| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,816,407 | G→A | pseudogene (143/669 nt) | rph ← | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,816,407 | 0 | G | A | 99.2% | 496.0 / ‑4.2 | 122 | pseudogene (143/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (50/70); total (51/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGCACGGGCGATCAGACGCTGGATTTCCATTGTGCGTCCACCCTGCTTACCTTTCGCCGCTTCACGAGCGTTACGGGTGTGGGTAGAACGTGGCAGCATGCCGTACTCTGCGGTGATCCAGCCCTGGCCCTGACCTTTCAGGAAGCGCGGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCCTGCTGGACGCATATTG > NC_000913/3816259‑3816553 | gggCGATCAGACGCTGGATTTCCATTGTGCGTCCACCCTGCTTACCTTTCGCCGCTTCACGAGCGTTACGGGTGTGGGTAGAACGTGGCAGCATGCCGTACTCTGCGGTGATCCAGCCCTGGCCCTGACCTTTCAGGAAGCGCAGCACGcc < 1:652355/151‑1 (MQ=255) cGATCAGACGCTGGATTTCCATTGTGCGTCCACCCTGCTTACCTTTCGCCGCTTCACGAGCGTTACGGGTGTGGGTAGAACGTGGCAGCATGCCGTACTCTGCGGTGATCCAGCCCTGGCCCTGACCTTTCAGGAAGCGCAGCACGCcttc < 1:1139898/151‑1 (MQ=255) cGATCAGACGCTGGATTTCCATTGTGCGTCCACCCTGCTTACCTTTCGCCGCTTCACGAGCGTTACGGGTGTGGGTAGAACGTGGCAGCATGCCGTACTCTGCGGTGATCCAGCCCTGGCCCTGACCTTTCAGGAAGCGCAGCACGCcttc < 2:1412788/151‑1 (MQ=255) 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cctgACCTTTCAGGAAGCGCAGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGGAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGcc > 1:2015608/1‑151 (MQ=255) gACCTTTCAGGAAGCGCAGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCctgc < 1:1842234/151‑1 (MQ=255) gACCTTTCAGGAAGCGCAGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCctg < 2:103954/150‑1 (MQ=255) aCCTTTCAGGAAGCGCAGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCctgct > 1:1166380/1‑151 (MQ=255) ccTTTCAGGAAGCGCAGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCctgctg < 1:615799/151‑1 (MQ=255) 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gcgcAGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCCTGCTGGACGCATATTg < 1:736928/151‑1 (MQ=255) cgcaGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCCTGCTGGACGCATATTg > 2:1942862/1‑150 (MQ=255) | AGCACGGGCGATCAGACGCTGGATTTCCATTGTGCGTCCACCCTGCTTACCTTTCGCCGCTTCACGAGCGTTACGGGTGTGGGTAGAACGTGGCAGCATGCCGTACTCTGCGGTGATCCAGCCCTGGCCCTGACCTTTCAGGAAGCGCGGCACGCCTTCTTCAATAGAGGC‑GGTACACAACACTTTGGTATCGCCAAATTCGACCAGCACCGAGCCTTCTGCATGTTTTGTATAGTTACGAGTCAGGGTAACGGGACGCACCTGATTATTGCTACGGCCTGCTGGACGCATATTG > NC_000913/3816259‑3816553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |