New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 683271 = | 113 (1.150) | 112 (1.140) | 98/298 | 0.0 | 65.1% | coding (123/1671 nt) | hscC | Hsp70 family chaperone Hsc62; RpoD‑binding transcription inhibitor |
? | NC_000913 | = 1907451 | 7 (0.070) | coding (141/144 nt) | yobF | DUF2527 family heat‑induced protein |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CAGAGTTTTGAAGCCATTACCCTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGCTCGGCAGAGAAGCGGTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACT > NC_000913/1907304‑1907601 | cAGAGTTTTGAAGCCATTACCCTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGgg < 2:1177218‑M2/150‑3 (MQ=255) acaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGAtt > 1:831253‑M1/145‑151 (MQ=255) caagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTg < 1:647150‑M1/8‑1 (MQ=255) tttGAAGCCATTACCCTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtg > 2:976979‑M2/1‑142 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTttcttc < 1:521963‑M1/16‑1 (MQ=255) tttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGccc > 2:1359323‑M1/131‑150 (MQ=255) tttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGc > 1:167182‑M1/131‑148 (MQ=255) ctgggctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGc < 1:46332‑M1/22‑1 (MQ=255) aCCCTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcacc < 1:1150173‑M2/151‑22 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagtgacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGc > 1:1266269‑M1/126‑151 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGc < 1:1528926‑M1/26‑1 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGc < 2:777319‑M1/26‑1 (MQ=255) cccTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccg < 1:128329‑M2/151‑23 (MQ=255) cccTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccg > 2:467427‑M2/1‑129 (MQ=255) cTGGATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccga < 2:54553‑M2/150‑24 (MQ=255) gATAGCGGAGAAGTGTACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaact < 2:146747‑M2/150‑27 (MQ=255) acggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACa > 1:385417‑M1/120‑151 (MQ=255) cggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACAt < 2:180639‑M1/33‑1 (MQ=255) cgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGa > 2:1461270‑M1/116‑151 (MQ=255) gcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACAt < 2:510051‑M1/33‑1 (MQ=255) gcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGAt > 2:1337488‑M1/115‑151 (MQ=255) tgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACt < 1:1142589‑M1/43‑1 (MQ=255) tgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgacgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACt < 2:1384130‑M1/43‑1 (MQ=255) gctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTg > 1:1041857‑M1/108‑151 (MQ=255) gtACGAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaat > 1:884683‑M2/1‑110 (MQ=255) gAACACATCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattccccgaacttatttggaattaattgcgc > 1:457981‑M2/1‑106 (MQ=255) attcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGAcaca > 1:530872‑M1/103‑151 (MQ=255) cactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTa > 1:1062483‑M1/100‑151 (MQ=255) acaTCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggca > 2:360644‑M2/1‑102 (MQ=255) tCTTTGCTGCCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccg < 1:325126‑M2/151‑53 (MQ=255) gtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTg > 2:72464‑M1/96‑150 (MQ=255) tcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGc < 2:271446‑M1/56‑1 (MQ=255) gctgcCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctt > 2:441457‑M2/1‑94 (MQ=255) cgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAg > 2:246825‑M1/91‑151 (MQ=255) ctgcCATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttc < 2:753311‑M2/151‑59 (MQ=255) ggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCAc > 2:1487721‑M1/87‑151 (MQ=255) ggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCAc > 2:661623‑M1/87‑151 (MQ=255) ccATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccag > 1:234134‑M2/1‑90 (MQ=255) cATCAGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttcc < 1:318197‑M2/148‑60 (MQ=255) aGCCGGAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccagacggc > 1:280442‑M2/1‑85 (MQ=255) tgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAatat < 1:705892‑M1/71‑1 (MQ=255) atgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAg > 1:58236‑M1/78‑151 (MQ=255) gAGTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccagacggcaatt < 1:512555‑M2/150‑71 (MQ=255) gactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGc > 1:966249‑M1/76‑151 (MQ=255) gactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGc < 1:550766‑M1/76‑1 (MQ=255) gTAATGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccagacggcaattaa < 1:419129‑M2/150‑73 (MQ=255) aaTGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccagacggcaattaaact < 2:32613‑M2/151‑76 (MQ=255) catgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGCTCgg > 2:1275974‑M1/72‑151 (MQ=255) aTGAAGCCAAAACCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccagacggcaattaaact < 2:800724‑M2/150‑76 (MQ=255) atgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcacattccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGCTCGGc > 1:301538‑M1/71‑151 (MQ=255) tgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGCTCGGc < 1:994806‑M1/81‑1 (MQ=255) gatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGATTGTTTTCTTCGCCCGCAGGCATAACATAGATAAAACTGACACATTACTGCATGAGGCACCAATATAAGGCTCGGCag > 1:1491404‑M1/69‑151 (MQ=255) aaaCCTTTAGACTCGTTGAACCACTTAACCTGACCTTTAATCTTTGCCATTTGAAAAATTCCTTAGggatggtgttaaatattcaccgaacttatttggaattaattgcgcggcaccgtctttccagacggcaattaaactattggtagta > 2:501948‑M2/1‑66 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |