| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,393,457 | IS186 (–) +5 bp | coding (231‑235/1614 nt) | mppA → | murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | 30 (0.630) | 27/290 | 1.0 | 100% | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1393461 | 0 (0.000) | coding (235/1614 nt) | mppA | murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit | |||||
CGGCACAGTACTGGCAGAGAAGCAGGAGCTGGTGCGCCACATTAAAGATGAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACA > NC_000913/1393307‑1393607 | agagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggag < 2:28952‑M2/1‑1 (MQ=255)agagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggag < 2:358043‑M2/1‑1 (MQ=255) ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTg > 2:353468‑M2/147‑151 (MQ=255) cAGTACTGGCAGAGAAGCAGGAGCTGGTGCGCCACATTAAAGATGAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGt < 1:696119‑M2/151‑2 (MQ=255) cattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCg < 2:355289‑M2/11‑1 (MQ=255) cattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggacagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTccc > 2:415171‑M2/141‑149 (MQ=255) attacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCgg > 1:423245‑M2/140‑151 (MQ=255) attacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCgg > 1:521734‑M2/140‑151 (MQ=255) cgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGtt > 1:213006‑M2/136‑151 (MQ=255) agagAAGCAGGAGCTGGTGCGCCACATTAAAGATGAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcg < 1:578769‑M2/151‑12 (MQ=255) gtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTg > 2:146754‑M2/135‑151 (MQ=255) gtgccgaagtatccagtacttcgggcttaccaatatgggccaaaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacatcccttaagttagcgcttaagggaGATTGTCCCCGGCGtt < 2:151695‑M2/16‑1 (MQ=255) gccgaagtatccagttcttcgggctgaccagtatgggccagaattgctgaccaggtatcgtgatagtaattcatcgacacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCACGGCGTTGc > 2:568804‑M2/133‑150 (MQ=255) 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aGCTGGTGCGCCACATTAAAGATGAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagg > 1:608433‑M2/1‑129 (MQ=255) ccACATTAAAGATGAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccat < 1:683727‑M2/151‑33 (MQ=255) cgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATg < 1:607829‑M2/38‑1 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATg > 2:641721‑M2/113‑150 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGa < 1:355731‑M2/39‑1 (MQ=255) 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aatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTAt < 1:337930‑M2/48‑1 (MQ=255) aatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTAt > 2:230623‑M2/104‑151 (MQ=255) atatgggccagaattgctgcccagttatcgtgagagtaattcatcgtcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggcGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATc < 2:692305‑M2/49‑1 (MQ=255) gAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg < 1:290877‑M2/150‑45 (MQ=255) gAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg < 2:581083‑M2/150‑45 (MQ=255) 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ttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCa > 2:623315‑M2/21‑149 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAAc > 2:155840‑M2/21‑151 (MQ=255) aTCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatgg > 1:71898‑M2/1‑24 (MQ=255) tCAGAACGAAAAAGGGGGGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggc < 2:83544‑M2/151‑129 (MQ=255) aCGAAAAAGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacct > 1:673706‑M2/1‑18 (MQ=255) aaaaGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaa > 2:290865‑M2/1‑14 (MQ=255) aaaaGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgta < 2:168413‑M2/150‑137 (MQ=255) aaaaGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtc < 1:432869‑M2/119‑106 (MQ=255) aaaaGGGGAGATTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtc > 2:432848‑M2/1‑14 (MQ=255) atgggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCa < 1:353482‑M2/145‑1 (MQ=255) gagaTTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctcc < 1:575673‑M2/149‑143 (MQ=255) gaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCaaaaa < 2:155355‑M2/149‑1 (MQ=255) agaTTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctcc < 2:157031‑M2/148‑143 (MQ=255) aGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCGGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCaaaa > 2:349889‑M2/2‑149 (MQ=255) gaTTGtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat > 1:386061‑M2/1‑5 (MQ=255) gaTTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAAc > 2:429673/1‑150 (MQ=255) | CGGCACAGTACTGGCAGAGAAGCAGGAGCTGGTGCGCCACATTAAAGATGAGCCTGCGTCGCTGGATCCCGCTAAAGCCGTGGGCCTGCCAGAGATTCAGGTCATTCGCGATCTGTTTGAAGGTCTGGTGAATCAGAACGAAAAAGGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACA > NC_000913/1393307‑1393607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |