| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,340,559 | C→A | T95T (ACC→ACA) | yrbG → | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,340,559 | 0 | C | A | 99.2% | 520.5 / ‑4.2 | 134 | T95T (ACC→ACA) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (68/65); total (69/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GTATTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTT > NC_000913/3340411‑3340706 | gTATTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGt < 4:811152/151‑1 (MQ=255) aTTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTcc < 3:24687/151‑1 (MQ=255) ttGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTcc > 2:265477/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |