Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,542,564 | C→T | H720Y (CAT→TAT) | feoB → | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,542,564 | 0 | C | T | 98.6% | 272.9 / NA | 71 | H720Y (CAT→TAT) | feoB | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (36/33); minor base G (0/1); total (37/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGCATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAACCCGCAAGTCGGTAAGCAGTTGCTGCGCAGCCAGCACCA > NC_000913/3542416‑3542711 | cGTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTAt > 1:466751/1‑151 (MQ=255) gTCCTGCTGTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATc < 2:198116/151‑1 (MQ=255) tgctgTATGTACCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAAc > 2:727842/1‑151 (MQ=255) gtatgtaCCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTa < 2:451944/150‑1 (MQ=255) tatgtaCCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTAGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTAc > 2:72479/1‑150 (MQ=255) atgtaCCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTAc > 2:469372/1‑149 (MQ=255) atgtaCCATGTATCTCGGAGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCATAATCCAACTTa > 2:717753/1‑148 (MQ=255) tgtaCCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGc > 1:817653/1‑151 (MQ=255) taCCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCt > 2:874172/1‑151 (MQ=255) taCCATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCt > 2:283305/1‑151 (MQ=255) ccATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTgg > 1:549568/1‑151 (MQ=255) cATGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGgt < 2:966882/151‑1 (MQ=255) aTGTATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGgtg > 1:678351/1‑151 (MQ=255) tATCTCGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGc > 2:35985/1‑151 (MQ=255) ctcGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCAtt > 2:820690/1‑151 (MQ=255) tcGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTc > 2:470199/1‑151 (MQ=255) cGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCAtt < 2:1053773/149‑1 (MQ=255) cGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCAtt < 1:1067329/149‑1 (MQ=255) cGGTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTc < 2:136826/150‑1 (MQ=255) cGGTGATAGCGGCTATCGTACGTGACTCAAGCCGCGGCTGGATGGGCTTCTCCCTCCTGAGGGGGCTGGATGACCCTTACTCACTGGCAACAATGGTCAATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCACATTACAGCCTGGTGTGCATTCt > 2:197097/1‑151 (MQ=255) ggTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTg > 1:420142/1‑151 (MQ=255) ggTGATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTg > 1:934272/1‑151 (MQ=255) gATGGGGGCTATCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCg > 1:894867/1‑151 (MQ=255) aTCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGt < 1:551639/151‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGt < 2:131010/151‑1 (MQ=255) cccGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTaa < 2:604354/151‑1 (MQ=255) cGTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAAc > 2:167700/1‑150 (MQ=255) gTGAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACAt > 1:5416/1‑151 (MQ=255) gAATCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATc < 1:500951/150‑1 (MQ=255) aaTCAAGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGt < 1:33412/151‑1 (MQ=255) aaGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGtt > 1:770568/1‑151 (MQ=255) aGCCGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGtt > 2:823957/1‑150 (MQ=255) gacGTGGCTGGATGGGCTTCTCCATCCTGGGGGGGCTGAATATCGATTAGTAACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTGATCCCGTTTAACAACGTgg > 2:283046/3‑147 (MQ=255) 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cTGGATGGGCTTCTCCATCCCGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTct > 2:785991/1‑150 (MQ=255) ggATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTTCAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTctgct < 2:933469/151‑1 (MQ=255) ggATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTctgct > 1:1007633/1‑151 (MQ=255) gATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTctgctg < 2:336696/151‑1 (MQ=255) gATGGGCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTctgctg < 1:177222/151‑1 (MQ=255) gggCTTCTCCATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTgcgc < 1:235984/151‑1 (MQ=255) ccATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCcgcgc < 1:134407/148‑1 (MQ=255) cATCCTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGt > 1:419401/1‑151 (MQ=255) ccTGTGGGGGCTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAg < 1:161779/150‑1 (MQ=255) cTGAATATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGat > 2:536287/1‑150 (MQ=255) aaTATCGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGGGGATATCg > 2:365429/1‑151 (MQ=255) tatCGCTTACTCTCTGGCGACGTTGTTCTATCAGGTCGCCCGCTACAGTCAGTATCCACCTTACAGCCTGGTGTGCATTCCGGCGGTTAACTTTTTTAACATCGAGGTTATTGGTCTGCTGCGCCGCGAGCCTGGCCGGGTGGGTATCGa > 2:341411/1‑150 (MQ=255) cGCTTACTCACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAAct < 2:768472/150‑1 (MQ=255) cACTGGCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAAc > 1:885358/1‑151 (MQ=255) ggCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAAccc < 2:256169/149‑1 (MQ=255) ggCAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAACCCg < 1:798483/150‑1 (MQ=255) cAACATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAACCCGCa > 1:552340/1‑150 (MQ=255) aaCATTGTTCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAACCCGCAAg < 1:710241/151‑1 (MQ=255) tCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAACCCGCAAGTCGGTaa < 1:951592/150‑1 (MQ=255) tCTATCAGGTCGCCAGCTACAGTCAGTATCCAACTTACAGCCTGGTGTGCATTCTGGCGGTTATCCTGTTTAACATCGTGGTTATCGGTCTGCTGCGCCGCGCGCGTAGCCGGGTGGATATCGAACTGCTGGCAACCCGCAAGTCGGTa > 2:839402/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |