Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 231,852 | T→C | V244A (GTA→GCA) | yafD → | endo/exonuclease/phosphatase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 231,852 | 0 | T | C | 99.0% | 403.4 / NA | 103 | V244A (GTA→GCA) | yafD | endo/exonuclease/phosphatase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (60/42); minor base A (0/1); total (60/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAGCGCGGTGGTGGCGTATGA > NC_000913/231704‑231996 | aGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCAc > 2:1138506/1‑151 (MQ=255) aGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCAc < 2:1475066/151‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACt < 1:1109149/151‑1 (MQ=255) ccGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTg < 2:190324/151‑1 (MQ=255) ccGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTg < 1:1421950/151‑1 (MQ=255) cGTAGAAAGAAGAACCGGTTATAACGCTTTGCGCCGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTgg < 1:1260847/151‑1 (MQ=255) tAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGtt > 2:1881185/1‑151 (MQ=255) gAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTAc < 1:591665/151‑1 (MQ=255) gAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTAc > 2:1337846/1‑151 (MQ=255) aaGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTAcg < 1:5387/151‑1 (MQ=255) aGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTAcgc > 2:441049/1‑151 (MQ=255) gAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCt < 1:410428/151‑1 (MQ=255) gAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCt < 2:688120/151‑1 (MQ=255) aaCGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCtt > 2:21200/1‑151 (MQ=255) aCGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTc < 2:781964/151‑1 (MQ=255) cgcgTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTcc > 2:213153/1‑151 (MQ=255) cgTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCg > 2:565238/1‑150 (MQ=255) tatCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATcac > 1:1486605/1‑150 (MQ=255) 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aaTGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGa > 2:814889/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTc < 2:1492118/151‑1 (MQ=255) tCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTc > 2:1982472/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGt > 1:1418382/1‑151 (MQ=255) gCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGt > 1:731834/1‑151 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGt < 1:1174939/150‑1 (MQ=255) gcCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCgg > 2:1884277/1‑151 (MQ=255) gcCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCgg > 2:48240/1‑151 (MQ=255) ccAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGc < 1:1036187/151‑1 (MQ=255) cAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGc > 2:995266/1‑150 (MQ=255) 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ccGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAAc > 1:14735/1‑151 (MQ=255) ccGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAAc < 1:1837223/151‑1 (MQ=255) gTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGt > 2:314611/1‑151 (MQ=255) ggTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCGCTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGa < 2:289737/151‑1 (MQ=255) ggTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTg > 1:998408/1‑150 (MQ=255) tGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAgcgc > 1:2092797/1‑151 (MQ=255) tGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAgcgc > 1:1379677/1‑151 (MQ=255) tGAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAgcgc > 2:1275889/1‑151 (MQ=255) gAACGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAgcgc < 2:80460/150‑1 (MQ=255) aCGTCAGTGAAGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAGCGCggt > 1:2049018/1‑151 (MQ=255) 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aGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAGCGCGGTGGTGGCGTAt < 2:635786/151‑1 (MQ=255) aGCTTCTGCACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAGCGCGGTGGTGGCGTAt > 2:1549564/1‑151 (MQ=255) | AGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAGCGCGGTGGTGGCGTATGA > NC_000913/231704‑231996 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |