Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 41.3% | 99.0 / 13.2 | 64 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative DASS family tricarboxylate or dicarboxylate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/6); new base C (0/26); total (31/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGG > NC_000913/801969‑802263 | tAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATCGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTTGTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGC‑GCGTTTaaaa > 2:839855/1‑150 (MQ=255) gCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAa‑ccac < 1:1035151/151‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCAccgccg > 2:953948/1‑151 (MQ=255) tGGGTGTTTTTTGGTTTTTACCTGGCGGCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCT‑TTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCGGTTGCTCCCTCATTGGTGGTGGTGGGTAAT‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTAtt < 2:362573/149‑1 (MQ=255) tttttGGTATTTACCTGGCGGCCTTTGTGGGGCTGTTTATCAAGCC‑TTTCCCGGACCCTGTCGTATTTTTATTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTACCCGAGGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGtt < 2:1063317/150‑1 (MQ=255) ttttGGTATTTCCCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGAGGGT‑GCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTa < 1:767436/150‑1 (MQ=255) tttGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTAct > 2:721675/1‑151 (MQ=255) tATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 2:587630/1‑150 (MQ=255) aTTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:731407/1‑149 (MQ=255) aTTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:68983/1‑149 (MQ=255) aTTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:105724/1‑149 (MQ=255) tttCCCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAg < 1:413139/150‑1 (MQ=255) tttCCCTGGCGCCCTTTGTGGGGGGGGTTATCAGGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCGGTTGCTGCCTCAATGGTGGGGTTGGGTACC‑TTACCCGACGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAg < 2:1068849/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCT‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCGGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGCCGGG‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTac < 1:209085/150‑1 (MQ=255) ggcCTTTGTGGGGCTGTTTATAAGGCC‑TTTCCGGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCTTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTACC‑TTACCCGACGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACct < 1:890592/149‑1 (MQ=255) cATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctg > 2:580364/1‑151 (MQ=255) ttGTGGGGCTGGTTATCAAGCT‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GGGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctgg < 1:477322/150‑1 (MQ=255) tgtgGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgtg > 1:229124/1‑151 (MQ=255) tgtgGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGgt > 1:932368/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGTTATCAAGCC‑TTCCCCGGAACCTGTCTTATTGTTAATGCCCGTTGCTGCCTCAATGGGGGGGTTGGGTATT‑TTATCCGACGGT‑GCTTTTAAAC‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGtt < 1:868237/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCg > 2:845495/1‑151 (MQ=255) ggTTATCAAGCT‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTATC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGc < 1:607258/150‑1 (MQ=255) ggTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCg > 1:295230/1‑151 (MQ=255) ttATCAAGCT‑TTTCCGGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAT‑TTTTCCGACGGT‑GCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCgg < 1:313389/147‑1 (MQ=255) ttctaaGCCTTTTCCCGGACCTTGTGTTATTGTTAATTGCCGTTGCTCTTTTAATTGTGGTTGTTGGTAAT‑TTCCCCGACGGT‑CCGTTTAACC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtctc < 2:524484/141‑1 (MQ=255) cttttCCCGGAACCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GTTTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa < 1:893799/148‑1 (MQ=255) tttCCCGGACCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTCCCTAAATGGTGGTGGTGGGTAAT‑TTATCCGAGGGT‑GCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTa < 2:125891/148‑1 (MQ=255) ttCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcg > 2:1052664/1‑151 (MQ=255) tccgtgaacccTGTCGTACTTTTAATTCCCGTTCCTGCATACTTGGGGGGGTTCTGTCAC‑TTACCCGACTGT‑GGGTTCAAAC‑CCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTGCCACCTGGCTGTTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgc < 2:39153/141‑1 (MQ=255) tCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcgc > 2:947802/1‑151 (MQ=255) aCCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCACTGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAttt > 2:17812/1‑151 (MQ=255) tGTCGTTTTGTAAATGCCCGTTGCTGCCTCATGGGGGGTGTTCGGTATC‑TTATCGGCGGGG‑GCGTTTAAAT‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTAGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAttt < 2:160955/148‑1 (MQ=255) gTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt < 1:542696/149‑1 (MQ=255) aCTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac > 2:952002/1‑150 (MQ=255) ttATTTGCCTTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAAT‑TTATCCGAGGGT‑GCGTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGt < 2:284163/150‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGtt > 1:878145/1‑151 (MQ=255) taaaTGGCCGTGGCTGCCTCAATGGTGGGGGT‑GGTAACTTTATCCGACGGT‑GCTTTAAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCgg < 1:250302/147‑1 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGttt > 2:69865/1‑150 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTACCCGCCGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGtt < 1:21878/149‑1 (MQ=255) ccgtgtctgcTTCATTGGTGTTGCTCGGTAGT‑TTGTCCGCCGGT‑GGGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 2:1055475/144‑1 (MQ=255) tgcCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGCCGGT‑GCTTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg < 1:132676/147‑1 (MQ=255) ccggaaTGTTGGTGTTCGTTAAC‑TCAT‑CGGCGGTGGCTTTTAAGC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTg < 2:328551/146‑1 (MQ=255) aaTGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt > 1:288510/1‑151 (MQ=255) aaTGGTGGGGGTCGTTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt < 1:217254/151‑1 (MQ=255) gggtggtggtCGGTATC‑TTACCCGCCGTT‑GCTTTAAAAA‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATct < 2:232726/150‑1 (MQ=255) tggtggtCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgct > 1:798054/1‑151 (MQ=255) tggtggtCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgc > 2:257875/1‑150 (MQ=255) tggtCGGTATC‑TTTCCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGa < 2:315501/150‑1 (MQ=255) tCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTgg > 2:471491/1‑151 (MQ=255) cGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt > 1:201764/1‑151 (MQ=255) aaC‑TTATCCGACGTT‑GCGTTTAAAC‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCTGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa < 2:148840/150‑1 (MQ=255) ttATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGc > 2:419968/1‑128 (MQ=255) ttACCCGACGGT‑GCGTTTAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGc < 1:419994/128‑1 (MQ=255) ccGACGGT‑GCTTTAAAAC‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCg < 1:953997/147‑1 (MQ=255) ccGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTa > 1:1045874/1‑150 (MQ=255) gACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAac > 2:778835/1‑150 (MQ=255) gcgggggctttAAAATCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGACTGGTGTTCTCTGCGTTTGCCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAaca < 2:437761/143‑1 (MQ=255) atggttcttttAAAC‑CCGCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCCGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAac < 2:903278/141‑1 (MQ=255) 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gTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctg > 1:77905/1‑151 (MQ=255) gTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATCTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctg > 1:918044/1‑151 (MQ=255) tAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGctggg > 2:186108/1‑150 (MQ=255) aa‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt < 1:850047/112‑1 (MQ=255) aa‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt > 2:849999/1‑112 (MQ=255) | TAAGCGAACTGGCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCC‑TTTCCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAAC‑TTATCCGACGGT‑GCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCACGCTGGG > NC_000913/801969‑802263 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |