Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,350,853 | 0 | A | C | 56.7% | 70.0 / 97.9 | 67 | S725A (TCA→GCA) | arcB | aerobic respiration control sensor histidine protein kinase, cognate to two‑component response regulators ArcA and RssB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/6); new base C (0/38); total (23/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.95e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.64e-10 |
TTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGTTC > NC_000913/3350704‑3351003 | ttttGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGAc > 1:1062283/1‑151 (MQ=255) gCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGAcccc < 2:32770/150‑1 (MQ=255) cacccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCccgcc < 2:75320/151‑1 (MQ=255) acccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCccgccg > 1:300785/1‑151 (MQ=255) cACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAtttt > 1:831487/1‑150 (MQ=255) ttCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGt > 2:639750/1‑151 (MQ=255) tCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc > 1:27299/1‑151 (MQ=255) aCGTCGTGACGCCCCTCTTCTTTCATCTCTAAAATCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGTCTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcct < 2:318939/150‑1 (MQ=255) tcgtGCCCCCCCTCTTCTTTCATCTCTTCAACCCATCCCCCGCCGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTAt < 2:355645/142‑1 (MQ=255) gtgccccccctctTCTTTCATCTCTCAAACCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTT‑GAAGATGGCGTAACCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttc < 2:1086410/138‑1 (MQ=255) ccccccttttcttcCATCTCTCCAACCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTAATTTTGCTGACCCAGCTGTT‑GAAGATGGCGAAACCCCCCGGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtccttcc < 2:1179378/136‑1 (MQ=255) cccccctctTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGAGGGCGTAACCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaacaa < 2:898273/146‑1 (MQ=255) cccccctctTCTTTCATCTCTACAACCCATCCCCCGCCGTTATCTCCCCAGGCCGAAAGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCATTTTTT‑GCAGATGGCTCACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaa < 1:130364/143‑1 (MQ=255) ccccctctTCTTTCATCTCTACATCCCATCCCCCGACTTTTTCTCCCCAGGCGGGAGGGTCAGGAGACTGATTTTGCTTCCCAATCTGTT‑GCAGATGCCGTAACCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaacaa < 1:144996/146‑1 (MQ=255) cccctctTCTTCCATCCCTTCATCCCATCCCCCGCCTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGACGGGAGACTGATTTTTCTGCCCCATCTGTT‑GAAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATg < 1:142906/148‑1 (MQ=255) aCTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGcc > 2:806888/1‑151 (MQ=255) tcttTCCTCTCTCCAACCCATCCACGAACTTTTTCTCCCCAGGCCGGAGGGTCGGGAGACTAAATTTGCTGACCCAGTTGTT‑GCAGATGCCTTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCttt < 2:1157949/149‑1 (MQ=255) tttCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt > 2:377814/1‑150 (MQ=255) tttCATCTCTTCAATCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGTTCAGGAGACTAATTTTGCTCCCCCAGTTTTT‑GCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCGtttt < 1:975246/148‑1 (MQ=255) tttCATCTCTCCTCCCCATCCCCCGCCGTTATCTTCCCGGGCCGAAAGTTCAGGAGATTGATTTGGCTGACCCATCTTTT‑GCAGATGGCTAACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtt < 1:977394/146‑1 (MQ=255) ttCATCTCTTCAATCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTCCCCCATTTTTT‑GCAGATGGCTTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt < 1:189323/149‑1 (MQ=255) ctTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgcgc > 2:19820/1‑151 (MQ=255) ctTCAACCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGCCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgc < 2:1058962/149‑1 (MQ=255) aacccATTCCCGGACTTTATCTCCCAGGGCGGGAAGGTCGGGAGACGAAATGTGCTCCCCCAGTTTTT‑GCAGTGGCCGTACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGcc < 1:432149/145‑1 (MQ=255) aacccATCCCCCGACGTTATCTCCCCGGCCCGGAAGGTCAGGAGACTAAATTTGCTGCCCCAGTTGTT‑GAAGAGGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCg < 1:441907/146‑1 (MQ=255) aacccATCCACCGACGTTATCTCCCCAGGCGGGAAGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGTTTTT‑GAAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCg < 2:945295/146‑1 (MQ=255) accctttCACCGACGTTATCTACCAAGACCGGAGTGAAAGGAGCATAAATTTCCTCCCCTAGCTTTT‑GCAGGGGGCATACCCCCATTTCCTCCGCCGCCCCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCa < 1:945692/146‑1 (MQ=255) ccccGACTTTTTTTTCCCAGGCGGGAGGGTCGGGAGACTAAATTTGCTACCCCAGTTTTT‑GCAGATGGCGTAACCCCTCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGa < 1:496800/149‑1 (MQ=255) ccccGACTTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGTTTTT‑GCAGAGGGCGTAACCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGAtt < 1:621159/146‑1 (MQ=255) ccccGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTCAGGAGACTAAATTTCCTCCCCCAGTTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 1:643235/147‑1 (MQ=255) cACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCg > 2:911037/1‑150 (MQ=255) tATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCAc > 2:769413/1‑151 (MQ=255) tctcCCCGGGCCGGAGGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGTTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACg < 1:443376/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGGGAAGGTAAGGAGACTAAATTTGCTGACCCAGCTGTG‑GCAGAGGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCt < 2:833210/148‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGAc > 2:743395/1‑151 (MQ=255) ggCCGGAAGGTCAGAAGACTGATTTTCCTCCCCCAGTTTTT‑GAAGATGGCGAACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATa < 1:21397/150‑1 (MQ=255) cGGAGGGTCAGGAGACTTAATTTGCTGCCCCAGCTGTT‑GCAGAGGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATa < 1:1092655/147‑1 (MQ=255) cGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGccc > 1:1060618/1‑151 (MQ=255) ggAGGGTCGGGAGACTAATTTTCCTGCCCCTTCTTTT‑CAAGATGGCATACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACAt < 1:735368/145‑1 (MQ=255) aaGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGc > 2:121389/1‑151 (MQ=255) ggAGACTGATTTTGCTCCCCCAGTTGTT‑GCAGAGGGCGTACCCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGcatca < 1:728453/148‑1 (MQ=255) gagaCTGAATTTCCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtct < 1:926959/150‑1 (MQ=255) agaCTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtct < 2:663418/149‑1 (MQ=255) agaCTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtcttc > 2:363579/1‑151 (MQ=255) cTGAATTGGCTGCCCCAGCTGTT‑GCAGATGGCTTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtcttct < 2:896221/149‑1 (MQ=255) taattttcccaCCCAGCTTTTGGCAGTGGCCGTACCCCCCCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtcttct < 1:587860/138‑1 (MQ=255) gcaTTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCaa > 1:748747/3‑150 (MQ=255) gAATTTGCTAACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCaa > 2:868832/1‑150 (MQ=255) attttGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGAGGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCa < 1:564747/146‑1 (MQ=255) aaTTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAac > 2:394983/1‑151 (MQ=255) aTTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTAACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAac > 1:667986/1‑150 (MQ=255) tttGCTCCCCCAGCTGTT‑GCAGAGGGCGTACCCCCCCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCAtcttct < 1:61991/144‑1 (MQ=255) cTGCCCCAGCTTTT‑GCAGATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCg < 2:847461/149‑1 (MQ=255) tgccccAGTTGTT‑GCAGAGGGCGAACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCg < 1:732751/145‑1 (MQ=255) cccAGCTGTT‑GCAGAGGGCTTACCCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACAcc < 2:661277/144‑1 (MQ=255) cAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCg > 1:115499/1‑151 (MQ=255) tGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCgg > 2:1119959/1‑151 (MQ=255) gTT‑GCAGAGGGCTTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCg < 2:168213/149‑1 (MQ=255) tt‑GCAGAGGGCGAAACCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGt < 2:1143894/150‑1 (MQ=255) t‑GCGGATGCCTTACCCCCCCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTg < 1:450482/150‑1 (MQ=255) gATGGCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCa < 1:790093/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGc > 1:869048/1‑151 (MQ=255) ggCGTACCCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCtt < 1:947781/151‑1 (MQ=255) gCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTc > 1:798110/1‑151 (MQ=255) cccccACTGCCCCCGCCGCACCTTCAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTcc < 2:570142/150‑1 (MQ=255) ccccccTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGt < 2:244134/148‑1 (MQ=255) aCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACa > 2:709368/1‑150 (MQ=255) aCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGTTc > 1:93137/1‑151 (MQ=255) | TTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTT‑GCAGATGGCGTAACCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGTTC > NC_000913/3350704‑3351003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |