| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,336,738 | T→C | I303T (ATT→ACT) | acnA → | aconitate hydratase 1; aconitase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,336,738 | 0 | T | C | 99.2% | 467.3 / ‑4.1 | 125 | I303T (ATT→ACT) | acnA | aconitate hydratase 1; aconitase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (66/58); total (67/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCATGTGGCGTA > NC_000913/1336594‑1336884 | ccGAAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCa < 2:293992/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAat > 2:1473941/1‑150 (MQ=255) ggAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAACTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAat > 1:862064/1‑150 (MQ=255) aaaaTTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAatat < 2:782396/150‑1 (MQ=255) aaaaTTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAatat > 1:1446851/1‑150 (MQ=255) aaTTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTc > 4:473979/1‑151 (MQ=255) tACGTGAAGGTATTGCCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGc < 2:298370/150‑1 (MQ=255) tACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGcc > 2:1195710/1‑151 (MQ=255) tACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGcc > 1:872641/1‑151 (MQ=255) aCGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCa < 2:935500/151‑1 (MQ=255) cGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGcc > 2:153072/1‑149 (MQ=255) cGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCa < 2:1313003/150‑1 (MQ=255) gTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAg < 4:250373/150‑1 (MQ=255) aGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAatat < 3:478964/151‑1 (MQ=255) ggTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATg > 2:47493/1‑151 (MQ=255) gTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATgg < 2:390715/151‑1 (MQ=255) tACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGcc > 2:884183/1‑151 (MQ=255) ccACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCtg < 4:53994/151‑1 (MQ=255) cacaGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCtgt < 1:1056366/151‑1 (MQ=255) cacaGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCtgt > 1:1551723/1‑151 (MQ=255) cacaGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCtg > 1:1165252/1‑150 (MQ=255) caGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTgg > 2:840979/1‑151 (MQ=255) caGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTgg < 4:30701/151‑1 (MQ=255) caGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTgg < 1:715941/151‑1 (MQ=255) aGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGc > 3:218127/1‑151 (MQ=255) aCCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGctt > 2:1608482/1‑151 (MQ=255) aCCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGctt < 1:1218629/151‑1 (MQ=255) ccTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGcttc > 2:1728679/1‑151 (MQ=255) ccTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGcttc > 2:1406641/1‑151 (MQ=255) ggTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCttcttc > 3:549561/1‑151 (MQ=255) gTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTcc < 1:1657096/151‑1 (MQ=255) ttCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTccc > 2:1556316/1‑151 (MQ=255) cACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATc > 1:618207/1‑151 (MQ=255) aCTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCg > 1:700861/1‑151 (MQ=255) tGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGAt > 2:680413/1‑151 (MQ=255) tACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCt > 2:1009140/1‑151 (MQ=255) tACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCt > 1:1372899/1‑151 (MQ=255) cccAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGt < 4:65365/151‑1 (MQ=255) cccAAATGCTGCGCAAACAGGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGt < 1:1329887/151‑1 (MQ=255) cAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTa > 1:1570798/1‑150 (MQ=255) tgcGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCg > 2:1384951/1‑150 (MQ=255) tgcGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCg > 2:1501986/1‑150 (MQ=255) gcgcAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGa < 1:29520/150‑1 (MQ=255) cgcAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGAtt > 1:695649/1‑151 (MQ=255) aaaCATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTa > 1:1735260/1‑149 (MQ=255) cATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGc > 2:1013127/1‑151 (MQ=255) ggCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGtt < 4:330783/151‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTATCCCTCGATTACATGCGttt < 1:225985/151‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGttt < 2:1507463/151‑1 (MQ=255) gtggtgGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTaa < 2:588066/151‑1 (MQ=255) gtggGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCg > 2:654959/1‑151 (MQ=255) tggGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCgg > 1:1672457/1‑151 (MQ=255) ggAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGgcg < 4:540965/151‑1 (MQ=255) aaaTTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGgcgc > 1:1112586/1‑150 (MQ=255) cgtcgAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGaa < 4:133817/151‑1 (MQ=255) cgtcgAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa > 2:941393/1‑150 (MQ=255) cgtcgAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa < 2:774446/150‑1 (MQ=255) gtcgAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa > 2:1156485/1‑149 (MQ=255) cgAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGa > 2:100950/1‑147 (MQ=255) gAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGgc > 2:1117369/1‑139 (MQ=255) gAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGgc < 1:1117235/139‑1 (MQ=255) aaTTTTATGGTGATGGTCTGGTTTCACTACGGTGGGCGGACCGCGCCACCACTGCCAATATGTTGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATc < 1:1256647/150‑1 (MQ=255) aaTTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCa < 4:358360/151‑1 (MQ=255) ttATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTc > 3:275496/1‑151 (MQ=255) tATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTc < 2:1570959/150‑1 (MQ=255) tATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCg > 3:436312/1‑151 (MQ=255) ggTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAg < 1:47484/150‑1 (MQ=255) gTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGtt < 2:863485/151‑1 (MQ=255) gATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTg < 1:1328785/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCg < 4:437156/151‑1 (MQ=255) ggTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCg < 1:1188113/151‑1 (MQ=255) gTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCg > 3:77447/1‑150 (MQ=255) gTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGa < 2:1443209/151‑1 (MQ=255) tCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGa > 1:243907/1‑150 (MQ=255) cTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATCTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGTGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGaa > 1:216693/1‑150 (MQ=255) ggATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGaaaaa < 3:48121/151‑1 (MQ=255) ggATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGaaaaa < 1:1219033/151‑1 (MQ=255) ggATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGaaaa > 4:104214/1‑150 (MQ=255) ggATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGaaaa > 4:553944/1‑150 (MQ=255) ggATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGaa < 3:192396/148‑1 (MQ=255) aTTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAat > 2:1058890/1‑150 (MQ=255) aTTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAat > 4:466813/1‑150 (MQ=255) tCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAatat < 2:1232999/150‑1 (MQ=255) cACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGc > 2:453254/1‑151 (MQ=255) aCCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCaaa < 2:1276471/151‑1 (MQ=255) aCCGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCaaa < 2:1149559/151‑1 (MQ=255) ccGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAg < 2:630184/151‑1 (MQ=255) cGTTGGCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAg > 1:169186/1‑150 (MQ=255) ggCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAg < 1:153045/151‑1 (MQ=255) gCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAgg < 3:466830/151‑1 (MQ=255) gCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAgg < 2:290968/151‑1 (MQ=255) gCGGATCGCGCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAgg > 1:499162/1‑151 (MQ=255) ggATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGc > 2:741824/1‑151 (MQ=255) cgcgCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCAtgt > 2:1065409/1‑151 (MQ=255) cgcgCCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCAtg > 1:1093976/1‑150 (MQ=255) gcgcCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCAtgtg < 2:548576/151‑1 (MQ=255) gcCACCACTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCATGTGGc < 1:221368/151‑1 (MQ=255) accaCTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCATGTGGCGTa < 1:384293/151‑1 (MQ=255) ccaCTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCATGTGGCGTa > 3:195160/1‑150 (MQ=255) ccaCTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCATGTGGCGTa > 1:769158/1‑150 (MQ=255) | CCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACCTGGTTCTCACTGTTACCCAAATGCTGCGCAAACATGGCGTGGTGGGGAAATTCGTCGAATTTTATGGTGATGGTCTGGATTCACTACCGTTGGCGGATCGCGCCACCATTGCCAATATGTCGCCAGAATATGGTGCCACCTGTGGCTTCTTCCCAATCGATGCTGTAACCCTCGATTACATGCGTTTAAGCGGGCGCAGCGAAGATCAGGTCGAGTTGGTCGAAAAATATGCCAAAGCGCAGGGCATGTGGCGTA > NC_000913/1336594‑1336884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |