Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,780,291 | G→A | G812G (GGC→GGT) | ypjA ← | adhesin‑like autotransporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,780,291 | 0 | G | A | 98.6% | 257.2 / NA | 72 | G812G (GGC→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (36/35); total (36/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTGCCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTG > NC_000913/2780143‑2780432 | cATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTAcc > 1:165701/1‑151 (MQ=255) ttATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACCCCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCt < 1:633858/150‑1 (MQ=255) ttATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTg > 1:179398/1‑151 (MQ=255) gTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGc > 2:65733/1‑150 (MQ=255) gACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTg > 2:962216/1‑151 (MQ=255) cTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGc > 2:632632/1‑151 (MQ=255) tGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCt > 1:442596/1‑151 (MQ=255) gCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCttttgt > 1:761377/1‑151 (MQ=255) gCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCC‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCCCCCCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCttt < 2:443889/148‑1 (MQ=255) cctctttCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCTTTAATTTTTGTCTCATTCGCCACCCCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCttttgttttg < 2:138224/145‑1 (MQ=255) ccTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACg > 2:943909/1‑150 (MQ=255) cTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGAt > 1:367257/1‑151 (MQ=255) tCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGAtct > 1:393533/1‑151 (MQ=255) aTTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGAtctc < 1:673072/150‑1 (MQ=255) ttGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTcc < 1:454165/150‑1 (MQ=255) ttGATCTTTGTTTTTATTCCCTTT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCTTCGTTATTTTTTTTCTCTTCCGCCACGCCCTCTACAATTTGTTCCCCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGAtctc < 1:799872/149‑1 (MQ=255) tGATCTTTGTTGTGATTG‑CTCTGCGGTTGGCTCAAACTTTGTATATGGTGCCGACGTTACTTGTTGCCTCTATCGCTCCGCCCGCGAGTATTTGTACACCGCCGGGGAGGGTCGTGCCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGAt < 2:933621/145‑1 (MQ=255) tGATATTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAAATGTTGTCTCATTAACCACACCCTCGACAATTTTCTCAGCGCCGGTGAGCGTCATACCTGTCGCAGTGGCTGAAGATTTGACGGTCTTCCg > 2:214516/1‑151 (MQ=255) aTCTTTTTTTTTATTCCCTCC‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATGCCGCCGTCTTTAATTTTTGTCTCATTCGCCTCTCCCTCTACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCTTACCTGTCGCAGTGGCTTTTTTTTTGACTATCTCCCGt < 2:525247/150‑1 (MQ=255) aTCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTc > 1:207759/1‑151 (MQ=255) tGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGccc > 2:625303/1‑151 (MQ=255) ttttATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCat > 2:407977/1‑150 (MQ=255) tttATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACCCCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCata < 2:781762/150‑1 (MQ=255) tttATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCatat > 2:470456/1‑151 (MQ=255) tttATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCatat > 1:727505/1‑151 (MQ=255) tttATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCata < 2:152312/150‑1 (MQ=255) ttATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACCCCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCatat < 2:532791/150‑1 (MQ=255) tATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTg > 1:654475/1‑151 (MQ=255) aTTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAACCTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACCCCCCCGACAATTGGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATAtt < 1:104408/149‑1 (MQ=255) ttGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGAc > 1:571225/1‑151 (MQ=255) ctct‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCtgt > 1:511068/1‑151 (MQ=255) tct‑cCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCtgtg > 2:881096/1‑151 (MQ=255) ct‑cCGTTAGCTGAAATTGATTGTATTTTGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCCCCAGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGCGGCTTTTGTTTCTACGATCTCCAGTCCGCCCATATTGACCTgtgt > 2:781438/1‑151 (MQ=255) cGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGtttt > 1:271384/1‑151 (MQ=255) gTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTATTTTTTGTCTCATTCGCCCCCCCCTCGACATTTTTTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGtttt < 2:1025547/150‑1 (MQ=255) gTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTg > 1:460961/1‑151 (MQ=255) ttAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGt > 2:324810/1‑151 (MQ=255) tAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTc > 2:428323/1‑151 (MQ=255) aGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTc > 1:254197/1‑150 (MQ=255) gAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCaga < 1:623947/149‑1 (MQ=255) gAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCaga > 2:468846/1‑149 (MQ=255) aaCTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAagag < 1:605061/151‑1 (MQ=255) gTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGgtg < 1:943958/150‑1 (MQ=255) tGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCt < 1:308660/150‑1 (MQ=255) tGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTg > 1:334591/1‑151 (MQ=255) gTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTg < 2:467717/150‑1 (MQ=255) aTTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACt > 2:944742/1‑151 (MQ=255) gtcgtTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGtt > 1:604944/1‑151 (MQ=255) cgtTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTaa < 2:615389/151‑1 (MQ=255) gtTAATTGTTGTCTCATTCGCCACCCCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTaa < 1:352067/150‑1 (MQ=255) ttgttgTCTCTTTCGCCCCCCCCTCTACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACAcgc < 2:19248/150‑1 (MQ=255) tgttgtCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACAcgccg > 2:46804/1‑151 (MQ=255) tgtCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACgccgcc > 2:717194/1‑150 (MQ=255) cATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGGGTCTGACTCCACGGTTAACACCCCCCCATTTGc > 1:1055109/1‑151 (MQ=255) aTTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGcc > 2:2542/1‑151 (MQ=255) acccccTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCTGGa < 1:470481/148‑1 (MQ=255) cccctccattttGTGCGCCGCCGGTGAGCGTCGTACCAGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGGCAGAAGAGGTGTCTGACTCCTCGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGa < 2:697590/138‑1 (MQ=255) gACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGtt < 1:730112/150‑1 (MQ=255) gACAATTTGTTCAACGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTc > 2:945616/1‑151 (MQ=255) cAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTcg < 2:571194/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTcgccg < 1:254231/151‑1 (MQ=255) tttGTTCTCCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTTGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTcgccg < 2:59695/150‑1 (MQ=255) tCACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCAcc < 2:257856/149‑1 (MQ=255) cACCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCAAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTg > 2:603605/1‑151 (MQ=255) aCCGCCGGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCAccc < 2:5905/148‑1 (MQ=255) cgccgGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTc < 1:97039/151‑1 (MQ=255) cgccgGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTc < 2:65169/151‑1 (MQ=255) cgccgGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTc < 1:470700/151‑1 (MQ=255) gccgGTGAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTCg < 2:777009/151‑1 (MQ=255) gAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCt < 1:332532/150‑1 (MQ=255) gAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTg < 2:745421/151‑1 (MQ=255) gAGCGTCGTACCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTg < 1:226201/151‑1 (MQ=255) | CATTATCGTTGACTGTCAGCGTACCGCCTTCATTGATCTTTGTTTTTATTGCCTCT‑CCGTTAGCTGAAACTGTTTGTATTCCGCCGTCGTTAATTGTTGTCTCATTCGCCACACCCTCGACAATTTGTTCACCGCCGGTGAGCGTCGTGCCTGTCGCAGTGGCTTTTGTTTTGACGATCTCCCGTCCGCCCATATTGACCTGTGTTTTGTCAGAAGAGGTGTCTGACTCCACGGTTAACACGCCGCCATTTGCCAGCAGGATATTGTTCGCCGCACCCTGCTCGATGCTG > NC_000913/2780143‑2780432 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |