Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,794,796 | G→A | E182K (GAA→AAA) | gabP → | gamma‑aminobutyrate transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,794,796 | 0 | G | A | 99.2% | 467.0 / NA | 117 | E182K (GAA→AAA) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (60/56); minor base C (0/1); total (60/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ACCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCGAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGCCGG > NC_000913/2794652‑2794943 | aCCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg < 1:482763/150‑1 (MQ=255) aCCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg < 1:395428/150‑1 (MQ=255) cccTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg > 2:918683/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |