Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 298,960 | 0 | A | C | 40.9% | 183.5 / 51.3 | 115 | Y659D (TAT→GAT) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/15); new base C (0/47); total (53/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-19 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GTTATACACCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACAC > NC_000913/298811‑299107 | gTTATACACCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑c > 2:524545/1‑151 (MQ=255) ttATACACCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑cc > 1:539313/1‑151 (MQ=255) ataCACCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑cccc < 1:1392238/151‑1 (MQ=255) acacCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCg < 3:297855/150‑1 (MQ=255) acCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGcc > 1:610253/1‑150 (MQ=255) acCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCa < 3:235613/151‑1 (MQ=255) cgTTGGCGATAGCCGCTCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCatat < 1:977401/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCg > 2:25921/1‑151 (MQ=255) ggCGATACCCGCGCTCCCGCCGCACAGGCCCACCTCCCCGACCCCTTTGCCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAC‑CCAGA‑AAAACCCCCTCCTTTTTTGGG‑ATACCCGC‑ATG‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGt < 4:391200/149‑1 (MQ=255) cGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGAtt > 1:292418/1‑151 (MQ=255) ccGCGCTCTCGCCGCACAGCCCCGGCCCACCGACACCTTTGCCCTCCACGGGGGAGGAGATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGA‑AAAACCCCCCCTTTTTTTGGA‑ATATCCAC‑ATC‑ACCCGG‑CACATCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGa < 4:471879/150‑1 (MQ=255) ccGCCCTCACGCCGCACGGGCCCAGCTCCCCGACCCCTTTGGCTTTCAGCGGGGAGGATATGGGGTCGGAATCAC‑CCAGA‑AAAACCCCCTCCTGTTTGGGA‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGC‑CCCCTCAGA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACg < 1:947087/149‑1 (MQ=255) cgcgCTCACGCCTCACAGGCCCACCCCCCCGACCCCTTTGGCCTCCCTGGGGGAGAATAGGGGGTCGTTACCCC‑CGAGA‑AAAATCCCCTCTTTTTTTGGG‑ATATCCAC‑GTG‑CTCCGG‑CACCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAg < 1:1255802/151‑1 (MQ=255) tCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGcc > 2:1399286/1‑151 (MQ=255) cACGCCGCACAGGCCCAGCTCCCCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTGGGTATCAC‑CCAGA‑AAAATCCCCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGccc < 3:162575/151‑1 (MQ=255) cgccgcACAGGCCCAGCTCCCCGCCCCCTTGGGCCTTCATGGGGGAGGATAGGGGGTGGGTATCAC‑CCAGG‑AAAATCCCCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑AGA‑ACCCGG‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGc < 2:1152506/147‑1 (MQ=255) cgcACAGGCCCAGCTCCCCGACCCCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGA‑AAAATCCCCTCCTGTTTTGGG‑ATACCCGC‑ATG‑AACCGG‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACg < 2:730585/151‑1 (MQ=255) cgcACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACg > 1:245725/1‑151 (MQ=255) 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gACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGctcc > 1:678702/1‑151 (MQ=255) cccttttGGCCTCCGGGGGGAAGTATAGGGGCTGGTTACCAC‑CCAGA‑AAAACCCCCTCCTTTTGGGGG‑ATACCCGA‑TTA‑ACCCGC‑CCCCCCACC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGct < 1:917944/143‑1 (MQ=255) cacCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGctcctc > 1:823292/1‑151 (MQ=255) acCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCtcctcc > 1:228361/1‑151 (MQ=255) gcccTTCACGGGGGGGAATTGGGGGTCGTTATCA‑‑CCAAG‑AAAAACCCCCCCTTTTTTGGGAATTCCCGC‑ATG‑ACCGGC‑CCCCTAATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCa < 1:1721144/147‑1 (MQ=255) ctttCATGGGGGAGAATAGGGGGTCGTTATCAT‑CCAGA‑AAAACCCCCCCTTGTTTGGGA‑ATACCCGC‑AGA‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTg < 3:424648/148‑1 (MQ=255) tCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCcgc > 1:294791/1‑151 (MQ=255) cATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCcgcg > 2:1525208/1‑151 (MQ=255) tCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCgcc > 1:1606494/1‑151 (MQ=255) ggggAGTATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGA‑AAAACCCCCTCCTTTTTTGGG‑ATTCCCGC‑ATA‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCgccc < 2:243364/150‑1 (MQ=255) 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tatGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCgcccatgcccat > 2:1415512/1‑150 (MQ=255) gggggCCGTTATCAC‑CCA‑G‑AAAATCCCCCCCCTTTTTGGGAATACCCGA‑AT‑‑AACCGGCCCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCgcccatgcccat < 2:17611/147‑1 (MQ=255) ggggTCGTTATCAC‑CCAGA‑AAAACCCCCCCCTTTTTTGGG‑ATACCCGC‑ATA‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGt < 2:1055188/150‑1 (MQ=255) ggggTCGGTATCAC‑CCAGA‑AAAACCCCCTCCTTTTTGGGG‑ATACCCGA‑ATG‑ACCCGG‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCgcccatgccca < 2:202758/146‑1 (MQ=255) ggggTCGGTACCTT‑CAAGA‑AAAACCCCCCCCTGTTTTGGG‑ATACCCGC‑ATG‑ACCCGA‑CCCCTCGTC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGt < 3:433123/150‑1 (MQ=255) 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aCCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTgcgcg > 2:448034/1‑151 (MQ=255) aCCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTgcgcg > 1:1428608/1‑151 (MQ=255) ctcctGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTgcgcgc > 2:154504/1‑150 (MQ=255) tcctGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTgcgcgc > 3:486195/1‑149 (MQ=255) cctGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGt > 2:1164669/1‑151 (MQ=255) cttttttGGGAATACCCGC‑AGA‑ACCCGC‑CCCCTAACC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCa < 1:1124178/146‑1 (MQ=255) tGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGttt > 2:151894/1‑151 (MQ=255) tGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGttt > 2:1228154/1‑151 (MQ=255) ttttGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTc > 1:636353/1‑151 (MQ=255) ggg‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGAt > 3:246092/1‑151 (MQ=255) ggaatccccGA‑ATG‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGAt < 2:1662304/144‑1 (MQ=255) tttCCGC‑AGA‑ACCCGC‑CCCCTCTTC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCa < 2:321968/148‑1 (MQ=255) tacccGA‑ATG‑ACCCGG‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCa < 2:826860/147‑1 (MQ=255) acccGC‑GTG‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTc < 1:1303812/146‑1 (MQ=255) tCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAgg > 2:668095/1‑150 (MQ=255) ccGC‑ATG‑ACCCGC‑CCCCTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGAt < 3:195649/151‑1 (MQ=255) ccGC‑ATA‑ACCCGC‑CCCCTCACC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAgg < 4:26404/149‑1 (MQ=255) cGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGGCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCGGGCTg > 1:836430/1‑151 (MQ=255) c‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCg > 2:804859/1‑151 (MQ=255) acaagccccGG‑CCCCTCACC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGc < 1:25918/144‑1 (MQ=255) agaCCGG‑CCCCCCAAACCCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGc < 2:1050126/146‑1 (MQ=255) aaCCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCt > 3:204202/1‑151 (MQ=255) acccgcccccccATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTcc < 1:380032/139‑1 (MQ=255) cGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTgc > 1:1619396/1‑150 (MQ=255) ccccTCATC‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTgca < 3:77976/146‑1 (MQ=255) cATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGcacacac > 1:1503096/1‑151 (MQ=255) aTA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGcacacac > 2:1596769/1‑150 (MQ=255) | GTTATACACCGCGTTGGCGATAGCCGCGCTCACGCCGCACAGGCCCAGCTCACCGACACCTTTGGCCTTCATCGGGGAGGATATGGGGTCGGTATCAT‑CCAGG‑AAAATCACCTCCTGTTTTGGG‑ATATCCGC‑ATG‑AACCGG‑CACCTCATA‑CCCCGCCATATCGTGATTAACGAAGTAGCCCAAACGGTCATCCACCGCCAGCTCCTCCATCAGTGCCGCGCCCATGCCCATAGTCATTGCGCCAATGACCTGGCTGCGCGCAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACAC > NC_000913/298811‑299107 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |