| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,733,986 | T→C | D63G (GAT→GGT) | clpB ← | protein disaggregation chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,733,986 | 0 | T | C | 99.0% | 374.5 / NA | 97 | D63G (GAT→GGT) | clpB | protein disaggregation chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (62/34); total (63/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCA > NC_000913/2733843‑2734132 | acAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcg > 4:371055/1‑151 (MQ=255) cAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcgc > 3:253247/1‑151 (MQ=255) aGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcgc > 2:293844/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTgcgc > 2:441925/1‑150 (MQ=255) ttCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAAc > 2:1020752/1‑151 (MQ=255) tCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACt > 4:589610/1‑151 (MQ=255) tGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTgg > 2:1585306/1‑151 (MQ=255) gACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGc > 4:333336/1‑151 (MQ=255) gagaTAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGcc > 4:155051/1‑149 (MQ=255) gagaTAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGcc > 4:1029234/1‑149 (MQ=255) gagaTAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGcc > 2:1467668/1‑149 (MQ=255) tAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCAtt > 4:1225360/1‑151 (MQ=255) tAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCAtt > 2:1484627/1‑151 (MQ=255) aaaGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCAttt > 2:280470/1‑151 (MQ=255) ttATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGc > 4:1043191/1‑151 (MQ=255) ttATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGc > 1:245195/1‑151 (MQ=255) aTCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGcc > 1:330138/1‑150 (MQ=255) aTCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGcc < 4:118117/150‑1 (MQ=255) accacGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGCAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGc > 2:136636/1‑150 (MQ=255) ccacGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCgg > 3:263349/1‑151 (MQ=255) ccacGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCgg > 2:1211498/1‑151 (MQ=255) gTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATg > 2:1429855/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGt > 1:463244/1‑151 (MQ=255) ttttGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGtt < 2:963923/150‑1 (MQ=255) ttttGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGAGGtt > 1:102801/1‑150 (MQ=255) gattGCGCCAGCGTGGGGCAAGGAAAAAGAGGGGGCACCAGATGTTGTGATGGCTGGGCACCGCCACCATTAAAAAAAAACTGACGTAAACGATTAAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCAAGCATTTATGCCAGCGGATg > 2:628080/3‑148 (MQ=255) tttGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTta > 4:1595996/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTtaat > 2:988784/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTtaat > 2:664244/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTtaata < 3:49922/150‑1 (MQ=255) gcCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTGAATGCCTGATTGATACCTGTGCTCAAAGGGCCAGCATTTATGGCAGCGGATGTtaataa < 4:1597007/149‑1 (MQ=255) gCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACt > 3:438493/1‑151 (MQ=255) cTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACt > 3:251073/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTa > 2:512816/1‑150 (MQ=255) tGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTaa < 2:602221/150‑1 (MQ=255) tGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTa < 1:300775/149‑1 (MQ=255) tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:568850/1‑151 (MQ=255) tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:66517/1‑151 (MQ=255) tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:847485/1‑151 (MQ=255) tCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg > 2:1230268/1‑151 (MQ=255) cGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCg < 2:588794/150‑1 (MQ=255) aaaGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcc > 4:572935/1‑151 (MQ=255) aGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcccc > 2:1254704/1‑151 (MQ=255) aGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcccc > 1:76134/1‑151 (MQ=255) aGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAAcccc < 4:886171/151‑1 (MQ=255) aTTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGAc < 3:151565/137‑1 (MQ=255) aTTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGAc > 1:151551/1‑137 (MQ=255) aTTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCt < 4:394385/151‑1 (MQ=255) gAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTg < 4:1215065/151‑1 (MQ=255) gAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTg < 2:25167/151‑1 (MQ=255) gAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTg < 1:378/151‑1 (MQ=255) aCGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGAt > 1:327748/1‑151 (MQ=255) cgcgCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGAtt > 4:836836/1‑151 (MQ=255) gcACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTc > 1:258928/1‑149 (MQ=255) gATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGgc > 4:295207/1‑151 (MQ=255) ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCt < 1:334788/151‑1 (MQ=255) ccTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCt > 4:429798/1‑151 (MQ=255) gtgATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAt < 2:709777/151‑1 (MQ=255) gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAtt > 4:496131/1‑150 (MQ=255) gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAtt < 4:684069/150‑1 (MQ=255) gATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCAtt < 2:774782/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTaa < 2:215887/151‑1 (MQ=255) ggCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAAt < 2:1502792/151‑1 (MQ=255) ggCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAAt > 2:1671229/1‑151 (MQ=255) cTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATg > 2:1146854/1‑150 (MQ=255) ggACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGa < 2:935368/149‑1 (MQ=255) aCATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTg < 4:955979/151‑1 (MQ=255) aCATCACCACCAGTAACTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCATGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCGAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCTTGATTGAGTAGGTCGCTCATTAAATGAAGt > 4:1260240/1‑150 (MQ=255) cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg < 2:370502/151‑1 (MQ=255) cATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTgg > 4:1615142/1‑151 (MQ=255) aTCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGt < 4:1275414/151‑1 (MQ=255) aTCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGt > 1:442281/1‑151 (MQ=255) accaccAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCg > 1:163539/1‑151 (MQ=255) accaccAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCg > 4:294287/1‑151 (MQ=255) ccaGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATaa < 2:1285426/151‑1 (MQ=255) tCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGt > 1:58757/1‑151 (MQ=255) cAACCTGCTGTAAACGATTGAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTg < 2:1175087/149‑1 (MQ=255) cAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGt < 4:257069/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 2:1564899/1‑151 (MQ=255) ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 4:440386/1‑151 (MQ=255) ccTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTg > 2:143465/1‑151 (MQ=255) gCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGccc > 2:1177962/1‑151 (MQ=255) ggTAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGa < 4:670428/151‑1 (MQ=255) tAAACGATTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGt > 4:260493/1‑151 (MQ=255) aTTTAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGt < 4:280916/151‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTg > 1:273226/1‑150 (MQ=255) aaTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGAtt < 1:436142/151‑1 (MQ=255) aTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg < 4:1182897/151‑1 (MQ=255) aTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg < 2:154788/151‑1 (MQ=255) aTGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTg > 3:333731/1‑151 (MQ=255) tGCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg > 2:268218/1‑151 (MQ=255) gCCTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTgg < 2:471314/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGATACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGc < 4:1439445/151‑1 (MQ=255) gattgatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCa < 4:136866/149‑1 (MQ=255) gattgatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATc > 1:467428/1‑151 (MQ=255) tgatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGc > 2:1185381/1‑151 (MQ=255) gatACCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGc > 4:1443152/1‑150 (MQ=255) atacCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCa > 2:1568031/1‑150 (MQ=255) | ACAGTTCTGACGAGATAAAGTTATCACCACGTTTTTGCGCCAGCTTGTCGCAAAGATTAAGAACGCGCACCAGATCCTGTGATGGCTGGACATCACCACCAGTACCTTCAACCTGCGGTAAACGATTTAATGCCTGATTGATATCTGTGCGCAACTGGCCAGCATTTATGCCAGCGGATGTTAATAAAGGACTAACCGAACCCCCTTCCTGATTCAGCAGGGCGCTCATTAAATGAAGTGGTTCGATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCA > NC_000913/2733843‑2734132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |