Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,270,455 | 0 | G | T | 42.2% | 92.9 / 29.5 | 64 | intergenic (+853/+170) | yhaC/garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/31); new base T (27/0); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
ACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATA > NC_000913/3270312‑3270605 | aCGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctct < 2:718617/150‑1 (MQ=255) ggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTGCTCTCTGtt > 1:456828/1‑150 (MQ=255) gCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGc < 2:381638/151‑1 (MQ=255) cGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTGttttac > 2:726290/1‑147 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑t < 1:12075/151‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCCCTGTTTCA‑C‑t > 1:523438/1‑150 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTc < 2:406510/149‑1 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑gg < 1:115985/150‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGttt < 1:824267/151‑1 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTCTCTCTTTTGCC‑C‑CGGTCGT‑GGGGTTccc > 2:633544/1‑151 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGGTTtcccccc > 1:15573/1‑151 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTcccccc < 2:549842/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTTTTTTGCA‑C‑CCGGCGT‑GGGGTTcccccccc > 2:988271/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCA‑C‑CTGTCCTGGGGTTTccccccc > 2:462540/1‑151 (MQ=255) ttGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCACC‑TGGCCGG‑GGGTTTccccccccgc > 1:945669/1‑146 (MQ=255) ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTTCCTTGCA‑C‑CGGTCGT‑GGGGTTTCCCCCCCCGCGTTTcc > 2:968628/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTAcc < 2:648354/150‑1 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGG‑GGGTTTcccccccccgcctgccctgg > 2:770193/1‑138 (MQ=255) ggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTGTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGA‑GGGGTTTCCCCCCCCGCGTTTcc > 1:472289/1‑147 (MQ=255) gTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCa < 2:979529/151‑1 (MQ=255) gTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCa < 2:594290/151‑1 (MQ=255) ttACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCA‑C‑TGGCCGG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGTTTCCCGGCACCCCGcc > 2:1082784/1‑151 (MQ=255) tACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCGCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGcc < 1:982548/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGTA‑C‑TGGTCGG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTTACTGGCCCCCTGccc > 1:368993/1‑150 (MQ=255) ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCCTTTGCA‑C‑TGGGCGTGGGGGTCCCCCCCCCGGCGTTAcccgcccccccccc > 2:493003/1‑137 (MQ=255) ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTa < 1:247191/151‑1 (MQ=255) ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTa < 1:498480/151‑1 (MQ=255) gCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCGCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGa < 1:893075/151‑1 (MQ=255) aCGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCCCTCCGTTTAA‑C‑AGGGGAA‑GGGGTTCCCCCCCAGCCCGTACCCGGCGACCTGCCCttctgcgcc > 1:626214/1‑143 (MQ=255) aCGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGc < 1:462686/150‑1 (MQ=255) ggACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCA‑C‑TGGTCGT‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCCATTGAGccc > 1:862062/1‑150 (MQ=255) ggACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCg < 1:681071/151‑1 (MQ=255) aCTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGa < 2:367514/151‑1 (MQ=255) ttACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCA‑C‑TGGTCGT‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGGTTCCTTGCACCCCGCCCCATTGGGCCCCGGCttt > 1:1102470/1‑151 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTGTTTCC‑C‑TGGGCGT‑GGGGTTTCCCCCCCCGCGGTTCCTTGCACCCCGCCCCCTGGGGCCCCGACttt > 2:683894/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGTTACCCGGCACCCCGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcc > 1:661372/1‑151 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcc < 2:1005948/151‑1 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcc < 1:652408/151‑1 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGATTTCTCTCTTTTGCA‑C‑CGGTGGC‑GGGGTTTCCCCCCCCGCGGTTCCTCGCACCCCGCCCCATGGAGCCCGGGCttt > 1:164889/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCGCGGTGCGCTCTTCCCGCACCTTTTCCCCCTTCCCGGATCCCGCTTGCGCGGGCCACCGCCGGTTTGCTTCCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTT‑CCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcct < 1:173595/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCC‑C‑TGGGCGT‑GGGGTTCCCCCCCCCGCGTTACCTTGCCCCCCGCCCCTTGGAGACCCGGCttt > 2:136685/1‑147 (MQ=255) cgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTcctcccctcc < 2:554933/151‑1 (MQ=255) cgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTCTCCCTTTTGCC‑CACGTTCGC‑GGGTTTCCCCCCC‑CCCGCTACCTGGCACCCCTCCCCCTTGACCCCGGCGTTTtctcccccc > 2:977135/1‑148 (MQ=255) gTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGccc < 1:27940/151‑1 (MQ=255) ctTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTTGTCCCCATTTCG‑C‑CAGGCGG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGTTTCCCTCGACCCTCCCCTTTGGTGTCCCGCCTTTTCCCCCCCCCTccc > 1:586044/1‑144 (MQ=255) ttACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTCA‑C‑TGGTTGT‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTTCCCTGCCCCCTGCCCTATTGGGCCCGGGCTTTTCTCCCCCCCCCCCCGCTcccc > 1:918478/1‑151 (MQ=255) aCCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTccccc < 1:788485/150‑1 (MQ=255) cGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCC‑C‑TGGTCCT‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTACCTGGCCCCCCGCCCTTTTGAGCCCCGGCTTTCCTCCCCCCCCCCCCCCTcccccc > 2:747784/1‑148 (MQ=255) ttCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgac < 1:774025/149‑1 (MQ=255) tCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgacga < 2:208004/150‑1 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCGCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGaa < 1:177367/150‑1 (MQ=255) ccTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAgc < 1:988309/150‑1 (MQ=255) tGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCA‑C‑CGGTCGT‑GGGGTTCCCCCCCACCCGGTTCCTGGCCCCCCGCCCCCTGGAGCCCGGGCTTTCCTCCCCCCCCCCCCGCTCCCCCCCAGAGGacgacgacgcaaagg > 2:1085636/1‑144 (MQ=255) aTCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTTTCTGTTTCA‑C‑TGGGCGG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTTCCCGGGACCCCGCCCTCTGGGGCCCGGACTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCaga > 2:644809/1‑131 (MQ=255) tCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCA‑C‑TGGTCGG‑GGGGTTCCCCCCCCCGCGGTACCTGGCCCCCCGCCCCATGGGGGCCCGCCCTTTCTCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCAGAAGACGACGGCGAAacggcg > 1:592194/1‑149 (MQ=255) gCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTGTTGCA‑C‑CGGTCGT‑GGGGTTTCCCCCCAGGCGTTTCCTGGCACCCCGCCCCTTGGGGCCCGGACTTTTCTCCCCCCCCCCCCTCTCCCCCCAAGGGGGCGACGACGAAGCGGCGAc > 1:535050/1‑147 (MQ=255) ttGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTT‑CCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGt < 2:55254/147‑1 (MQ=255) tGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCt < 2:1049802/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTTGTc < 1:159854/151‑1 (MQ=255) gCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCtt < 1:700886/151‑1 (MQ=255) tCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgc > 2:706339/1‑151 (MQ=255) cggTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgcgcgc > 2:178544/1‑151 (MQ=255) gTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgcgcgc > 2:804674/1‑149 (MQ=255) tttGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGt > 1:717345/1‑151 (MQ=255) gCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGtata < 1:984481/151‑1 (MQ=255) | ACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCA‑C‑TGGTCGT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATA > NC_000913/3270312‑3270605 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |