| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 944,912 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+16/+14) | dmsC → / ← ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | 114 (0.980) | 93/292 | 0.2 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 944917 | 0 (0.000) | intergenic (+21/+14) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | 102 (0.880) | 83/292 | 0.5 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 944912 = | 0 (0.000) | intergenic (+16/+19) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C/putative isochorismatase family hydrolase | |||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
ACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGA > NC_000913/944764‑945061 | gtcatctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggttt > 1:372409‑M2/149‑151 (MQ=255)acaGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGttt > 4:1675525/1‑151 (MQ=255) catctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCg < 3:460982‑M2/5‑1 (MQ=255) tAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcc < 2:1607737‑M2/151‑3 (MQ=255) ctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGcc > 2:520869‑M2/144‑151 (MQ=255) agcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCgg > 3:200886‑M2/140‑151 (MQ=255) agcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCgg < 2:32291‑M2/12‑1 (MQ=255) gTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccata < 4:341661‑M2/149‑7 (MQ=255) tacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTtct > 4:729471‑M2/136‑151 (MQ=255) caggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTctct < 2:912180‑M2/18‑1 (MQ=255) ccTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaact > 2:1378682‑M2/1‑135 (MQ=255) tGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaact < 2:724271‑M2/149‑17 (MQ=255) gCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaactt > 3:103311‑M2/1‑132 (MQ=255) 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tCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtatta > 4:923242‑M2/1‑117 (MQ=255) cTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacg < 4:76281‑M2/151‑36 (MQ=255) cTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtatta < 4:214765‑M2/149‑34 (MQ=255) atccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACgt > 4:247733‑M2/111‑150 (MQ=255) gTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac > 4:781600‑M2/1‑114 (MQ=255) cctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCa < 2:988538‑M2/44‑1 (MQ=255) aTCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctg > 3:388874‑M2/1‑112 (MQ=255) attcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 4:696603‑M2/1‑109 (MQ=255) tcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 1:475943‑M2/150‑44 (MQ=255) tcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat > 4:1589751‑M2/1‑107 (MQ=255) tcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat > 1:384500‑M2/1‑107 (MQ=255) agcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTg > 2:1176343‑M2/102‑151 (MQ=255) cattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 2:813796‑M2/1‑106 (MQ=255) ttcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatt < 4:1065688‑M2/151‑48 (MQ=255) tcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt < 4:948607‑M2/151‑49 (MQ=255) 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ggATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagca > 1:107590‑M2/1‑41 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACg > 2:6257‑M2/34‑151 (MQ=255) cGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaa > 2:1064330‑M2/1‑34 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTc > 4:550253‑M2/28‑151 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTcgcg > 3:140969‑M2/25‑151 (MQ=255) 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aagttagcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGc < 3:325816‑M2/134‑1 (MQ=255) cATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggc > 1:303371‑M2/1‑20 (MQ=255) cATAACAACCGGGGTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggc < 2:899828‑M2/151‑132 (MQ=255) agcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGc > 3:114587‑M2/13‑150 (MQ=255) agcgcttatgggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGc > 2:928480‑M2/13‑150 (MQ=255) 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ggTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCg > 3:376862‑M2/3‑151 (MQ=255) gTTTCGGcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccggg < 2:854581‑M2/151‑145 (MQ=255) | ACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGA > NC_000913/944764‑945061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |