| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,350,853 | 0 | A | C | 47.9% | 145.0 / 22.8 | 96 | S725A (TCA→GCA) | arcB | aerobic respiration control sensor histidine protein kinase, cognate to two‑component response regulators ArcA and RssB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/9); new base C (0/46); total (41/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGTT > NC_000913/3350707‑3351002 | tGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGAcccc > 2:1283782/1‑151 (MQ=255) ccacccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCccgc > 3:1139759/1‑151 (MQ=255) cacccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCccgcc > 2:897622/1‑151 (MQ=255) cacccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCccgcc < 2:559861/151‑1 (MQ=255) cacccacGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCccgcc > 3:241958/1‑151 (MQ=255) cGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCt > 2:1551657/1‑151 (MQ=255) gCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCtt > 3:69660/1‑151 (MQ=255) ttCAGCACTTCTCCGTCGTGCCCCCCCTCTTCTTCCATCTCTTCAACCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCGGGCGGGAGGGTCAGGAGATTGATTTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACGGCCCCCGCCGCACCttt < 3:943121/149‑1 (MQ=255) cAGCACTTCTCCGTCGTGCCGCCACTCTTCTTTCATCTCTTAAACCCATCCCCCGCCGTTATCTCCCCGGGCGGGAAGGTCAGGAGACTAAATTTGCGGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCG‑AAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAt < 3:744200/150‑1 (MQ=255) cAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAtt > 3:1401750/1‑151 (MQ=255) aGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAttt > 2:1097195/1‑151 (MQ=255) cACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAAtttt > 2:760895/1‑150 (MQ=255) ttCTCCGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTAAATCCATTCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCGGGAGGGTCGGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAAtttt < 2:599027/147‑1 (MQ=255) tccgtcgtGCCCCCACTCTTCTTTCTTCTCTTCAATCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGCTTTTGCAGATGGCT‑TAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGt < 2:11854/146‑1 (MQ=255) gtgccccccctctTCTTTCATCTCTTCAATCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGACCCAGTTGTTGCAGATGGCT‑TAC‑CCCCCCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTca < 3:97329/142‑1 (MQ=255) tgccccccctctTTTTCCATCTCTTCAACCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCGGGAAGGTCAGGAGACTGATTTGGCTGCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCT‑TAC‑CCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtc < 2:1154122/134‑1 (MQ=255) gACGCCCCTCTTCTTTAATCTCTTCAATCCTTTCACCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTc < 2:398977/148‑1 (MQ=255) aCGCCACTTTTTTTTCATCTCTTCAACCCATTCCCCGACGTTATCTCCCCGGGCGGGAAGGTCGGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGCTGTTGAAGATGGCG‑TAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaac < 2:544711/150‑1 (MQ=255) cGCCCCTCTTCTCCCATCTCTTAAACCCATACACCGACGTTACCTCCCCGGGCCGAAAGGTCAGAAGCCAGAATTTCCTGACCTGGCTGTTGCAGA‑GGCC‑TAACCCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaac < 2:747238/149‑1 (MQ=255) ccccttttcttTCATCTCTTCAACCCTTCCCCCGCCTTTCTCTCCCCGGGCGGGAAGGTCAGGAGACTAATTTTGCGGCCCCAGTTTTTGCAGAGGGCG‑AAC‑CCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGtcc < 3:523172/132‑1 (MQ=255) cccctctTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATg < 2:993222/148‑1 (MQ=255) cccctctTCTTTCATCTCTTCAACCCATTCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATg < 2:551991/148‑1 (MQ=255) ccACTTTTCTTTCACCTCTAAAATCCTTCCCCCGATTTTACCTCCCCAGGCGGGAGGGTAAGGCGACAAAATTTGTGGCCCCACTTGTTGAAGTTGGCG‑AAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaa < 2:951187/146‑1 (MQ=255) cACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGc > 3:426952/1‑151 (MQ=255) cACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGc > 2:1067709/1‑151 (MQ=255) ctctTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCt > 2:1337032/1‑151 (MQ=255) tcttctTTCATCTCTTCAATCCATACCCCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTAGGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTTTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCGCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTcaac < 2:904132/143‑1 (MQ=255) tcttctCTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtt > 2:1226636/1‑151 (MQ=255) tcttTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCttttt > 2:159541/1‑151 (MQ=255) cttTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt > 2:884791/1‑151 (MQ=255) cttTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt > 2:1470217/1‑151 (MQ=255) tttCATCTCTTCACCCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCGGGCGGGAAGGTCAGGAGACTAATTTTGCTGCCCCATTTTTTGCAGTGGGCT‑AAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCttt < 3:189426/147‑1 (MQ=255) ttCATCTCTTCAACCCATCCCCCGACGTTATCTCCCCAGGCGGGAAGGTCAGGAGACTAAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt < 2:985300/149‑1 (MQ=255) ttCATCTCTCCAACCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCGGGCGGGAGGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGTTTTTGCAGATGGCG‑AAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCtttttt < 3:905571/149‑1 (MQ=255) ctTCAACCCATCCCCCGACTTTCTCTCCCCAGCCCGGAAGGTCAGGAGACTAATTTTGCTGCCCCATTTTTTACAGATGGCG‑TAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTg < 2:404171/148‑1 (MQ=255) ctTCAACCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGCCGGGAAGGTCAGGAGATTAATTTTGCTCCCCCAGTTTTTGAAGGTGGCT‑TAC‑CCCCCCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgcg < 3:899344/150‑1 (MQ=255) accccATCCCCCGCCTTTATCTCCCCGGGCCGGAAGGTCGGGAGCCTGATTTTGCTGCCCCAGTTGTTGAAGATGGCT‑TAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGcc < 3:1278778/145‑1 (MQ=255) accccATCCCCCGACGTTATCTCCCCGGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TCC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCg < 3:105043/146‑1 (MQ=255) aaTCCATCCCCCGACTTTATCTCCCCAGGCCGGAGGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCCCGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTgcg < 2:70490/146‑1 (MQ=255) ccctaccACCGTCTTTATCTCCCCGGGCGGGAAGTTAGGGAGACTAAATTCGCTGCCCCAGTTGTTGCAGGGGGCG‑TAC‑CCCCACTACCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAg < 3:995708/145‑1 (MQ=255) ccATTCCCCGACGTTATCTCCCCGGGCGGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGa < 2:1457658/151‑1 (MQ=255) ccATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTc > 3:1404170/1‑148 (MQ=255) ccATCCCCCGCCTTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGTTGTTGCGGATGGCG‑TAC‑CCCCCCTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCa < 2:746913/149‑1 (MQ=255) cATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCC‑TTTTTATCCTGCGCCGTCAGAtt > 3:916398/1‑151 (MQ=255) tcccccGACTTTATCTCCCCGGGCGGGAAGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGCTTTTGCAGATGGCG‑AAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGAt < 2:1204708/145‑1 (MQ=255) ccccGTCGTTACCTCCCCTGCCCGGAAGGCCAGGAAACTTATTTTGCTGCCCCTGATGTTGAATATGGCG‑TAC‑CCCCACTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 3:1575530/147‑1 (MQ=255) cACCGACGTTATCTCCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGAGGGCG‑TAC‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTc < 2:518691/149‑1 (MQ=255) aCCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGAc > 2:1612354/1‑151 (MQ=255) cGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTc > 3:235732/1‑151 (MQ=255) gACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTcc > 2:275750/1‑151 (MQ=255) actttATCTCCCCGGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCa < 2:914533/148‑1 (MQ=255) cGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTcc > 2:1020744/1‑149 (MQ=255) tCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGc > 3:1008916/1‑151 (MQ=255) ttCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTg > 3:1524732/1‑151 (MQ=255) tCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTg > 2:1005102/1‑150 (MQ=255) ccccAGGCGGGAAGGTCAGGAGATTGATTTTGCTCCCCCATTTTTTGAAGTTGCCG‑ACC‑CCCCCCTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCAc < 3:1003135/145‑1 (MQ=255) cccGGGCCGGAAGGTCAGGAGACTAATTTTGCTGCCCCAGTTGTTGCAGATGGCA‑TAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCAc < 3:1336903/145‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGAGGGTCAGGAGACTGATTTTGCTGCCCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAC‑CCCCACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCt < 2:845820/148‑1 (MQ=255) 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tGCAGAGGGCA‑TAC‑CCCCACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTg < 3:1294346/150‑1 (MQ=255) gATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATc > 2:433841/1‑149 (MQ=255) ggCG‑AAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCa < 2:1229124/147‑1 (MQ=255) ggCA‑TAC‑CCCCCCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCa < 3:303587/147‑1 (MQ=255) cgtccccccACTCCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTc < 2:27306/145‑1 (MQ=255) cgaacccccccTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCt < 3:197104/143‑1 (MQ=255) acccccACGGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTc < 2:427807/149‑1 (MQ=255) ccccccTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCg < 3:271693/146‑1 (MQ=255) ccccccTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCt < 3:323969/151‑1 (MQ=255) ccccACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCt > 2:608737/1‑151 (MQ=255) ccccCTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTa < 3:1135230/151‑1 (MQ=255) cccACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCt > 2:419233/1‑150 (MQ=255) ccccTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTAc < 2:1493577/148‑1 (MQ=255) cACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATGGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTAc > 3:1520224/1‑150 (MQ=255) cACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTAc > 3:1542916/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACaa < 2:1171021/150‑1 (MQ=255) gACCCCGCCGCACCTTTAATTTTCTGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGtt > 2:1562353/1‑151 (MQ=255) gACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGtt > 3:696803/1‑151 (MQ=255) | TGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG‑TAA‑CCCCACTGACCCCGCCGCACCTTTAATTTTATGTCCTTCCTCAACAATGCCTTTTTTATCCTGCGCCGTCAGATTCGACTCCAGCACGCTGACATAGCCCGGCATCATCTTCTCAAACACCGCTAACCCGTCGGTGATCAGCTTCGGTCCTACAAGTT > NC_000913/3350707‑3351002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |