Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 689,514 | 0 | A | C | 44.9% | 112.5 / 18.2 | 70 | G456G (GGT→GGG) | lnt | apolipoprotein N‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/7); new base C (0/31); total (31/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.25e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AACACAGCAGCAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGTTGGAGATAGTCAGC > NC_000913/689371‑689661 | aaCACAGCAGCAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGc < 3:1276438/150‑1 (MQ=255) aaCACAGCAGCAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCg > 3:914831/1‑151 (MQ=255) acacAGCAGCAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCgg > 3:770274/1‑151 (MQ=255) acaGCAGCAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGc < 1:153088/151‑1 (MQ=255) agcagcAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCa < 4:545559/151‑1 (MQ=255) cagcaAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAAt > 3:853429/1‑151 (MQ=255) gcaAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCa < 3:1015573/151‑1 (MQ=255) aaaaCCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCAcc < 3:89735/151‑1 (MQ=255) ccAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCAccgccg < 1:1008929/151‑1 (MQ=255) aCAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAAt > 2:175215/1‑151 (MQ=255) aaTGCCGTCAGCCCCCACGGCGGCCAGTGGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGGCGGCGTCACTTTAGTGGTTACCCCCTCGCGGGTGACCTGGGGGATCACCGCCTGAATCCCCCCCTGGGGGCAAATCACCGCCGTAATGc < 1:914708/151‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCCCCACAGGGGCCAGTTGCGGGTCCGTGGGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTGGGCGTCACTTTAGTGTTAAACCCCCCGCGGGTAAACTGGGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCGGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCg < 1:1175522/149‑1 (MQ=255) gCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTgg < 2:460255/150‑1 (MQ=255) cccccACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACCCCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGtg < 2:328854/149‑1 (MQ=255) cACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCTTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCGCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCAAATCACCGCCGTAATGCCGttgttg < 3:171531/148‑1 (MQ=255) cccACAGCGCCCAGTGGCCGGTACGTGCTTGTGGGGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGTTTAACCCCCCGCGGGTAAACGGCGGGATCATCGCCTGAATCCCCCCCGGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGt < 1:1297868/148‑1 (MQ=255) ccACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGGGGGCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGtg > 1:420706/1‑148 (MQ=255) gCGGCCAGTGGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGCCACGTTAGTGGTAAACCCCTCGCGGGTGAACTGCGGTATCACCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTgcg < 3:151783/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCGGTACGTGCGTGTGGTGTGAGTCCGGTGGTGGGGATCAGGTGATTGTTTAACCCCTCGCGGGTGAACGGCGGAATCAGCCCCGAATTCTCCCCCGGGGGTCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACa < 3:232359/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTAGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTGATGCCGTTGTTGGTGATACGCAACAGt > 1:202594/1‑151 (MQ=255) tGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGgcg > 1:290995/1‑151 (MQ=255) gCCGGTGCGTGCGTAGGGTGTGAGTCCGTTGGTCGGGGTCACGTTAGTGGTTAACCCCGCGCGGGTAACCTGGGGGATAATCGCCTGAATCTCCCCCTGGGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTgg < 4:276557/147‑1 (MQ=255) ggTACGTGCTGATGGTGTGAGCCGGGTGGGCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACCCCTCGGGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTACCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGgcgcgc < 2:191080/150‑1 (MQ=255) gTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACCCCTCGGGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGc < 2:372674/149‑1 (MQ=255) gTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTc > 4:286726/1‑151 (MQ=255) gCGTATGGTGTGAGTCCGGTGTTGGGCGTCACGTTGGTGGTTAACCCCTCGCGGGTGAACTGGGGGTTCATCGCTTAATTTTCTCCCGGCGGCCAAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTc < 2:184687/149‑1 (MQ=255) cGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGGGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTcc < 2:416990/149‑1 (MQ=255) tGGTGTGAGCCCGGTGGGCGGCACCATGTTAGTGGTAAACCCCTCGGGGGAAAACTTCGGGACCATCGCCTGAGCCGCCCCCTGCGGGCCAGCCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCt < 4:287559/143‑1 (MQ=255) gtgtGAGTCGGGTGGTCGGGGCCACTTTAGTGTTTAACCCCTCGCGGGGAAGCTGGGGGATCAGCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAgcgc < 3:110091/148‑1 (MQ=255) gtgAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTAAACCCCTCGCGGGTAAACTGCGGGATCTTCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGCCCAACCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGcgcacg < 4:402591/149‑1 (MQ=255) tgAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGcgcacgca > 3:163803/1‑150 (MQ=255) gAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCAtt > 2:403547/1‑151 (MQ=255) ccGGTGGTCGGCGTCACGTTGGTGGTTAACCCCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTAAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTcgcg < 3:1046234/151‑1 (MQ=255) tggtCGGCCTCACTTTAGTGTTTAACCCCTCGGGGGTGACCTGCGGGATCATCGCCTGATTCTCCCCCTGCGGCCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGcc < 3:104908/149‑1 (MQ=255) gtCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCt > 3:362656/1‑151 (MQ=255) ggCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTgg > 3:97189/1‑150 (MQ=255) ggCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTgg > 3:506719/1‑150 (MQ=255) ggCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTgg > 1:1201518/1‑150 (MQ=255) ggCGTCACGTTAGGGTTTAACCCCTCGCGGGGGAACTGGGGGATCCCCGCCTGAATCCCCCCCCGCGGCCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTgg < 2:240296/150‑1 (MQ=255) gTCACGTTAGTGTTTACCACCTCGGGGGTGAACTGGGGGATCATCGCCTAAATCTCCCCTTGCGGGCCAATCCCCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAgt < 2:146802/151‑1 (MQ=255) tCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATc > 4:9070/1‑143 (MQ=255) cagcttggTGGTTAACACCTGGGGGGTGACCTGCGGGATATACGCATAAACCTCCCCCTGAGGGCAAACCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGaa < 3:453948/140‑1 (MQ=255) cACGTTAGTGGTTAACCCCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATc < 2:9070/142‑1 (MQ=255) aCGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGtt > 3:1378244/1‑151 (MQ=255) aCGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGtt > 2:87534/1‑151 (MQ=255) ttAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGcc > 1:803302/1‑151 (MQ=255) gTGGTTAACCCCTCGGGGGTGAACTGCGGGATCACCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCAt < 2:33506/150‑1 (MQ=255) ttAACCCCTGGCGGGGGACCGGGGGGATCATCGCGTGAATCCCCCCCGGGGGGCCACTCCCCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGa < 3:686532/149‑1 (MQ=255) ttAACCCCTCGCGGGTGAACGGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGAc < 3:649708/150‑1 (MQ=255) taaaCCCCCCGCGGGTAAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCAAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGa < 3:158796/147‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGTGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGAtt > 1:799235/1‑151 (MQ=255) gggggTGACCTGGGGGATCATCGCCTGAATCCCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGAtt < 1:279876/147‑1 (MQ=255) gggggTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGAttt < 3:827527/148‑1 (MQ=255) gcgGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGAttt > 4:227804/1‑150 (MQ=255) cgGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTAc > 1:975466/1‑151 (MQ=255) ggTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTAcc > 3:108775/1‑150 (MQ=255) tGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCaa > 1:624595/1‑150 (MQ=255) gAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAAc > 1:1391650/1‑151 (MQ=255) aaCTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAAcc < 3:941189/151‑1 (MQ=255) aaCTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGACGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAAc > 2:389959/1‑150 (MQ=255) tGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACg > 4:107265/1‑151 (MQ=255) tGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACg > 1:440154/1‑151 (MQ=255) gggggATCATCGCCTGAATCTCCCCCGGCGGGCAAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACg < 2:296773/148‑1 (MQ=255) ggtatcatcCCCTGAATCCCCCCCTGGGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCAt < 3:104614/148‑1 (MQ=255) gggATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCAt > 3:935086/1‑151 (MQ=255) tcatcGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGtt > 1:200657/1‑151 (MQ=255) caccGCCTAAACCTCCCCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGtt < 3:88944/147‑1 (MQ=255) cgaaaTCCCCCCCTGCGGACCAATCCCCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGTTGGAGATa < 1:1378096/148‑1 (MQ=255) aTCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGCGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGTTGGAGATAGTc > 1:434251/1‑150 (MQ=255) tcACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGTTGGAGATAGTcagc > 3:127437/1‑150 (MQ=255) | AACACAGCAGCAAAACCAAACAATGCCGTCAGCACCCACAGCGGCCAGTTGCCGGTACGTGCGTATGGTGTGAGTCCGGTGGTCGGCGTCACGTTAGTGGTTAACACCTCGCGGGTGAACTGCGGGATCATCGCCTGAATCTCACCCTGCGGGCCAATCACCGCCGTAATGCCGTTGTTGGTGCTGCGCAACAGTGGGCGCGCCAGCTCCAGCGCACGCATTCGCGCCATCTGGAAGTGTTGCCATGGACCAATAGATTTACCAAACCACGCATCGTTGGAGATAGTCAGC > NC_000913/689371‑689661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |