| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,904,286 | Δ122 bp | intergenic (+912/+340) | ygcE → / ← queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2904286 | 2904407 | 122 | 95 [0] | [1] 94 | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2904285 | 0 (0.000) | 68 (1.100) | 59/240 | 0.1 | 100% | intergenic (+911/+462) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| ? | NC_000913 | 2904408 = | 0 (0.000) | intergenic (+1034/+339) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis | |||||
GTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATACAAAC > NC_000913/2904259‑2904558 | gtttatccccgctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacactc > 2:924970‑M2/150‑151 (MQ=255) ttatccccgctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacactct > 1:62947‑M2/148‑150 (MQ=255) tatccccgctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTa > 1:1059328‑M2/147‑150 (MQ=255) atccccgctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTaaa < 2:243774‑M2/6‑1 (MQ=255) ccccgctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACa < 1:682422‑M2/8‑1 (MQ=255) ccgctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATa < 1:227705‑M2/10‑1 (MQ=255) gctggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATaa > 1:337010‑M2/140‑150 (MQ=255) tggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCt > 1:934362‑M2/138‑151 (MQ=255) ggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCt < 1:1145743‑M2/14‑1 (MQ=255) ggcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCt < 1:290147‑M2/14‑1 (MQ=255) gcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCtat < 2:614793‑M2/16‑1 (MQ=255) gcgcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCtat < 2:361130‑M2/16‑1 (MQ=255) gcggggaacacgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCtatt > 1:13459‑M2/134‑150 (MQ=255) 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cgggcgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATg < 1:344583‑M2/28‑1 (MQ=255) cgcacggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGAttt > 2:1091980‑M2/120‑151 (MQ=255) cggaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAGACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTa < 2:593154‑M2/36‑1 (MQ=255) gaatacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAg < 2:261331‑M2/38‑1 (MQ=255) tacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGcc > 2:505593‑M2/111‑150 (MQ=255) tacaaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGcc > 1:451934‑M2/111‑150 (MQ=255) aaagccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTc < 2:527251‑M2/44‑1 (MQ=255) gccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTcaca < 2:1166713‑M2/47‑1 (MQ=255) ccgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTcaca > 1:133401‑M2/104‑150 (MQ=255) cgtgtatctgctcggtttatccccgctggcgcggggaacactggctctgcaacagcagcacccatgaccacgtcggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAAt < 1:278441‑M2/49‑1 (MQ=255) 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tctAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATACAAAc > 2:918608/1‑151 (MQ=255) | GTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATACAAAC > NC_000913/2904259‑2904558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |