| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 572,172 | IS2 (–) +5 bp | coding (719‑723/798 nt) | ybcM → | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 572172 = | 0 (0.000) | 51 (1.180) | 45/298 | 0.1 | 100% | coding (719/798 nt) | ybcM | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 572176 | 0 (0.000) | 38 (0.880) | 35/296 | 0.4 | 100% | coding (723/798 nt) | ybcM | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GTTTCTACATTACATCGCCGTCTAGCAAGCGAGGGGGTAAGTTTCCAAAGTATACTGGACGATGTGAGGTTAAATAATGCGTTGTCTGCTATACAAACGACGGTAAAACCTATAAGCGAGATTGCCAGAGAAAATGGTTATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGTCACCGGAGC > NC_000913/572027‑572326 | gTTTCTACATTACATCGCCGTCTAGCAAGCGAGGGGGTAAGTTTCCAAAGTATACTGGACGATGTGAGGTTAAATAATGCGTTGTCTGCTATACAAACGACGGTAAAACCTATAAGCGAGATTGCCAGAGAAAATGGTTATAAGTGTCCTt < 1:591788‑M1/151‑2 (MQ=255)gTTTCTACATTACATCGCCGTCTAGCAAGCGAGGGGGTAAGTTTCCAAAGTATACTGGACGATGTGAGGTTAAATAATGCGTTGTCTGCTATACAAACGACGGTAAAACCTATAAGCGAGATTGCCAGAGAAAATGGTTATAAGTGTCCTt > 1:74443‑M1/1‑150 (MQ=255) tcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTCCTtctc > 2:644613‑M1/142‑150 (MQ=255) 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ccTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttg < 2:614217‑M1/151‑149 (MQ=255) ccTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGTCACCgg < 1:79386/150‑1 (MQ=255) ttggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgct > 1:24603‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTTTCTACATTACATCGCCGTCTAGCAAGCGAGGGGGTAAGTTTCCAAAGTATACTGGACGATGTGAGGTTAAATAATGCGTTGTCTGCTATACAAACGACGGTAAAACCTATAAGCGAGATTGCCAGAGAAAATGGTTATAAGTGTCCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGTCACCGGAGC > NC_000913/572027‑572326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |