| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,199,680 | IS1 (+) +8 bp | coding (1120‑1127/1128 nt) | intE ← | e14 prophage; putative integrase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 94 (0.950) | 81/298 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1199680 = | 0 (0.000) | coding (1127/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1199687 | 0 (0.000) | 93 (0.940) | 75/298 | 0.4 | 100% | coding (1120/1128 nt) | intE | e14 prophage; putative integrase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACC > NC_000913/1199539‑1199837 | cGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCgg > 2:296100‑M1/1‑149 (MQ=255)cGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCgg < 2:1009034‑M1/151‑3 (MQ=255)cGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCg < 2:262688‑M1/150‑2 (MQ=255) ggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTAc > 2:74638‑M2/141‑151 (MQ=255) gATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAGCGCgg > 2:1274058‑M1/1‑148 (MQ=255) gATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggt > 2:354054‑M1/1‑148 (MQ=255) gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACt < 2:53987‑M2/12‑1 (MQ=255) aTTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtg > 2:1168369‑M1/1‑147 (MQ=255) aacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGc > 1:1109943‑M2/136‑151 (MQ=255) ggTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctg < 1:828159‑M1/151‑11 (MQ=255) gaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCa < 1:311153‑M2/20‑1 (MQ=255) ctctGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCTCAACGCggtgatgctgccaac < 2:1443126‑M1/147‑16 (MQ=255) ggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTAcc > 1:696367‑M2/123‑151 (MQ=255) ggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTAcc > 2:1091763‑M2/123‑151 (MQ=255) gtgATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactg < 2:1399989‑M1/149‑22 (MQ=255) atTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttag > 2:85699‑M1/1‑123 (MQ=255) ttCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 2:326453‑M1/1‑121 (MQ=255) cACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGCTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgta > 2:632367‑M1/1‑119 (MQ=255) gTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat < 1:1156721‑M1/151‑36 (MQ=255) gctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATa > 2:899938‑M2/107‑150 (MQ=255) ctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAAc > 2:1547105‑M2/106‑151 (MQ=255) gggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGa < 1:182289‑M2/48‑1 (MQ=255) ggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGAt < 1:290981‑M2/49‑1 (MQ=255) gTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 1:1299363‑M1/1‑107 (MQ=255) cggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCgg > 1:962977‑M2/100‑151 (MQ=255) gaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGtt < 1:1481008‑M2/54‑1 (MQ=255) agtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttg < 2:351583‑M2/56‑1 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgtt > 1:202609‑M2/94‑151 (MQ=255) cgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttg > 1:501189‑M2/93‑151 (MQ=255) ctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttgtt > 1:349557‑M2/91‑151 (MQ=255) tGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc > 2:1147787‑M1/1‑97 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttgttg < 2:939756‑M2/62‑1 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTttgttgtt < 1:558332‑M2/61‑1 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaagcactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTtgttgttgt < 1:1123401‑M2/63‑1 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTtgtg > 1:1211949‑M2/88‑151 (MQ=255) gTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGTTGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccaga < 1:1019208‑M1/149‑58 (MQ=255) gTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 1:1496731‑M1/150‑59 (MQ=255) tctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaactctatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGttt < 2:160307‑M2/67‑1 (MQ=255) ccgccgCTCGCTTAAAGGGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 1:400417‑M1/1‑90 (MQ=255) cgccgcTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGGTTTTATCATGTGCGGCGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt > 2:1242892‑M1/1‑89 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATg > 1:785409‑M2/80‑150 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGa < 2:247959‑M2/72‑1 (MQ=255) cgctcgctTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg < 2:139306‑M1/151‑66 (MQ=255) ctTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct > 2:16861‑M1/1‑80 (MQ=255) tAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctat < 1:881372‑M1/150‑73 (MQ=255) gagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGtt < 1:774635‑M2/82‑1 (MQ=255) gTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagct < 2:1092240‑M1/151‑78 (MQ=255) gACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc > 2:2266‑M1/1‑71 (MQ=255) caaagtcatcgtgcactatctgaacataaaacagtatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCAATCCTTTACATCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGCTTTATGACCAAGCAGTTTTTGTGTGTc > 1:1226830‑M2/59‑150 (MQ=255) aagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTaa < 1:934668‑M2/95‑1 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAAcc < 2:151229‑M2/97‑1 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAAcc > 1:1403569‑M2/55‑151 (MQ=255) tttttATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 1:1089906‑M1/1‑61 (MQ=255) tcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAAccc > 2:426435‑M2/54‑151 (MQ=255) ttttATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 1:297410‑M1/1‑60 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCt > 1:160207‑M2/52‑151 (MQ=255) ttATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagc > 1:736830‑M1/1‑58 (MQ=255) gggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGtt < 2:595957‑M2/103‑1 (MQ=255) aTCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct > 1:655806‑M1/1‑56 (MQ=255) tCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgttccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac > 2:702195‑M1/1‑55 (MQ=255) cATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctact < 1:130562‑M1/151‑98 (MQ=255) cattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCtt < 2:1212069‑M2/106‑1 (MQ=255) tgtgCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg > 1:1503047‑M1/1‑52 (MQ=255) tatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtat > 1:970832‑M2/43‑151 (MQ=255) gCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 2:774848‑M1/150‑102 (MQ=255) gCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 1:1325629‑M1/150‑102 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTtat > 2:1517602‑M2/42‑150 (MQ=255) ggggagaaatTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggggattttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg > 1:601381‑M1/4‑47 (MQ=255) ataaaacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGtt < 1:1279822‑M2/118‑1 (MQ=255) tCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgta < 1:42280‑M1/150‑114 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTc > 1:163984‑M2/30‑148 (MQ=255) cAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa < 1:325519‑M1/150‑115 (MQ=255) cAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa < 2:560702‑M1/150‑115 (MQ=255) acactatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGAt < 2:499888‑M2/123‑1 (MQ=255) aaTGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacg > 2:661411‑M1/1‑35 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATaa > 2:1170057‑M2/25‑149 (MQ=255) gtgGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccagcttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggca < 2:485968‑M1/151‑120 (MQ=255) tgGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggca > 2:1310258‑M1/1‑31 (MQ=255) tgGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaactgactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgaggtggtgcgtaacggca < 1:1034551‑M1/150‑120 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATaa > 1:873447‑M2/24‑148 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAg < 1:1430612‑M2/127‑1 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGAc > 2:1459749‑M2/23‑151 (MQ=255) ggCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa < 2:23391‑M1/150‑121 (MQ=255) ggCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaa < 1:656027‑M1/150‑121 (MQ=255) gCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaa < 2:464508‑M1/151‑123 (MQ=255) taagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCttt > 2:114677‑M2/19‑151 (MQ=255) taagttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCttt > 2:1055299‑M2/19‑151 (MQ=255) gttggagtcattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCt > 1:1446765‑M2/16‑151 (MQ=255) agaTGCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcacca < 1:1049519‑M1/151‑129 (MQ=255) gCTTAAAGGTTCACAACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccgg > 2:1278601‑M1/1‑19 (MQ=255) cattaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAAt > 1:905276‑M2/8‑151 (MQ=255) attaccCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATg < 2:873545‑M2/145‑1 (MQ=255) cCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGc > 1:1361839‑M2/2‑150 (MQ=255) cacaACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgct < 1:1346073‑M1/151‑144 (MQ=255) cacaACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAg < 1:977078/151‑1 (MQ=255) acaACGCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgct > 2:605891‑M1/1‑7 (MQ=255) aCGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTg > 2:1193495/1‑150 (MQ=255) cGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGaa < 1:991283/151‑1 (MQ=255) gCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAAc > 2:1029052/1‑151 (MQ=255) cggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagcagtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctg < 1:340157‑M1/151‑151 (MQ=255) | CGATTTTAGGTGATCTTCTCTGTGATATTTCACGTCTTACCAGTAACTGATATGGCTGTCCGCCGCTCGCTTAAAGTGGACTTTTTAGTTTTTATCATGTGCGGTGAGAAATTCAATGTGGCGTTGAGATGCTTAAAGGTTCACAACGCTACTTTGCTCCATCCTTTACCTCGATCATCATGATAACGATCGGTTTGTTGTTGTGTTTTATGACCAAGTAGTTTTTGTGTGTCTAACCCCTGTTCTTTATACAGACGTTCAGATAAAGACCTTTGCTCATGGAATGTCGCAGGTGAACC > NC_000913/1199539‑1199837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |