| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,136,954 | A→G | V97A (GTC→GCC) | wza ← | colanic acid export protein; outer membrane auxillary lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,136,954 | 0 | A | G | 99.2% | 426.3 / ‑4.4 | 122 | V97A (GTC→GCC) | wza | colanic acid export protein; outer membrane auxillary lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (71/50); total (71/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
ACTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGACGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCATTT > NC_000913/2136806‑2137101 | aCTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCg < 4:255824/151‑1 (MQ=255)aCTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCg < 4:426330/151‑1 (MQ=255) ggATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGAc > 2:883422/1‑151 (MQ=255) tCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTa < 2:1531692/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTa > 2:1701161/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAg < 1:656730/151‑1 (MQ=255) cAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCAGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTaa < 2:1151994/150‑1 (MQ=255) agcgagcgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGGGATCCCAGGCGGTGACATTa > 1:1675066/1‑148 (MQ=255) gagcgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACg > 1:682715/1‑151 (MQ=255) cgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTcc > 4:135327/1‑151 (MQ=255) cgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTAAAATTAAGAACGTc > 2:1605535/1‑150 (MQ=255) ttCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTccccc < 2:1139484/150‑1 (MQ=255) tCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCg < 1:866902/150‑1 (MQ=255) cGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGcgc < 2:39399/151‑3 (MQ=255) aCTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCg > 2:594603/1‑150 (MQ=255) aCTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCg > 2:1316883/1‑150 (MQ=255) cTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGACGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGa < 4:351224/150‑1 (MQ=255) aCGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGAcgc < 4:584631/151‑1 (MQ=255) cGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGAGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGAcgcg > 3:391161/1‑151 (MQ=255) tGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGActc < 1:1572825/148‑3 (MQ=255) cTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTgg > 1:1337346/1‑151 (MQ=255) tGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTgg < 2:249203/149‑1 (MQ=255) tGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGt > 2:1352253/1‑150 (MQ=255) ccGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAAt > 2:1187688/1‑151 (MQ=255) ccGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAAt > 3:3661/1‑151 (MQ=255) cGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTTAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGGGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACCCGATACTGGTAAtt > 1:576896/1‑151 (MQ=255) cGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAAtt > 2:1551862/1‑151 (MQ=255) cGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGGAAtt > 4:150984/1‑151 (MQ=255) atatACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGGGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcg > 2:1712618/1‑151 (MQ=255) tataCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGCGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcgc > 1:1374463/1‑151 (MQ=255) ataCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcgc < 2:1525570/150‑1 (MQ=255) taCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcgc > 4:281527/1‑149 (MQ=255) aCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGAt < 2:516964/151‑1 (MQ=255) gTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCa < 2:660759/151‑1 (MQ=255) gTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGCGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGAtctc > 2:196311/1‑150 (MQ=255) tAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCAc > 2:110461/1‑151 (MQ=255) tAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCAc > 1:137124/1‑151 (MQ=255) tAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCAc > 2:745237/1‑151 (MQ=255) aaaaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACt > 2:656892/1‑151 (MQ=255) aaaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACtt > 1:211863/1‑151 (MQ=255) aaaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACtt < 2:365317/151‑1 (MQ=255) aaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACttt > 4:260348/1‑151 (MQ=255) aaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACttt > 2:1342008/1‑151 (MQ=255) aCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACttt > 4:393865/1‑150 (MQ=255) aCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTc > 1:1710410/1‑151 (MQ=255) aTAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTcc > 3:240562/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGGGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATGCTGGTAATTCTCGATCTCACTTTCAAGc > 1:1228694/1‑151 (MQ=255) gCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGCGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCg > 2:195524/1‑149 (MQ=255) ccGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCa < 1:1659006/151‑1 (MQ=255) cGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCat > 2:1080054/1‑151 (MQ=255) gTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCata < 1:842121/151‑1 (MQ=255) cAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATAtt < 2:118475/151‑1 (MQ=255) aGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATAtt > 1:906863/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTg < 1:117582/151‑1 (MQ=255) tGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTgggg > 1:920122/1‑150 (MQ=255) tGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGgc > 3:38107/1‑151 (MQ=255) aCCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGT‑CCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGgcgcgc > 2:1593553/1‑151 (MQ=255) ccAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCt < 4:244840/151‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCt < 2:9887/151‑1 (MQ=255) cAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTa < 2:736090/151‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGGGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGAAACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGGCATATTgggg > 1:824360/1‑143 (MQ=255) gTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACa < 1:1195947/151‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGGAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACAtt > 2:279640/1‑151 (MQ=255) gCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACAtt < 1:883307/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTc < 1:1002360/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggc < 1:546832/151‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggc < 2:709758/151‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcg > 1:1539916/1‑151 (MQ=255) gtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgt > 1:796853/1‑151 (MQ=255) tCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgt > 1:1698557/1‑150 (MQ=255) tCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGATACATTCgggcgtg > 1:437693/1‑151 (MQ=255) cGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgg < 2:1343071/151‑1 (MQ=255) tGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGCTCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggcg > 3:422837/1‑151 (MQ=255) tGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggcg > 1:1190394/1‑151 (MQ=255) ggAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggcg > 1:1155880/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggc < 3:329680/149‑1 (MQ=255) gAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTa < 1:981598/151‑1 (MQ=255) tGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTg > 2:1000994/1‑151 (MQ=255) tGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTg > 2:541191/1‑151 (MQ=255) gCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAAtt < 1:1296973/149‑1 (MQ=255) gTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTc > 2:1487123/1‑150 (MQ=255) gACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCa < 2:682813/150‑1 (MQ=255) gACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAg < 2:1523872/151‑1 (MQ=255) gCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGcgcg > 1:271764/1‑151 (MQ=255) tGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCggg > 2:988278/1‑151 (MQ=255) gCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGt < 2:1680999/151‑1 (MQ=255) cGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTc > 3:552410/1‑151 (MQ=255) cGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTc < 1:745128/151‑1 (MQ=255) gtggtgAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTc > 4:246334/1‑150 (MQ=255) gtgAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCg < 1:1700995/151‑1 (MQ=255) gtgAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCg < 2:776779/151‑1 (MQ=255) tgAGTTCCGTGTGATCCCAGGCGGTGCGATTAAGAACGCCCCTGGAGCCGACGCGATACTGGTAATTGGCGATCTCTCTTCCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTGCATTCGGGCGTGGGGGTAATTGGGCAATGATGCGCggggcgag < 1:1557824/148‑5 (MQ=255) gAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCgg > 1:822038/1‑150 (MQ=255) gAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGa < 1:539400/151‑1 (MQ=255) aGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGAt < 2:814978/151‑1 (MQ=255) tCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATaa > 2:116810/1‑150 (MQ=255) gggTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCTTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTCGGCGAAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACAt < 1:1510476/151‑1 (MQ=255) aTCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCAcc > 1:395976/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCAtt > 2:653770/1‑151 (MQ=255) cAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCAttt < 3:155479/151‑1 (MQ=255) | ACTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGACGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCATTT > NC_000913/2136806‑2137101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |