Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 92,324 | A→G | E304E (GAA→GAG) | ftsI → | transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis; penicillin‑binding protein 3 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 92,324 | 0 | A | G | 99.1% | 420.9 / ‑4.0 | 116 | E304E (GAA→GAG) | ftsI | transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis; penicillin‑binding protein 3 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (47/68); total (48/68) | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.66e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGAC > NC_000913/92177‑92470 | cAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAGCCg < 3:352787/151‑1 (MQ=255) aGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAGCCggg > 3:441040/1‑151 (MQ=255) aGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAGCCggg > 2:937051/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |