| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,781,645 | 0 | A | C | 50.0% | 90.5 / 23.5 | 76 | V361G (GTT→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/6); new base C (0/36); total (30/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.37e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACG > NC_000913/2781503‑2781794 | atttgttgTGTCGGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGc < 2:791530/147‑1 (MQ=255) aTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCAt > 1:1083539/1‑151 (MQ=255) ttgttgTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCAtt > 1:314367/1‑151 (MQ=255) gtCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTAtt > 1:898744/1‑151 (MQ=255) aGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCgg > 2:712051/1‑151 (MQ=255) tttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTc > 2:153715/1‑151 (MQ=255) ttcccccccGTTTTTGATATTTTGCGTCCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATCCCAAATTTTTAAATTTTCTGTGTCCCCCCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCGTTTCCGCCAACATCCAAACCCCCGCCATTATCTAtt < 2:55297/142‑1 (MQ=255) ttccccGCCGTTTTTGATATTTTGCTTCCCGCTGTTGATATGGGTGCTTGTGGTTATGCCATATTTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGTTTTTTGTCGCGTTCCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCggg < 2:1023553/146‑1 (MQ=255) tccccTCCTCTTTTAATATTTTGCGTTCCGTTTTTGATTTTGTTGCCTGTGGTTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTATTTTTGTTATTTGTGGTGTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTc < 2:579483/148‑1 (MQ=255) ccgcctTTTTTTATTTTTTGCCTCCCGCTTTAGATCTTGGTGCTTGTGGTTATGCAATATTTATAAATATTCTGTGGCCCCCCATAAATTATGTTTTTTGGCGTGTTCCCCGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCAt < 2:132866/151‑1 (MQ=255) gcggttttttttatTTTGCTTTCCCTTGTTATTATTGGTGCCGTCGGTTATGCCTAAATTATTAATTTTCTTTGCCCTTCCTTTATTAAGTTTATTTTTAGCGTTACCAGCCCCATCCATATCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCa < 1:1039772/137‑1 (MQ=255) gccgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATc > 1:447845/1‑150 (MQ=255) ccgtTTTTGATTTTTTGCTTCCCGCTGTTGATATTGGTGCTTGTGTCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCCCCATTAATTATGGTATTTGCCGCTTTTCCGGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCa < 2:935503/150‑1 (MQ=255) gcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCt > 1:254280/1‑151 (MQ=255) cTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCG‑TTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATTTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 2:734265/1‑151 (MQ=255) ttttGATTTTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCGGTGTCTATGCAATATTTTTTAATATTCTGTGTCCCCCCATTAATTAGGTTATTTGTCGCGTTTCCGGCAAAAACCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAg < 1:465530/147‑1 (MQ=255) ttttGATATTTTGCGTTCCGTTGTTGATTTTGGTGCCTGTGGCTATGCCATATTTATTAATTTTCTGTGTGCCCCCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCa < 2:559376/146‑1 (MQ=255) ttttGATATTTTGCGTTCCGTTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGc < 1:190328/148‑1 (MQ=255) tttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 1:110184/1‑150 (MQ=255) ttttGCTTTCCGCTTTTAATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCACCATTAATTATGTTATTTGGCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTg < 2:228990/150‑1 (MQ=255) ttttGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTgg > 1:863773/1‑151 (MQ=255) gctttCCGCTTTTAATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATAAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaa < 1:516706/148‑1 (MQ=255) ttCCGTTGTTGATTTTGGTGCCTTTGGCTATGCCATAATTATTAATTTTTTGTGTCCCACTATTAATTTTGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaaa < 2:935049/149‑1 (MQ=255) ttCCGTTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaaaa < 1:1040285/150‑1 (MQ=255) ccgtttttGATTTTGGTGCCTGTGGTTATCCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACt < 2:672508/144‑1 (MQ=255) ccgtttttGATTTTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACt < 1:938227/144‑1 (MQ=255) gCTTTTGATATGGGTGCTGGGGGTTAGGAAATATTTATAAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg < 2:218429/149‑1 (MQ=255) ttGATTTGGGTGCCTGTGCCTATGCAATAATTATTAATATTGTGTAGCCCTCCATTATTTTGGGTTTTTGTCGCGTTCCCAAAAATATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAt < 1:717933/149‑1 (MQ=255) tGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGt > 2:617448/1‑151 (MQ=255) tttgggTGCCTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGCGCCACCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCTTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTc < 1:644157/146‑1 (MQ=255) atTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCt > 2:806778/1‑151 (MQ=255) ggTGCCTGTGTCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTa < 1:99018/151‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTa < 1:643883/151‑1 (MQ=255) ccTGTGGTTATGCAATAATTATAAATTTTCTGTGTGCCCCCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCtt < 2:618882/151‑1 (MQ=255) tATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATc > 2:968931/1‑151 (MQ=255) tATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTaataat < 2:1056945/150‑1 (MQ=255) tGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt > 2:101468/1‑151 (MQ=255) gCCATATTTATAAAGATTATGTGTGCACCCATAATTTAGGGTTTTTGGGCTGTTTCCAACAAAAACCAAAGCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt < 2:868213/150‑1 (MQ=255) ccATAATTATTAATATTCTGTTTCCCCCTATTAATTATGTTTTTGGTCGCTTTTCCTCCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCt < 2:805890/151‑1 (MQ=255) ccATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCt < 1:919460/151‑1 (MQ=255) atatTTATTAATATTCTGTTTCCCACTATTATTTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCtt < 2:858303/150‑1 (MQ=255) aTAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTg > 1:432355/1‑151 (MQ=255) tAATTTTTAATATTCTGTGTCCCCCTTTAAATTATGTTTTTTGTCGCCTTTCCTGAAATACCCATAGCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaat < 2:240655/140‑1 (MQ=255) tAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGt > 2:347818/1‑151 (MQ=255) tAATTATTAATATTCTGTGTACCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGTTTTTCCTGAAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCtt < 2:563444/149‑1 (MQ=255) aaTTATTAATATTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTg < 1:274380/149‑1 (MQ=255) tattaATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTg < 1:1004096/150‑1 (MQ=255) ttaATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCg > 1:946879/1‑151 (MQ=255) aaTATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGa > 2:128524/1‑150 (MQ=255) aaTATTCTGTGTCCCCCCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGa < 1:416700/150‑1 (MQ=255) tgtgCCACAATTAATTAGGTTTTTTGTCGTGTTCCCTGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGc < 1:957143/150‑1 (MQ=255) ccaccaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGttt > 1:889687/1‑150 (MQ=255) ccaccaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGttt > 2:786522/1‑150 (MQ=255) ccaTTAATTATGGTTTTTTTCTCGTTTCCTGCAACATCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCg < 2:384158/144‑1 (MQ=255) ccaTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGt > 1:487932/1‑151 (MQ=255) caattaattaTGGTTTTTGGCGCTTTTCCTCAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATg < 1:952146/148‑1 (MQ=255) attaattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 2:1022950/1‑151 (MQ=255) attaattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCt > 2:756759/1‑151 (MQ=255) taattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGCACCATATGCGTTTATGTCTa > 1:880054/1‑150 (MQ=255) taattaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTa > 1:683792/1‑150 (MQ=255) ttttgttATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTaa < 1:190672/142‑1 (MQ=255) ttaTGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATg > 2:653874/1‑151 (MQ=255) tgtattttGCCGCGTTCCCTGCAACTTCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGac < 1:606591/145‑1 (MQ=255) ggTTTTTGTGGCGTTCCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATg < 1:260865/147‑1 (MQ=255) tttGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCg < 2:873075/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCTTTTCCTGAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGt < 2:828346/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTc > 2:826546/1‑151 (MQ=255) gTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGc > 1:820170/1‑151 (MQ=255) gTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGc > 2:342056/1‑151 (MQ=255) tttCCTGCAACATCCATATCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGc < 2:789724/150‑1 (MQ=255) tttCCTACAACCCCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGc < 2:626259/150‑1 (MQ=255) ccTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCaa < 1:735155/149‑1 (MQ=255) ccTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAac > 2:748950/1‑150 (MQ=255) cTGCAAAACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCa < 2:351842/147‑1 (MQ=255) cATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCt < 2:561922/148‑1 (MQ=255) aTACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCt < 2:1051590/147‑1 (MQ=255) aCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACg > 1:662376/1‑150 (MQ=255) | AATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACG > NC_000913/2781503‑2781794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |