| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,781,645 | 0 | A | C | 45.7% | 119.5 / 15.1 | 70 | V361G (GTT→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/4); new base C (0/32); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCT > NC_000913/2781496‑2781788 | aggaTATAATTTTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTTCAACATCCATaa < 2:196365/150‑1 (MQ=255)aggaTATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATaa < 1:1039204/150‑1 (MQ=255)aggaTATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAAc > 1:782711/1‑151 (MQ=255)agaatatAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATaa < 2:26957/147‑1 (MQ=255) ggaTATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAAc < 1:79873/150‑1 (MQ=255) aTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCAt > 2:805504/1‑151 (MQ=255) aTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCAt > 1:239826/1‑151 (MQ=255) gttgtGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTAt > 1:950499/1‑151 (MQ=255) ttcattttccccGCCGTTTTTAATTTTTTGCGTTCCGCTGTTGATTTTGGTCCCTGGGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGGCCCC‑CCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTCCCTGCAACACCCAAACCCCCGCCATTATCt < 1:916424/139‑1 (MQ=255) ccgtttttccccGCCGTTTTTGATTTTTTGCTTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCC‑CCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCCATACCCCCGCCATTATCt < 1:1195221/139‑1 (MQ=255) ttccccGCCGTTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTTTTTATATTGGTGCCTGGGTCTTTGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTGCCC‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCg < 1:40970/144‑1 (MQ=255) ttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCt > 2:1195252/1‑141 (MQ=255) ccccGCCGTTTTTTATTTTTGGCTTTCCGCTGTTGATTTTGGTTCCTGGGTCTTGGCCATATTTTTTAATATTTTGTGTCCCT‑CTATTAATTATGCTTTTTTCCGCTTTCCCTCCACCCTCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTc < 2:6365/148‑1 (MQ=255) ccccGCCGTTTTTGATATTTTGCTTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCC‑CCATAAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg < 1:266361/149‑1 (MQ=255) ccgcTTTTAATATTTTGCTTTCCGCTGTTGATATTGGTGCTTGTGGTTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCC‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCTTTTCCGCCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAg < 2:332290/151‑1 (MQ=255) ccgcTTTTAATATTTGGCTTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATATTTATTAATTTTCTGTGTGCCC‑CCATTAATTATGGTTTTTTTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAg < 2:1116940/151‑1 (MQ=255) cgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGc > 2:1052414/1‑151 (MQ=255) cgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGc > 1:21082/1‑151 (MQ=255) cgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGc > 2:1163032/1‑151 (MQ=255) ttttGATTTTTTGCGTTCCGTTGTTGATTTTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCC‑CCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGc < 1:899111/148‑1 (MQ=255) ttttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCACAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 2:660004/1‑151 (MQ=255) tttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATGGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCTTTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt < 2:209890/150‑1 (MQ=255) ttttGCTTTCCGCTGTTGATTTTGGTGCCGGTGGCTATGCCAAAATTATAAATATTCTGTGTGCCC‑CCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCAt < 2:702043/148‑1 (MQ=255) tttGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGt > 2:481370/1‑151 (MQ=255) tttGCGTTCCCCTGTTTATATTGGTGCCTGTGCCTAGGCCATATTTATAAATATTTTGTGTCCCA‑CCTTTATTTTTTGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTgg < 1:313195/150‑1 (MQ=255) tGCTTTCCGTTTTTGATATTGGTGCCTGTGGTTTTGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCA‑CCATTATTTTTGTTTTTTGTCGTTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGtt < 1:756637/150‑1 (MQ=255) cGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaa > 2:643491/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg > 1:291940/1‑150 (MQ=255) atatTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTc > 2:361837/1‑151 (MQ=255) atatTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTc > 1:805131/1‑151 (MQ=255) tatTGGTGCCTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCC‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGtt < 2:593735/149‑1 (MQ=255) tatGGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTTTGTGTCCCA‑CCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTc < 1:107597/150‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCtt > 1:79756/1‑151 (MQ=255) gggcccTGTGTTTATGCCATAATTATTAATATTCTGTTTGCCC‑CCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTCCCTGAAACACCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCtt < 1:345803/145‑1 (MQ=255) ggTGCTTGTGGTTATGCCATATTTATAAATATTCTGTGTCCCA‑CCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCttt < 1:865924/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CAATTAATTATGGTTTTTGTCGTGTTTCCTGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCtt < 1:103943/149‑1 (MQ=255) ggTCCCTGTGGTTATGCCATAATTATTAATATTCTTTGTCCCA‑CCATTAATTTTGTTTTTTTTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCtt < 1:787792/149‑1 (MQ=255) tGCTTGTGTCTATGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTTTTTGTCGTTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTAt < 1:193107/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCt > 2:546084/1‑151 (MQ=255) cTGTGGTTATACCAAAATTATAAATATTTTGTG‑GCCACCCTTTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt < 2:397507/150‑1 (MQ=255) gtgGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATc < 2:917674/146‑1 (MQ=255) tgGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaat > 2:67814/1‑151 (MQ=255) ggttttGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTGCCT‑CCATTATTTATGTTTTTTGTGGCTTTTCCTACACCATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaat < 1:230064/145‑1 (MQ=255) ggttATGCCATATTTATTAATATTCTGTGTCCCA‑CCTTTATTTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTAt < 1:166577/140‑1 (MQ=255) tGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACTTCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTaataat < 2:871361/148‑1 (MQ=255) gcaaTAATTTTTAATCTTTTGTGTGCCC‑CTATTAATTTTGTTATTTGTCGCGTTTCCTGAACCCTCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt < 1:751764/147‑1 (MQ=255) aTAATTATTAATATTCTGTGTCCCA‑CCATTAATTATGTTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCt < 1:22450/149‑1 (MQ=255) tAATTATTAATATTATGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGt > 1:1114712/1‑151 (MQ=255) aaTTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGTTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGtt < 2:357184/151‑1 (MQ=255) aaTTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGtt > 1:679177/1‑151 (MQ=255) ttattaATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt > 1:317578/1‑150 (MQ=255) taataaaTATTCTTTGCCCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCCCTTTCCCTGCAACCTCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGttt < 2:630278/145‑1 (MQ=255) taaaTATTCTGTGTGCCC‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGTTTTCCCTGAAAAATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGcc < 2:476227/148‑1 (MQ=255) ttatTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATAGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTAATCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAATTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATCATCGTCTTGTTTGCCGAAc > 1:528909/2‑151 (MQ=255) atTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAcc > 2:321468/1‑150 (MQ=255) cTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCatat > 2:1065427/1‑151 (MQ=255) cTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCatat > 1:1020332/1‑151 (MQ=255) gtgtgCCC‑CTATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGc < 1:708294/151‑1 (MQ=255) gtgtgCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGc > 1:104412/1‑151 (MQ=255) tgtcCCC‑CCATTATTTATGTTTTTTGCCGCTTTTCCTGAACCACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATg < 1:686031/149‑1 (MQ=255) ca‑ccaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTAt > 2:146292/1‑151 (MQ=255) attaattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 1:772050/1‑151 (MQ=255) taattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTa > 2:1060122/1‑150 (MQ=255) aTGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAAt < 2:918426/148‑1 (MQ=255) tGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGacc > 1:94593/1‑151 (MQ=255) ggTATTTGTCGCTTTCCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGac < 2:599562/149‑1 (MQ=255) ggTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGacc > 1:1100079/1‑150 (MQ=255) cgcgTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc > 2:159925/1‑151 (MQ=255) tttCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGtt < 1:440679/143‑1 (MQ=255) ttCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCa > 1:1074725/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCa > 2:212241/1‑150 (MQ=255) aaCATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTg < 1:1163003/151‑1 (MQ=255) aTCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCt > 2:470061/1‑151 (MQ=255) | AGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCA‑CCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCT > NC_000913/2781496‑2781788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |