Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,602,739 | A→G | T308A (ACC→GCC) | hyfB → | hydrogenase 4, membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,602,739 | 0 | A | G | 99.1% | 412.1 / ‑6.4 | 111 | T308A (ACC→GCC) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (62/47); total (62/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CCTGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTACCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTATTT > NC_000913/2602591‑2602885 | ccTGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGcc > 3:152506/1‑151 (MQ=255) tGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCg > 1:1694776/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCg > 2:96336/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACCGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCg > 1:1057907/1‑150 (MQ=255) aGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCACACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGGGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCg > 2:41718/1‑149 (MQ=255) gTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGaaa < 1:179275/151‑1 (MQ=255) tAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGaaa > 1:475321/1‑150 (MQ=255) cGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGt < 1:677050/151‑1 (MQ=255) 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aTCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCat > 1:469724/1‑151 (MQ=255) aTCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCat > 1:1078439/1‑151 (MQ=255) tgctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGAGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGGCGAAAACGGCGGCatta > 4:366746/1‑150 (MQ=255) gctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCattatt > 1:1168437/1‑151 (MQ=255) gctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCattat < 2:918574/150‑1 (MQ=255) gctgGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCatt < 1:511793/148‑1 (MQ=255) ggCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTAtttt < 2:32020/150‑1 (MQ=255) ggCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTAtttt < 1:183779/150‑1 (MQ=255) gcAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTg < 2:1386594/151‑1 (MQ=255) cAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTgg < 2:1302962/151‑1 (MQ=255) aaaCGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGc > 2:1468279/1‑151 (MQ=255) aaaCGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGc > 2:763777/1‑151 (MQ=255) aaCGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCa < 2:1295932/151‑1 (MQ=255) gggTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGt < 3:355337/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCg < 1:3709/151‑1 (MQ=255) ggTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCg < 1:1144124/151‑1 (MQ=255) gTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 4:206799/1‑151 (MQ=255) gTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 2:614129/1‑151 (MQ=255) tttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 2:1373455/1‑150 (MQ=255) tttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCgg > 1:1534703/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAATCGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAACCGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGgt < 1:379135/150‑1 (MQ=255) ttGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGgtg > 1:583067/1‑151 (MQ=255) tGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGgtgt > 3:215696/1‑151 (MQ=255) gCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGtgtg < 2:830011/151‑1 (MQ=255) ccTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTgg < 2:1047288/151‑1 (MQ=255) ccTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTgg > 1:255132/1‑151 (MQ=255) ctctGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTgg > 1:1415629/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCgct > 1:37177/1‑149 (MQ=255) ggtggGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTACTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATggt < 2:829615/151‑1 (MQ=255) ggggCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATggtcg < 2:1587580/150‑1 (MQ=255) 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aGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCa < 2:784725/151‑1 (MQ=255) ggATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCAt < 1:1205989/151‑1 (MQ=255) gATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATg < 1:1248604/151‑1 (MQ=255) atCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATgcgc > 3:588208/1‑151 (MQ=255) atCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATgcgc < 3:250512/151‑1 (MQ=255) aaaCGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGt > 3:210804/1‑151 (MQ=255) aaCGGCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGtt < 2:834129/151‑1 (MQ=255) tggCTGCTGGCCTAGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTc > 4:368100/2‑150 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGGAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGCTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGTGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTc > 1:1494159/1‑149 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCaa < 2:1028628/151‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCa > 2:1412549/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCa > 3:584343/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAgg > 2:17019/1‑151 (MQ=255) gctgGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAggg < 1:1652534/151‑1 (MQ=255) tgGCCTGGAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGgct > 3:528009/1‑151 (MQ=255) 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ggAGTGCCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTAtt > 2:189108/1‑151 (MQ=255) gAGTACCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGCCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTTTCACTCCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTCGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTAtta < 1:1142521/151‑2 (MQ=255) | CCTGAAAGTAGCGATGGATCTGCTGGCGCAAACGGGTTTGCCTCTGTGGTGGGGCATTCTGGTGATGGCGATCGGCGCAATCTCCGCGCTCCTGGGCGTGCTATATGCGCTGGCGGAACAGGATATCAAACGGCTGCTGGCCTGGAGTACCGTCGAAAACGTCGGCATTATTTTGCTGGCAGTCGGTGTGGCGATGGTCGGTCTGTCACTGCACGACCCGCTGCTCACCGTGGTTGGACTGCTCGGCGCACTGTTTCATCTGCTCAACCATGCGCTGTTCAAAGGGCTGCTATTT > NC_000913/2602591‑2602885 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |