| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 311,480 | (T)8→7 | intergenic (‑144/‑632) | ecpR ← / → ykgL | putative transcriptional regulator for the ecp operon/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 311,473 | 0 | T | . | 97.5% | 368.4 / 3.3 | 81 | intergenic (‑137/‑639) | ecpR/ykgL | putative transcriptional regulator for the ecp operon/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base . (28/51); total (29/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
TTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATGTTTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACGTTCAAT > NC_000913/311325‑311618 | ttGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATGtt < 1:1078983/150‑1 (MQ=255) cATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATGttttttt > 1:385443/1‑151 (MQ=255) cACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATGTTTTTTTcccg < 1:87533/150‑2 (MQ=255) cACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATGTTTTTTTcccg > 1:923173/1‑149 (MQ=255) actTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAg < 2:665416/151‑1 (MQ=255) ttCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAgtg < 1:888628/150‑1 (MQ=255) aCCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAatat < 1:915015/151‑1 (MQ=255) gTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGa < 1:1005595/151‑1 (MQ=255) aaTTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGaa < 1:144994/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAAc > 2:96333/1‑151 (MQ=255) cAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAgg < 1:727792/151‑1 (MQ=255) cAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAgg > 1:1188838/1‑151 (MQ=255) tGCATTCAGTTTCCTTAGTAGTCCAGAAGTAAATAACAGTCGAAGTACATATCAATATAGTTTTAACAACTTTAATTTTAATTATTTGCAATTCGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATCAGTGTCAATATGTGAACGGGAAAAGAAt < 2:435883/150‑1 (MQ=255) gCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTc > 2:1087223/1‑151 (MQ=255) cATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTc > 1:679092/1‑150 (MQ=255) aGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGt < 1:180602/151‑1 (MQ=255) aGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATTGTTAAGTCAat < 2:863041/151‑1 (MQ=255) gTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAata < 1:1163818/151‑1 (MQ=255) gTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAata < 2:632368/151‑1 (MQ=255) aaaCCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAatat < 2:1009608/150‑1 (MQ=255) aCCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATAttt > 1:104867/1‑150 (MQ=255) ccGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAg < 2:381759/151‑1 (MQ=255) gAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGaa > 2:926457/1‑150 (MQ=255) aaGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGaaaa < 2:923190/151‑1 (MQ=255) aGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGaaaaa < 2:198972/151‑1 (MQ=255) tAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACt > 2:154435/1‑151 (MQ=255) aaaTAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTg > 1:583420/1‑151 (MQ=255) aaTAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGa < 1:1085002/151‑1 (MQ=255) aaTAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGa < 2:861691/151‑1 (MQ=255) aaTAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGa < 1:1039275/151‑1 (MQ=255) aTAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGaa < 1:564090/151‑1 (MQ=255) aTAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGa > 1:1075444/1‑150 (MQ=255) gATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAata < 2:1093371/151‑1 (MQ=255) aCGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATAtt < 2:162603/150‑1 (MQ=255) cGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGc > 1:538684/1‑151 (MQ=255) cGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGc < 2:287452/151‑1 (MQ=255) gtagtaCATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGGAAATATTGCt > 2:124575/1‑151 (MQ=255) agtaCATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCttt < 2:858737/151‑1 (MQ=255) agtaCATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCttt < 2:385446/151‑1 (MQ=255) gtaCATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCtttt < 1:986351/151‑1 (MQ=255) atatCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTg > 2:669829/1‑150 (MQ=255) atCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGAt < 2:174281/150‑1 (MQ=255) tCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATa < 1:1055885/150‑1 (MQ=255) cAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATaa < 1:365243/150‑1 (MQ=255) aTAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATaagaa < 1:943468/151‑1 (MQ=255) aTAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATaaga > 1:1048442/1‑150 (MQ=255) tAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATaaga > 1:743847/1‑149 (MQ=255) aaaGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATaagaag < 2:1078716/150‑1 (MQ=255) aaGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAgaagaa < 1:213576/151‑1 (MQ=255) ggTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGaaaa < 2:1163012/151‑1 (MQ=255) ggTTAAACGAGATTAAGGTTAATTATTTTCGATTGGGGTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGAGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGaaa > 1:939934/1‑150 (MQ=255) tAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATTAGTGTCATTATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGaaaa > 1:787660/1‑148 (MQ=255) tAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGaaaa > 2:628385/1‑148 (MQ=255) tAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAg < 2:97060/150‑1 (MQ=255) aaaCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGAc < 1:208167/151‑1 (MQ=255) aaCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAATAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGa > 2:317654/1‑149 (MQ=255) aaCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGAc > 2:1170952/1‑150 (MQ=255) aaCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGAc > 1:162583/1‑150 (MQ=255) aaCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGAc > 2:235079/1‑150 (MQ=255) aCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACAt < 2:161721/151‑1 (MQ=255) aCGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACAt < 1:408145/151‑1 (MQ=255) cGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACAtt > 1:203543/1‑151 (MQ=255) gagaTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACAttt < 1:928178/151‑1 (MQ=255) gagaTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACAttt < 2:24450/151‑1 (MQ=255) gagaTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACAttt < 2:603485/151‑1 (MQ=255) agaTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTg < 1:687321/151‑1 (MQ=255) gaTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTgg < 1:454590/151‑1 (MQ=255) gaTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTgg < 2:454903/151‑1 (MQ=255) aTTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGt < 1:774143/151‑1 (MQ=255) tAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGtt < 1:1010800/150‑1 (MQ=255) aaGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTc < 1:1014273/151‑1 (MQ=255) tattTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGtt > 1:750290/1‑150 (MQ=255) attTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTa < 1:682731/150‑1 (MQ=255) attTTCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTa < 1:321855/150‑1 (MQ=255) ttttCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTAtt > 2:689886/1‑151 (MQ=255) tttCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTAtt < 1:339414/150‑1 (MQ=255) ttCGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTg < 2:274312/150‑1 (MQ=255) cGATTGGGCTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGc > 1:853372/1‑150 (MQ=255) cTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACg > 1:423194/1‑151 (MQ=255) cTTAAATTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACg > 2:1008909/1‑151 (MQ=255) aaaTTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACGtt < 1:679299/150‑1 (MQ=255) aaaTTTATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACGTTc < 1:378894/151‑1 (MQ=255) tttATG‑TTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACGTTCAAt > 2:668873/1‑151 (MQ=255) | TTGCCATGTCACTACTTTCCAAACCTGTAATTTTTACAGGTGCATTCAGTTTCCTTAGTAAACCGGAAGTAAATAAGATACGTAGTACATATCAATAAAGGTTAAACGAGATTAAGTTTAATTATTTTCGATTGGGCTTAAATTTATGTTTTTTTTCCCGATGAGTGTCAATATGTGAACGGAAAAGGAATTCAATGGTTAAGTCAATATTTAGAAAAACTGAAAATATTGCTTTTTTGATAAGAAGAAAAAGACATTTGGTTTCATAAGGTTATTGGCAATATAACGTTCAAT > NC_000913/311325‑311618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |