| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,536,197 | 0 | A | T | 42.2% | 84.1 / 62.0 | 71 | intergenic (+166/+417) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (6/35); new base T (30/0); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.37e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTG > NC_000913/4536047‑4536342 | cATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTa < 2:261048/151‑1 (MQ=255) aTGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAg < 2:1058803/151‑1 (MQ=255) gATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTgg > 2:776914/1‑150 (MQ=255) aCAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAAt < 1:772742/150‑1 (MQ=255) gAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTTGGATgaaa > 2:429313/1‑150 (MQ=255) agtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATgaaagaaa < 1:772972/150‑1 (MQ=255) ggaaaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGTTTTTATTAATtaaaaa > 1:1068046/3‑145 (MQ=255) aaaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgc < 2:976946/151‑1 (MQ=255) aGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATgcaa < 2:90386/151‑1 (MQ=255) aGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTCATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTTGGATGaaaaaaaaagaa > 2:36525/1‑146 (MQ=255) tatTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGGATTTAAAAAAAAgcaaacaa > 2:840091/1‑149 (MQ=255) ttttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGTAGCTTTTTGGACTGAAAGaaaaaaaaagaaata > 1:87096/1‑138 (MQ=255) ttccAATGTTAAGGTGACTTTCCGTTTTATTTCGAGTCGCCTTACCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCAAGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAATCAataatat < 1:144573/148‑1 (MQ=255) tACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatat < 1:358170/150‑1 (MQ=255) tACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatat < 1:558976/150‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatataa < 2:1009353/151‑1 (MQ=255) aCCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatata < 1:429310/150‑1 (MQ=255) ccAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAataatataat < 2:793583/151‑1 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTGGATGAAAAAAAAAAAAAACAataata > 1:489564/1‑144 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATg < 2:478571/150‑1 (MQ=255) tAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGAATGAAAGAAAAAACAAGCAAAAATAtaataaaagcc > 2:179927/1‑146 (MQ=255) tAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGc < 1:739668/150‑1 (MQ=255) aaGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTGTTTGGAATGGAAAAAAAATCAAGGGATAAAAtaaaaa > 2:279234/1‑145 (MQ=255) gACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGAATGAAAAAAAAAACAAGCAATAATATAATAATAGCCTAAttt > 2:544253/1‑151 (MQ=255) aCTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTGAATGAAAAAAAAAACAAACAAAAATAtaaaaaaaggcgaatttt > 1:156884/1‑139 (MQ=255) aCTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTc < 2:926088/151‑1 (MQ=255) cTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAAAAAAAGGAAACAAAAATATAATAAAGGCCTAAttttt > 2:468900/1‑149 (MQ=255) tttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTTGATTAAAAAAAAAGAAAACAATAATATAATAAAGGGCTAAtttttt > 1:171840/1‑151 (MQ=255) ttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCtt < 1:894381/150‑1 (MQ=255) ttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCtt < 1:1107899/150‑1 (MQ=255) ttCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCt < 2:4324/149‑1 (MQ=255) tCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTGGATTAAAAAAAAAAAAAACAATAATATAATAAAAGGCTTATttttttt > 1:698916/1‑150 (MQ=255) ttttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGTGATGAAAAAAAATGCACGAAAAAAAATAATAAAAGACTCATtttttt > 2:1174767/1‑146 (MQ=255) tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTGAATGAAAAAAAAAACAAGGAAAAAAATAATAAATGGCTAATTTCttt > 2:45466/1‑145 (MQ=255) gTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGTATTAAAAAAAAAGCAAGCAATAAAATAAAAAAGGACTAATTTTTTTTTAAATCAtttaaca > 1:201098/1‑145 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGGATGAAAAAAAAAGCAAGCAATAATATAATAAAAGGCTAATTTTTTTTTACATCATTAAACata > 2:1173421/1‑150 (MQ=255) cTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTGTATTAAAAAAAAAACAAACAATAAAAAAATAAAAGCCCTATTTTTTTTTAAATCATTTAGCa > 1:559301/1‑145 (MQ=255) tttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGGTTTTTGAATGAAAGAAAAAAAAAGCAATAAAATAAAAATTGGCTAATTTTTTTTTAGATTATTTAAAATatcat > 2:17073/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcatc < 2:1091908/150‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcatca < 2:483215/150‑1 (MQ=255) tCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATatcatca < 2:968584/150‑1 (MQ=255) tGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTTGAATTAAAAAAAAAGAAAACAATAATATAAAAAAAACCTAATTTTTTTTTAAATCATTAAACATATCATCATCGt > 1:139846/1‑151 (MQ=255) aTTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCt < 1:337680/151‑1 (MQ=255) ttATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAca < 1:428031/126‑1 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTTCATTAAAAAAAAAACAAAAAAAAATATAAAAATGGGTTCATTTTTTTTAACATTATTTAACATATCATCATCCTCTAtt > 1:488423/1‑151 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCg < 1:424513/145‑1 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAt < 2:256445/150‑1 (MQ=255) ataAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTGAATGAAAAAAAAAGCAAGCAATAATATAAAAAAAGCCTAAATTTTTTTTACATCATTAAACa > 2:424516/1‑134 (MQ=255) aaaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTTAATTAAAAAAAAAGCAAGAAAAAAAATAAAAAAAGCCTTATTTCTTTTTAAATCAATAAAAATATAATTATAGTCTAttt > 1:625873/1‑150 (MQ=255) aaaTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTAttt < 1:216423/150‑1 (MQ=255) aTCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTGGATTAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAATAAAAATAGGCTTATTTTTTTTTAAATAATTAAACATATAATCATCGTCTAttttt > 1:1077916/1‑148 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCa < 2:139848/148‑1 (MQ=255) tATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGGATGAAAAAAAAAGCAAACAAAAATATAATAAAAGCCTAATTTTTTTTAAAATCATTAAACATATCATCATCGTCTATTTTTCAGa > 2:818013/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAAt < 1:524465/151‑1 (MQ=255) ttACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGt < 2:746366/150‑1 (MQ=255) aCCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGa < 1:53103/151‑1 (MQ=255) ccTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGAATGAAAAAAAAAACAAGAAATAAAATAATAATAGGCTAATTTTTTTTTACATCATTAAGAATATCATCATCGTCTATTTTCCAGAATCCGTCGAc > 1:190520/1‑151 (MQ=255) aaTCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTta < 1:592765/151‑1 (MQ=255) aTCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGTTTTTTTTGTTGATAAAAAAAGTAAACAAAAAAATAAAAATAAAGTCATTTTTTTGAATAAAAATAAGAATATCATCCTCGTCTATTTTCCAGAATACCTCGCCTtat > 1:167391/1‑151 (MQ=255) ttCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCg < 2:268269/150‑1 (MQ=255) tttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGGGCTTTTTGG‑ATGAAAAAAAAAGCAAGCAAAAAAAAAATAAAAGGCTTATTTTTTTTTAAAACATTAAACATATAATCATCGTCTATTTTTCAGAATACGTCGCCTTATaaactc > 1:92907/1‑143 (MQ=255) aTAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCCTTTTGGGATGAAAAAAAAAACAAGAAATAATATAAAAAAAGGCCAATTTTTTTTAAAATCATTAAACATATTATCATCCTCTATTTTTCAGAATCCGTCGACTTTTAATAACCAGAACgg > 2:405585/1‑150 (MQ=255) aTGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCata < 1:949875/151‑1 (MQ=255) aTGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTGGAAAGAAAAAAAAATCAAACAAAAAAATAAAAAATGGCTAATTTTTTTTAAAAACATTAAACATATCATTATCCTCTATTTTCCAGAATCCCCCGACTTATAATACCCACAACGGCa > 2:395536/1‑149 (MQ=255) 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gCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtgt > 2:999080/1‑151 (MQ=255) cTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtgtg > 2:616707/1‑151 (MQ=255) cTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtgtg > 1:399781/1‑151 (MQ=255) | CATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAGAAAATGCAAGCAATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCATATCATCATCGTCTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTG > NC_000913/4536047‑4536342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |