Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 379,275 | 0 | A | G | 99.1% | 417.0 / ‑4.4 | 110 | R99R (CGT→CGC) | frmA | alcohol dehydrogenase class III; glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (53/56); total (54/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAGGTTTGACGCTGGTTACGCCTTCACCGACTTCAACCACAACGCCGGCCCCTTCGTGACCGAGAACCACCGGGAATACACCTTCCGGGTCA > NC_000913/379128‑379422 | cgcgACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAGCg > 2:1651257/1‑150 (MQ=255) cgcgACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAGCGa < 2:1545783/151‑1 (MQ=255) tcgACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAGCGAc > 2:320237/2‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |