| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,315,727 | G→A | G747D (GGC→GAC) | rcsD → | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,315,727 | 0 | G | A | 99.1% | 430.1 / NA | 113 | G747D (GGC→GAC) | rcsD | phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (65/47); total (65/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGGCTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATCGCC > NC_000913/2315579‑2315874 | gtggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGact > 3:461255/1‑151 (MQ=255) ggATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttg > 2:643548/1‑151 (MQ=255) gATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgc > 2:174354/1‑151 (MQ=255) aTGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgct < 2:898349/151‑1 (MQ=255) aTGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgct > 2:259641/1‑151 (MQ=255) tGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGacttgctt > 1:317851/1‑151 (MQ=255) tACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCtttt < 4:752414/150‑1 (MQ=255) ttCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGc > 4:789540/1‑151 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCg > 1:184153/1‑150 (MQ=255) cGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCg < 4:283143/150‑1 (MQ=255) cAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCgatg > 4:989583/1‑150 (MQ=255) gAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGatgatg > 1:123569/1‑151 (MQ=255) aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGatgatg > 4:815819/1‑150 (MQ=255) aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGatgatg > 2:1276030/1‑150 (MQ=255) aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGAtgatga < 4:392667/151‑1 (MQ=255) aaaTTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGAtgatga < 4:700672/151‑1 (MQ=255) cGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCt < 2:1289629/150‑1 (MQ=255) cGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTg < 4:394595/151‑1 (MQ=255) tgAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTgg > 2:966043/2‑151 (MQ=255) aaTATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCg < 4:814401/151‑1 (MQ=255) atatTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGt > 4:521501/1‑151 (MQ=255) tatTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGt > 2:1542243/1‑150 (MQ=255) atTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTAc > 1:313101/1‑151 (MQ=255) atTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAACGATGATGAGTCTGGCGTAc > 2:1068951/1‑151 (MQ=255) tGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACg < 1:271019/150‑1 (MQ=255) gTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACggg < 4:50516/151‑1 (MQ=255) cGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAAtt < 4:1130811/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTg < 1:467604/151‑1 (MQ=255) ccAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTggg > 2:548919/1‑151 (MQ=255) cAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGc > 2:1577005/1‑151 (MQ=255) aGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGcc > 2:758029/1‑151 (MQ=255) aGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGACGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGcc > 4:246287/1‑151 (MQ=255) aGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTgg < 2:177217/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTc < 2:727509/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATtg > 3:268081/1‑151 (MQ=255) gTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGt < 4:201065/151‑1 (MQ=255) tGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTc > 4:610085/1‑151 (MQ=255) tGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTc > 4:1556462/1‑151 (MQ=255) gCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCa < 2:1475739/151‑1 (MQ=255) cAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATGAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTACTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGATCAATTGTGCGTCaa < 3:133634/151‑1 (MQ=255) aaCCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAAc > 1:152333/1‑151 (MQ=255) gTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCa > 3:405800/1‑150 (MQ=255) aTCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAat > 4:635697/1‑150 (MQ=255) aTCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAat > 3:326060/1‑150 (MQ=255) acacCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATg > 2:1359306/1‑150 (MQ=255) cacCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAg < 3:276816/151‑1 (MQ=255) acCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGc < 3:313118/151‑1 (MQ=255) cccGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCa < 2:1325148/151‑1 (MQ=255) ccGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCaa < 4:536652/151‑1 (MQ=255) gATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACg > 4:401472/1‑151 (MQ=255) gATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACg > 4:607431/1‑151 (MQ=255) gAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTa < 1:461235/151‑1 (MQ=255) aaaGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTAt > 4:1306700/1‑151 (MQ=255) aaGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATg > 2:1605994/1‑151 (MQ=255) aGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGc > 4:1660474/1‑151 (MQ=255) attaattaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGc > 2:492649/1‑149 (MQ=255) attaattaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAg < 2:1311192/151‑1 (MQ=255) attaattaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAg < 2:402740/151‑1 (MQ=255) ttaGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGc > 2:267105/1‑151 (MQ=255) taGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCg > 1:436123/1‑151 (MQ=255) aGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCgg < 4:827259/151‑1 (MQ=255) aGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCgg > 4:856349/1‑151 (MQ=255) tCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTc > 3:46731/1‑151 (MQ=255) cAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTc < 3:448625/150‑1 (MQ=255) cAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCt < 2:1657549/151‑1 (MQ=255) cAAGATTATGATATATTTTTAACGGCTAATGCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGACATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTc > 1:200665/1‑150 (MQ=255) aaGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCtt > 2:184748/1‑151 (MQ=255) gATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTAc > 4:1630890/1‑151 (MQ=255) gATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTAc > 2:948246/1‑151 (MQ=255) tGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACaatt > 2:27353/1‑150 (MQ=255) gATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACaatta > 2:1277560/1‑150 (MQ=255) atCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACaattaatt < 3:218305/150‑1 (MQ=255) ttttTACGGATAATCCCTCTAATCTTAATGGCTCTGGCTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGCGGGTCAACTTTAATATTAGCAACGCTATGCAGGAAGCTGTCTTACAATTAATTGAAg < 4:1644655/150‑1 (MQ=255) ttttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAg > 4:487216/1‑150 (MQ=255) ttttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGt > 2:1481184/1‑151 (MQ=255) ttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTg < 2:1414933/150‑1 (MQ=255) ttAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGc > 2:315239/1‑151 (MQ=255) aaCGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCa < 2:922394/150‑1 (MQ=255) aCGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAAc > 2:1380667/1‑151 (MQ=255) aTAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGgc < 4:942654/151‑1 (MQ=255) aaTCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGgcgc < 4:48880/151‑1 (MQ=255) ccGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAg < 4:644418/150‑1 (MQ=255) cGTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGACAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGa < 2:1186978/151‑1 (MQ=255) gTCTAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGaa < 4:174641/151‑1 (MQ=255) tAATCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAag > 2:408136/1‑149 (MQ=255) aaTCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAagag < 3:439742/150‑1 (MQ=255) aaTCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAgg > 1:255050/1‑151 (MQ=255) aTCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGt > 4:108880/1‑151 (MQ=255) tCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTg > 1:161641/1‑151 (MQ=255) tCTTACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTg > 2:798876/1‑151 (MQ=255) tACTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGAc > 1:304244/1‑150 (MQ=255) aCTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACa < 2:424127/150‑1 (MQ=255) aCTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACa < 4:1035187/150‑1 (MQ=255) cTGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGAc > 1:437828/1‑148 (MQ=255) tGCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGAGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGa > 4:935734/1‑150 (MQ=255) gCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGaa < 4:1310970/150‑1 (MQ=255) gCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAAt < 2:254465/151‑1 (MQ=255) gCCTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAAt > 4:1032708/1‑151 (MQ=255) ccTCTGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATc > 4:385883/1‑151 (MQ=255) ctGACTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATCGcc > 1:413460/1‑151 (MQ=255) | GTGGATGTTACTTCGGCAGAAATTCGGAATATTGTCACTCGCCAGTTAGAAAATTGGGGTGCAACCTGTATCACACCCGATGAAAGATTAATTAGTCAAGATTATGATATCTTTTTAACGGATAATCCGTCTAATCTTACTGCCTCTGGCTTGCTTTTAAGCGATGATGAGTCTGGCGTACGGGAAATTGGGCCTGGTCAATTGTGCGTCAACTTCAATATGAGCAACGCTATGCAGGAAGCGGTCTTACAATTAATTGAAGTGCAACTGGCGCAGGAAGAGGTGACAGAATCGCC > NC_000913/2315579‑2315874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |