151‑1 (MQ=255) cgcgCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGttt < 3:434713/151‑1 (MQ=255) cgcgCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAAGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGGGCTGTTGACCTTCCCTCATGAAACCTCGTGCGGGGGTTGTTTTTTT‑ATCTACGCAGTGATGCGGGTGTAAGTTTGCAATTCCGttt > 2:1535877/1‑151 (MQ=255) gcgcCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTTAGGGCGCGCTTTTTCTGCCCGCCGTGCTGTTTACCTTCCATTATGAAAACTCGTGCGGTGGTTGTTTTTTT‑TTCTACGCCGTGTTGCGTGTGTAAGGTTTTAAATCCGttt > 4:390614/1‑150 (MQ=255) gcgcCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGGTTTTTAGGCCCCGCTTTAGCTGCCCGCCGTGGTGGTGGGCTTCCATCATGAAAACTCCTGCGGTGGTTGTTTTTTT‑ATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGATTGCAATTCCGt > 2:1581003/1‑148 (MQ=255) gcCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTttgtt < 1:495752/151‑1 (MQ=255) aCCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTa < 1:1423979/151‑1 (MQ=255) aCCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAAGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTTACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGGGGGTGTTTTTTT‑ATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTtgttgt > 2:793113/1‑150 (MQ=255) cccAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTAt < 1:1414067/151‑1 (MQ=255) cAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTTAGGCCCCGCTTTAGCTGCCCGCCGTGCTGTTGTCCTTCCCTCATGAAACCTCGTGCGGTGGGTGTTTTTTT‑ATTTTCGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTAtt > 1:648371/1‑150 (MQ=255) gcgcGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAAt < 1:1164470/151‑1 (MQ=255) gcgcGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAAGCCGCGCTTTTGCTGCTCGCCCGGCTGTTGACCTTCCATCATGAAAACTCGGGCGGTGGGTGTTTTTTT‑ATCTACGCCGTGATGCGGGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTaa > 3:142271/1‑150 (MQ=255) cgATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTg < 2:899158/151‑1 (MQ=255) gATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGt < 4:444811/151‑1 (MQ=255) tAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGGCGCGCTTTTGATGGTCGCCGTGCTGTTGGCCCTCCCTCATGAAAACTCCTGCGGGGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCCGTGGAGGGGGTGTTAGTTTGGAAATTCCTTTTTTGTATTAATtttttt > 2:1278225/1‑151 (MQ=255) aaGCTGAATATGGCGGTTTTTTAAGTCGCCGGTTAGCTGCCCGCCGCTCTGTTGACCTTTCCTCATAAAAACTCTGGTGGGGGGTGTTTTTTT‑TTCTAATTAGGGATGAGTGTGGAAGGTTGCAATTCAGTTTTTTTTATTAATtttttt > 1:1711040/1‑150 (MQ=255) gCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACa < 1:1597763/151‑1 (MQ=255) cTGAATATGGCGGTTTTTTAAGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCCTCATGAAAACTCGTGCGGGGGGTGTTTTTTT‑TTCTACGCAGTGATGCGTGTGGAAGTTTTCAATTTCGTTTGTTGTATTAATtttttt > 1:1103577/1‑147 (MQ=255) cTGAATATGGCGGTTTTTTAAGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCCTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGGGGGTG‑TTTTTTGATCTTCGCAGGGGTGCGTGTGTAAGTTTGCCATTCCGTTTTTTGTATTAATtttttttc > 1:1020989/1‑147 (MQ=255) atatGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCaaa < 4:555768/151‑1 (MQ=255) atatGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCaaa < 2:1348367/151‑1 (MQ=255) atatGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCaa > 1:1709070/1‑150 (MQ=255) tatGGCGGTTTTTTAGGCCGCGCTTTAACTGCTCGCCGTTCTGTTGTCCTTCCATCATGAAAACTCGTTGGGGGGGTGTTTTTTT‑TTCTATGCAGTGATGCGGGGGTTAGGTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCaa > 1:280962/1‑149 (MQ=255) atGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAaag < 2:302531/150‑1 (MQ=255) atGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAaag < 1:1086482/150‑1 (MQ=255) atGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAaag < 2:1324271/150‑1 (MQ=255) gCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGt > 2:1245397/1‑151 (MQ=255) gTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTg > 1:395301/1‑151 (MQ=255) ttttAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGa < 2:706753/150‑1 (MQ=255) tttAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAATTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAAt > 2:1716616/1‑151 (MQ=255) tttAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAAt > 1:1501394/1‑151 (MQ=255) tAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTg > 4:161634/1‑151 (MQ=255) tAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTg > 1:906717/1‑151 (MQ=255) aaGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGt > 2:129668/1‑151 (MQ=255) aaGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGt > 2:504829/1‑151 (MQ=255) gCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTAc > 3:292493/1‑151 (MQ=255) gCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTAc < 2:1523901/151‑1 (MQ=255) gCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTAc > 1:499976/1‑151 (MQ=255) gcgcTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACaa > 2:386843/1‑150 (MQ=255) gcTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACaaaaa < 1:915412/151‑1 (MQ=255) cTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACaaaa > 1:888272/1‑149 (MQ=255) tAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACt > 2:1673607/1‑151 (MQ=255) tAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACt > 2:284473/1‑151 (MQ=255) ctgctCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTcc > 1:1462181/1‑151 (MQ=255) tgctCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTTGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCg > 4:242147/1‑151 (MQ=255) tgctCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGGAAGTTTGCAATTCTGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAGGACTTCCg > 2:636248/1‑151 (MQ=255) gctCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCg < 1:330770/150‑1 (MQ=255) gctCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGACGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGt > 2:1708308/1‑151 (MQ=255) ctCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTcc < 2:1114828/148‑1 (MQ=255) cGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAg < 3:34000/151‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCa < 1:1561951/151‑1 (MQ=255) tGCTGTTGTCCTTCCATCATGAAAACTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATTTACGCATTTATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCa < 4:45509/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGAGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCa > 1:602463/1‑149 (MQ=255) cTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCa > 1:1025442/1‑148 (MQ=255) gTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGaat < 4:273327/151‑1 (MQ=255) gACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGaataat > 2:1313614/1‑151 (MQ=255) tCCATCATGAACCCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATGATGGTAt > 1:986945/1‑151 (MQ=255) ccATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTAt < 1:826117/150‑1 (MQ=255) ccATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATg < 1:1239473/151‑1 (MQ=255) atcatGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCg > 2:986373/1‑151 (MQ=255) catGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCgg < 2:524941/150‑1 (MQ=255) catGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCgg < 1:1587360/150‑1 (MQ=255) atGAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCa < 4:312295/151‑1 (MQ=255) gAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAg < 2:1501556/150‑1 (MQ=255) gAAACCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGc > 1:182015/1‑151 (MQ=255) aaaCCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCg < 1:253853/151‑1 (MQ=255) aCCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGaa < 4:589390/151‑1 (MQ=255) aCCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGaa < 2:1391078/151‑1 (MQ=255) aCCTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGaa < 1:467358/151‑1 (MQ=255) cTCGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATg > 2:1185106/1‑151 (MQ=255) cGTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATGc < 4:38199/150‑1 (MQ=255) gTGCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATGCAc > 2:776248/1‑151 (MQ=255) gCGGTGGTTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATGCAccc < 3:454091/151‑1 (MQ=255) tggtTG‑TTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATGCACCCGCtt > 1:1030986/1‑151 (MQ=255) | CGGACTGTATTACGGAGGCGCTACCCAGGAATAACCCGGTCCCTATCGCGCCACCCAGCGCGATAAGCTGAATATGGCGGTTTTTAAGGCCGCGCTTTAGCTGCTCGCCGTGCTGTTGACCTTCCATCATGAAACCTCGTGCGGTGGTTGTTTTTTTGATCTACGCAGTGATGCGTGTGTAAGTTTGCAATTCCGTTTGTTGTATTAATTTGTTTACATCAAAGAAGTTTGAATTGTTACAAAAAGACTTCCGTCAGATCAAGAATAATGGTATGCGGCAGCGAATGCACCCGCTT > NC_000913/121422‑121717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |