| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,578,143 | 0 | A | C | 42.4% | 127.0 / 12.7 | 66 | L79V (TTA→GTA) | maeB | malic enzyme: putative oxidoreductase/phosphotransacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/6); new base C (0/28); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.05e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCC > NC_000913/2577999‑2578291 | cGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCa < 2:858620/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGc < 2:973557/151‑1 (MQ=255) gcgcGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCAc < 2:14358/151‑1 (MQ=255) cggcgACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCAccgc > 1:6959/1‑151 (MQ=255) gcgACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ACCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCAccgccg < 2:357509/151‑1 (MQ=255) cgACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGt > 1:249408/1‑151 (MQ=255) cAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GATTTTTTTAAACAGACCGCCCTTGCCTCCC‑ATCCCCGTTTT‑GCCT‑G‑CAAGCGCGCAATTG‑TTGCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGt < 2:214219/148‑1 (MQ=255) cTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGtt > 1:708059/1‑151 (MQ=255) aaTAAATTTGTCGGGGTCGATTTCGTCAACTTCAATGTAAAATCCATCAACCCCGGC‑AAATTTCTTAAAAAGACCGCCTTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCG‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TGGCCAAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTagag < 1:795328/151‑1 (MQ=255) aTAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTag > 1:546142/1‑148 (MQ=255) ttggccggggTCGAGTTCGTAAACTTCAATGTCAAATACATCAACCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGACCTCCCTTCCCTTCC‑ACCCCCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAC‑CCCCAGCCCCGCCGTACCGTTAGAGATCAc < 2:749652/143‑1 (MQ=255) ttGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCg > 2:767707/1‑151 (MQ=255) tGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGc > 2:515096/1‑151 (MQ=255) gggTCGAGTGCTACAAATAAAATATCAAATACACCAACCCCGGG‑AAATTTCTAAAAAAAACCGCCTTTTCCTTCC‑CCCCCGGCTTT‑CCCA‑C‑CGAGCCCCCAAATT‑TGCCCGAC‑CCCCAGAACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGccacca < 2:100824/151‑1 (MQ=255) tCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTc > 1:179665/1‑151 (MQ=255) gTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCgg > 2:1050988/1‑151 (MQ=255) cAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGtat > 1:29598/1‑150 (MQ=255) cAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGtat > 1:244438/1‑150 (MQ=255) aaTGTAAAATACATCAACCCGGGC‑AATTTTCTAAAAAAGAACGCCTTTCCCTTCC‑ATCCCCGTTTT‑GCCT‑C‑CCGCCGCCCCAATG‑TTGCCTAC‑CCCCGGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGt < 2:602311/147‑1 (MQ=255) tGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATAttt > 1:866317/1‑151 (MQ=255) aaaTCCATCAACCCGGGC‑GAATTTCTAAAACAGAACCCCTTTGCCTCCC‑ATCCCCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCATTT‑TTCCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTa < 1:279255/150‑1 (MQ=255) aaaTCCACCAACCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTCCC‑ACCCCCGTTTG‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCAAATG‑TTGCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTa < 1:78225/150‑1 (MQ=255) aaatcATCAAACCCCGC‑CAATTTCTTAAAAAGGACCCCCCTTCCTTCCAACCCCCGTTTT‑CCCT‑C‑CAACCCCCCCATTG‑TCGCCTAC‑CCCCGGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATAttt < 2:15224/143‑1 (MQ=255) cATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCttt > 2:180871/1‑151 (MQ=255) cATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCttt > 2:1004312/1‑151 (MQ=255) accaacccGGCGGATTTTCTTAAACAGAAC‑CCCCTGCCCTCC‑CCCCCCGGTTTCGCCG‑G‑CAAGCGCCCAAATG‑TT‑CCTAACCCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCttt < 1:920141/145‑1 (MQ=255) caaacccggcaatttttCTAAAAAAGCACG‑CCTTTCCCTCC‑CTCCCCGGTTT‑GCCC‑GCCCGGCCCGCCAGTT‑TGCCCTAC‑CCCCGGGACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCtttt < 2:256322/136‑1 (MQ=255) aaccccGGC‑AATTTTCTAAAAAAAAACCCCCTTCCCTCCC‑TCCCCCGGTTT‑GCCG‑G‑CCGGCGCCCCAATG‑TTGCCTAC‑CCCCACCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAAc < 1:931794/148‑1 (MQ=255) accccGGC‑AATTTTCTTAAACAGACCCCCTTTGCCTCCC‑ATCCCCGGTTT‑CCCT‑C‑CCAGCGCCCCAATT‑TTGCCTAC‑CCCCGGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCttt < 1:1002797/144‑1 (MQ=255) cccGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACggg > 2:531299/1‑151 (MQ=255) ccGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGt > 2:987481/1‑151 (MQ=255) gC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCtt > 1:1032219/1‑151 (MQ=255) gAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCtttt > 1:81698/1‑151 (MQ=255) gAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCtttt > 1:936199/1‑151 (MQ=255) tttttaaaaCAGAACCCCCTTCCCTCCC‑ATCACCGTTTT‑GCCG‑C‑CCGGCCCCCCATTT‑TTCCCTAC‑CCCCGGCCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTc < 2:408403/144‑1 (MQ=255) tttCTAAAACAGACCCCCCTTCCCTCCC‑A‑CCCCGGTTT‑GCCTGG‑CCGGCGCGCCGATT‑TTGCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCttttt < 2:749744/149‑1 (MQ=255) aaaCAGAACCCCCTTGCCTCCA‑ATCCCCGTTTT‑CCCT‑C‑CCACCGCGCCAATT‑TTCCCTAC‑CCCCGGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTc < 2:616473/150‑1 (MQ=255) aCAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCa > 1:609975/1‑149 (MQ=255) aGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGAc > 1:906514/1‑151 (MQ=255) aGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGAc > 2:764867/1‑151 (MQ=255) gAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGAc > 1:283300/1‑150 (MQ=255) accccccTTGCCTTCC‑ATCCCCGTTTT‑CCCT‑C‑CCAGCGCCCAAATT‑TGCCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACaa < 1:78206/147‑1 (MQ=255) cccccTTCCCTCCC‑A‑CCCCGGTTTGGCCT‑G‑CCGGCGCGCAAATG‑TTGCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAgg < 2:226780/149‑1 (MQ=255) cGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAgg > 2:122210/1‑151 (MQ=255) gCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGt > 2:267888/1‑151 (MQ=255) cctttGCCTTCC‑ATCCCCGGTTT‑GCCC‑G‑ACGGCCCGCCAATT‑TTGCCAAC‑CCCCAGCCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGt < 1:72499/147‑1 (MQ=255) cTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCg > 2:738061/1‑151 (MQ=255) ccTCCC‑ACCCCCGGTTT‑GCCT‑G‑CCGGCGCGCCAATT‑TGGCCAAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCg < 1:833/147‑1 (MQ=255) cTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAAc > 1:794456/1‑151 (MQ=255) tCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCAACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGc > 2:747010/1‑151 (MQ=255) cctcccccGTTTG‑GCCT‑G‑CGAGCGCGCCATTT‑TTCCCACC‑CCCGACCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGc < 2:509283/144‑1 (MQ=255) ccacccccGTTTT‑GCCT‑G‑CCGGCGCCCAAATT‑TTCCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAAc < 1:39912/142‑1 (MQ=255) cccccGTTTT‑GCCG‑G‑CAAGCGCCCAATTG‑TTCCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCt < 2:673236/146‑1 (MQ=255) cACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGt > 1:798165/1‑151 (MQ=255) ttt‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCAATTG‑TTGCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTa < 1:126425/150‑1 (MQ=255) ccgg‑ccGGCGCCCAAATG‑TTCCCTAC‑CCCCAGCCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAg < 2:873723/144‑1 (MQ=255) cgtgccgccgcgcCGTTG‑TTGCCTAC‑CCCGGAAACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGt < 2:884396/137‑1 (MQ=255) cctcccggcgcccAATGTTTCCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAgg < 2:640839/137‑1 (MQ=255) cAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGcc > 2:531826/1‑151 (MQ=255) cgcccCAATT‑TTCCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGcc < 1:609540/148‑1 (MQ=255) gcgcCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGcc > 2:448057/1‑147 (MQ=255) cgcCAATG‑TGCCCTAC‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGAt < 1:473556/150‑1 (MQ=255) tG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCt > 2:561869/1‑150 (MQ=255) tG‑TTCCCCAC‑CCCCAACCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATcgc < 2:197221/147‑1 (MQ=255) ttGCCTAC‑CCCCAGCCCCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGACAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCt < 1:511499/148‑1 (MQ=255) tGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTgtgt > 2:689665/1‑151 (MQ=255) a‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGcc > 2:833173/1‑149 (MQ=255) | CGAGCGCGGCGACAACTTCAATAAATTTGTCCGGGTCGAGTTCGTCAACTTCAATGTCAAATACATCAATCCCGGC‑GAATTTCTTAAACAGAACGCCCTTGCCTTCC‑ATCACCGGTTT‑GCCT‑G‑CCAGCGCGCCAATG‑TTGCCTAA‑CCCCAGCACCGCCGTACCGTTAGAGATCACCGCCACCAGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCC > NC_000913/2577999‑2578291 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |