| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 981,315 | A→G | Y90C (TAT→TGT) | ldtD → | murein L,D‑transpeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 981,315 | 0 | A | G | 95.8% | 314.3 / ‑5.3 | 96 | Y90C (TAT→TGT) | ldtD | murein L,D‑transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (41/50); minor base T (4/0); total (46/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 | |||||||||||
GGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTATC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTT > NC_000913/981169‑981459 | ggTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCCGCCACTGCCTGAAAGGGC‑GGGAGAAAAAACCCGCACCCCAAACGAATTTCCATTACCCGCA‑GGGTACAAACCGGGTTGTC‑tt > 2:48684/1‑151 (MQ=255) gTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGGCCCGCCAATGCCTGAAGGGGG‑GGCAGAAAAAACCCCCACGCAAAACGAATCTCAATTAACCGCA‑GGGTACAAGCCGGGTTGTC‑tt > 2:373842/1‑150 (MQ=255) tGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCCATTCCTGAAGGGGC‑GGCAGAAAAAAACCGCACCCCAAACGAATCTCAATTAACCGCC‑GGGTACAAACCGGTTTGTC‑ttt > 4:596989/1‑149 (MQ=255) ggCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTaa < 2:850708/150‑1 (MQ=255) cTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCCGCCAGTGCCTGAAGGGGC‑GGGAGAAAAAACCCGCACGCAAATCGCATCTCAAATAACCCCAGGGTTAAAACCCGGTTT‑TC‑TTAAcc > 4:1060612/1‑150 (MQ=255) tGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTGCAGCCATTGCCTGAAGGGGC‑GGCAGAAAAAACCCGCACGCCAAATGAATCTCAATTACCCGCC‑GGGTAACAACCGGGTTGTC‑TTAACCa > 4:1167571/1‑150 (MQ=255) tGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAGCCAATGCCTCAAAGGGC‑GGCAGAAAAAACCCGCCCGCAAAACGAATATCCATTACCCCCC‑GGGTACAAAACGGTTTTTC‑TTaaac > 1:387909/1‑147 (MQ=255) gTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCa < 1:370915/149‑1 (MQ=255) cAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGGCCCACCAATGCCTGAAGGAGCGGGCGGAAAAAACCC‑CCCCCAAAACGAAACCCAATTAACCCCA‑GGGTGCAAAACGGGTTGTC‑tttaacaacct > 1:142065/1‑142 (MQ=255) cAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCt < 3:230728/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAGGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAAc < 4:1109027/151‑1 (MQ=255) aaCAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGACCCGCCACTTCCTGAAGGGGC‑GGGAGAAAAAACCCGCCCGCAAATAGAATTTCAATTACCCCCA‑GGGTACAAGCCGGGTTTTT‑TTAACCAGCTTCCAc > 1:394450/1‑150 (MQ=255) aCAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCCTTTCCTTAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCCAATCGAATCTCAATTACCCCCC‑GGGTACAAACCCGGTTGTC‑TTTACCAGCTTCaa > 3:133934/1‑148 (MQ=255) aCAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACtg < 3:350807/151‑1 (MQ=255) taGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAGCCATTGCCTGAAGGGGC‑GGCAGAAAAAACCCGCACGCAAAACGAATCTCAATTACCCGCC‑GGGTACAAACCGGGTTTTC‑TTAAACAGATTTAACtgt > 2:718288/2‑151 (MQ=255) cAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACtgt < 2:653900/151‑1 (MQ=255) aGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCCACCCTTTCCTTAAAGAGG‑GGGCGAAAAAGACCCCCCGCAAAACGAAACTCAATTATCCGCA‑GGGTACAAACCGGGTTTTC‑TTAACCAGCTTCAACtgtt > 4:703974/1‑151 (MQ=255) gggCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACtgttg < 1:430505/151‑1 (MQ=255) gggCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACtgttg < 4:1439959/151‑1 (MQ=255) ggCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATg < 3:202363/149‑1 (MQ=255) gCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAAGGGC‑GGCAGAAAAAACCCGCACGCCAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGGTACAAGCCGGGTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGcc > 4:183015/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAACCACTGCCTGAAGGTGG‑GGCCGAAAAAACCCCCACGCCAAACGAATCTCAATTACCCCCC‑GGTTACAAACCCGGTTGTC‑TTAACCAACTTCAAATGTTGTTTGCCGc > 2:301145/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCa < 4:235687/150‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAACCATTGCCTGAAAGGGC‑GGCAGAAAAAACCCGCACGCAAATAGAAACTCAATTAACCGCA‑GGGTACAAACCCGGTTGTCTTTAACAACCTTC‑ACTGTTGTATGcccc > 4:1111239/1‑146 (MQ=255) gCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAGCCCCTGCCTGAAAGGGG‑GGCGGAAAAAACCCCCACGCAAAACGAATCTCAATTACCCCCC‑GGGTACAAACCGGGTTGTT‑TTTAACAACTTTAACTGTTTTTTGCCggcc > 2:1305610/1‑146 (MQ=255) gCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCAcgc < 4:34419/151‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCAcgc < 2:616914/151‑1 (MQ=255) cGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGa < 4:731243/151‑1 (MQ=255) ggCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATg < 2:183196/151‑1 (MQ=255) cAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGGTCCAACCATTTCCTGAAGGGGC‑GGCCGAAAAAACCCGCCCGCAAAACGAATCACAATTACCCGCA‑GGGTAAAAGCCGGGTTGTC‑TTAACCAACTTTAACTGTTGTATGCCGCACGCGGTATGCaa > 4:59274/1‑150 (MQ=255) aaGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAAcc < 1:98214/151‑1 (MQ=255) aaGCCACGGCAATAATGGCGGGGAGCCAGCCACTGCCCTAATAAGG‑GGGCGAAAAAGACCGCACGCAAAACGAATCTCCATTACCCGCA‑GGGTAAAAAACGGGTTGTG‑TTAACAAGCTTCAAATTTTGTATGCCGCACGCGATATCAAAcc > 2:1641842/1‑151 (MQ=255) ccACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCAt < 1:428272/151‑1 (MQ=255) aCGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCAtgt < 2:1279896/151‑1 (MQ=255) cGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCAtgt < 2:704543/150‑1 (MQ=255) gCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTggg < 2:1001745/151‑1 (MQ=255) cAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGa < 1:366770/151‑1 (MQ=255) aataatGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGaa < 2:995132/151‑1 (MQ=255) aataatGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGaa < 2:775427/151‑1 (MQ=255) taatGGCGGGGATCCAGCCACTGCCTTAAGGGGG‑GGCCGAAAAAACCCCCACGCCAAACGAAACTCAATTAACCGCC‑GGGTTCAAACCGGGTTGTC‑TTAACCAACCTCAACTGTTGTATGCCGCACGCCGTATGCAACCCCAGTGGGgaa > 1:22559/1‑150 (MQ=255) aatGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGaaaa < 4:1303687/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCCCACGCAATTCGAATCCCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAATTGTTGTAGGCCGCACGCGATATGCAACCCATGGGGGAAAACCg > 4:1128525/1‑150 (MQ=255) gCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTg > 1:127365/1‑151 (MQ=255) cGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGa < 2:433113/151‑1 (MQ=255) gggATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATg > 4:1233155/1‑151 (MQ=255) gATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCt < 3:103850/151‑1 (MQ=255) ccAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGtt > 4:995820/1‑151 (MQ=255) cAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGtt > 2:819785/1‑150 (MQ=255) aGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTaa < 3:409892/151‑1 (MQ=255) gCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTaaa < 4:821378/151‑1 (MQ=255) gAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAg < 2:1117263/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGc > 1:107866/1‑151 (MQ=255) aGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCa > 1:30470/1‑150 (MQ=255) c‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCt > 2:1431905/1‑151 (MQ=255) aaaGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAgg > 2:1490936/1‑151 (MQ=255) aaGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGt > 2:483628/1‑151 (MQ=255) aGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTg > 4:160038/1‑151 (MQ=255) cccGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGc < 2:1569801/151‑1 (MQ=255) ccGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCg > 4:1325243/1‑151 (MQ=255) cgcacgcaAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCg > 2:1482945/1‑150 (MQ=255) cgcacgcaAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCg > 2:1156537/1‑150 (MQ=255) cacgcaAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGAtt < 2:1260588/151‑1 (MQ=255) caAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGcca < 2:106238/151‑2 (MQ=255) aaaTCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCgg > 1:148708/1‑151 (MQ=255) aaTCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGt < 3:287170/151‑1 (MQ=255) cGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTc < 3:106095/151‑1 (MQ=255) gAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTcc > 4:1163676/1‑151 (MQ=255) aaTCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCa < 4:1590579/151‑1 (MQ=255) tcAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCg > 2:80852/1‑151 (MQ=255) cAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAg < 2:857259/147‑1 (MQ=255) cAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGcc < 3:85917/149‑1 (MQ=255) aaTTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGc > 2:144960/1‑150 (MQ=255) aaTTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCa < 2:1323590/151‑1 (MQ=255) aaTTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCa < 3:265713/151‑1 (MQ=255) aTTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGc > 4:559415/1‑149 (MQ=255) aTTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCAGGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGc < 4:1653428/146‑1 (MQ=255) ttACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGt > 2:1246708/1‑151 (MQ=255) tACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGtt > 4:408332/1‑151 (MQ=255) tACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGt < 4:1535714/150‑1 (MQ=255) aCCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGttt > 3:295375/1‑151 (MQ=255) cccGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTta < 2:596167/151‑1 (MQ=255) cccGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTta < 4:629593/151‑1 (MQ=255) cccGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTta < 4:1168570/151‑1 (MQ=255) ccGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTtaa < 1:358664/151‑1 (MQ=255) cGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTtaat > 1:337068/1‑151 (MQ=255) cA‑GGTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTtaataa < 4:306244/151‑1 (MQ=255) ggTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAAt > 3:324921/1‑151 (MQ=255) ggTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAAt < 2:1450756/151‑1 (MQ=255) gTTACAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATg < 4:48779/151‑1 (MQ=255) aCAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATggg < 2:1621756/150‑1 (MQ=255) aCAAGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGt > 2:1184724/1‑151 (MQ=255) aGCCGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTaga < 1:353823/151‑1 (MQ=255) ccGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGt > 1:89369/1‑151 (MQ=255) ccGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGt < 2:1109833/151‑1 (MQ=255) cGGTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGtt > 2:1450343/1‑151 (MQ=255) ggTTTGTC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGtt > 2:964526/1‑150 (MQ=255) | GGTGGCTGTCAGTGAACAGGGCGAGGCACTGCCGCAGGCGCAAGCCACGGCAATAATGGCGGGGATCCAGCCATTGCCTGAAGGTGC‑GGCAGAAAAAGCCCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCA‑GGTTACAAGCCGGTTTATC‑TTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTT > NC_000913/981169‑981459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |