| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 599,828 | T→C | L372P (CTG→CCG) | cusA → | copper/silver efflux system, membrane component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 599,828 | 0 | T | C | 99.1% | 378.2 / NA | 105 | L372P (CTG→CCG) | cusA | copper/silver efflux system, membrane component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (50/54); minor base A (1/0); total (51/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTG > NC_000913/599681‑599975 | caacaTACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCggg < 1:147968/151‑1 (MQ=255) aacaTACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCgggg > 2:236850/1‑151 (MQ=255) aacaTACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGGAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGGTTATTTCGTTGCCGCCgggg > 1:688329/1‑151 (MQ=255) aTACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGtt > 1:807951/1‑150 (MQ=255) gATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTa < 1:64481/151‑1 (MQ=255) tCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTAtt > 2:682468/1‑151 (MQ=255) gccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCttt > 1:992142/1‑151 (MQ=255) gccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCttt < 1:91084/151‑1 (MQ=255) ccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCtttt > 1:748107/1‑151 (MQ=255) ccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGGATTGCtttt > 2:782329/1‑151 (MQ=255) agcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGGGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGGTGTGTATTGCTTTTAt > 2:139847/1‑151 (MQ=255) agcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTAt > 2:928377/1‑151 (MQ=255) gcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTAtt < 2:1232269/151‑1 (MQ=255) cATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTg < 2:693989/149‑1 (MQ=255) cATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGt < 1:850881/150‑1 (MQ=255) cATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTc < 1:263844/151‑1 (MQ=255) gACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATg > 2:199755/1‑150 (MQ=255) gACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGc > 3:114887/1‑151 (MQ=255) gACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGc > 2:187493/1‑151 (MQ=255) ccGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCAc < 1:955315/151‑1 (MQ=255) ccGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCAc < 2:1209024/151‑1 (MQ=255) gcgcCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACtt < 4:277369/151‑1 (MQ=255) cgcCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGCGCGCTGTTTCCCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACtt > 1:317290/1‑150 (MQ=255) gcCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTcc > 4:110984/1‑151 (MQ=255) cATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAg < 1:299912/151‑1 (MQ=255) tCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTTGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTACTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCa < 1:274515/148‑1 (MQ=255) tCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGGTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAggg > 1:295938/1‑151 (MQ=255) cGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAggg < 2:231330/150‑1 (MQ=255) cGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAggg > 1:700204/1‑150 (MQ=255) aaCCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTg > 1:606615/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGaa > 3:217902/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAAt < 1:901877/151‑1 (MQ=255) cTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATg > 1:914194/1‑151 (MQ=255) cAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATg < 2:871546/149‑1 (MQ=255) aGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCa < 3:439210/151‑1 (MQ=255) gCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCaa < 4:322290/151‑1 (MQ=255) aaGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAAtatt > 1:388591/1‑150 (MQ=255) aGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAAtattat < 1:603912/151‑1 (MQ=255) gTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAAtattat > 4:229407/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATg < 4:287670/151‑1 (MQ=255) gagTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTg < 2:636667/151‑1 (MQ=255) gTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTGCAGGGACTGAATGCCAATATGATGTCGTTGGGTGGc < 2:1118687/151‑1 (MQ=255) aTTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTg < 1:149893/151‑1 (MQ=255) ttGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTg < 2:553527/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCg < 2:955857/150‑1 (MQ=255) tggtggCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGAt > 4:125696/1‑151 (MQ=255) tggtggCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGAt > 2:1011756/1‑151 (MQ=255) ggtggCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGAtt > 1:392920/1‑151 (MQ=255) gtggCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTCGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTg < 1:82523/151‑1 (MQ=255) ggCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCAGGGGTTGGGTATTGCTTTTATTGCCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGcc > 2:849199/1‑151 (MQ=255) ggTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTc < 2:895488/151‑1 (MQ=255) ggTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTc < 3:371006/151‑1 (MQ=255) tAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCgg > 3:361761/1‑151 (MQ=255) tAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCgg > 3:37632/1‑151 (MQ=255) tAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCgg > 2:818082/1‑151 (MQ=255) gTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCgggg < 2:1128845/151‑1 (MQ=255) tgtgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCg > 1:1026424/1‑150 (MQ=255) gtgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGc < 1:859237/148‑1 (MQ=255) gtgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGc < 4:34903/148‑1 (MQ=255) gtgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCg < 2:530021/149‑1 (MQ=255) tgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATg > 3:164386/1‑151 (MQ=255) cgcTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGt < 1:909488/151‑1 (MQ=255) gcTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTc < 2:1128125/151‑1 (MQ=255) gTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAt < 3:319102/151‑1 (MQ=255) gTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAt < 3:106876/151‑1 (MQ=255) tttCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAtg > 1:285481/1‑151 (MQ=255) ctctGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAtgctg > 2:14818/1‑151 (MQ=255) ctGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAtgct < 1:1166855/148‑1 (MQ=255) ctGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAtgct < 1:136754/148‑1 (MQ=255) tGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATgctgct > 1:1073822/1‑150 (MQ=255) ggCGTGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTAt < 2:938178/151‑1 (MQ=255) ggCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATgctgct < 3:64923/149‑1 (MQ=255) gCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATc < 2:884670/151‑1 (MQ=255) gCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATc < 3:269120/151‑1 (MQ=255) cATGCGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCg > 1:127242/1‑151 (MQ=255) aTGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGt < 2:805281/151‑1 (MQ=255) aTGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGt > 2:562746/1‑151 (MQ=255) aTGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGt > 2:143934/1‑151 (MQ=255) tgtgCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGt < 2:821175/150‑1 (MQ=255) tgCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCAt > 4:32825/1‑151 (MQ=255) gcgcTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCAt < 4:290801/150‑1 (MQ=255) gcTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGAt > 1:1244851/1‑151 (MQ=255) cTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATc > 2:60497/1‑151 (MQ=255) tCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCg > 1:540400/1‑151 (MQ=255) cGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCga < 4:214472/151‑1 (MQ=255) gctcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCgaga < 2:864470/148‑1 (MQ=255) cgcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGaa < 4:276277/151‑1 (MQ=255) gcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGCGAAt > 3:137428/1‑151 (MQ=255) gcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAAt < 3:9678/151‑1 (MQ=255) gcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAAt > 1:168704/1‑151 (MQ=255) gtggCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATgcgc < 1:60506/151‑1 (MQ=255) ggCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCAt < 1:682607/151‑1 (MQ=255) ggCGATTATTTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCAt > 1:225916/1‑151 (MQ=255) attattTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAAc < 2:688305/151‑1 (MQ=255) ttattTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACg > 4:348240/1‑151 (MQ=255) tattTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACgg > 3:168652/1‑151 (MQ=255) tattTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACg < 1:843354/150‑1 (MQ=255) attTCGTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCTGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGc < 1:387251/151‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGa > 2:728033/1‑150 (MQ=255) cGCCGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTg < 2:224667/151‑1 (MQ=255) | CAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTAGTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTG > NC_000913/599681‑599975 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |