| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,781,645 | 0 | A | C | 42.7% | 150.6 / 13.9 | 90 | V361G (GTT→GGT) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/12); new base C (0/38); total (39/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.05e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTC > NC_000913/2781495‑2781787 | gaggaTATAATTGTTGTTTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATaa < 2:1064556/151‑1 (MQ=255) aggaTATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAAc > 2:853802/1‑151 (MQ=255) ataATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCg < 2:985964/150‑1 (MQ=255) taATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGcc > 1:904897/1‑151 (MQ=255) aaTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGcc < 1:1069702/150‑1 (MQ=255) aaTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGcc > 2:1000913/1‑150 (MQ=255) aTTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCAt > 1:134276/1‑151 (MQ=255) ttgtGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATc > 2:911153/1‑151 (MQ=255) tttgcctttttcccccccGTTTTTGATATTTTGCGTTCCGTTTTTGTTTTTGGTGCCTGTGGTTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCTTTAATTATGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCACCATCCAAAACCCCGCCATTAt < 2:1214936/137‑1 (MQ=255) gtgtCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCt > 2:875450/1‑150 (MQ=255) tgtCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTAt > 1:1045094/1‑151 (MQ=255) cAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCg > 1:426135/1‑151 (MQ=255) aGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCgg > 1:382781/1‑151 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGt > 2:683129/1‑151 (MQ=255) ttCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg > 2:57096/1‑151 (MQ=255) ccccGCGGCTTTTAATATTTTGCGTTCCGCGTTTGTTATTGGTTCCGTTGGTTATCCTATAATTATAAATATTCTGTCTCCCACTATTAATTAGGTTTTTGGCCGCGTTCCCTGCAACACCCTAAGCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCg < 2:341671/149‑1 (MQ=255) ccccccGCTTTTGATATTTTGCTTTCCGTTGTTTATATTGTTGCCTGTGGTTATGCCATATTTTTTAATTTTTTGGTTGCCCCCATTAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTAAAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGt < 2:1440506/147‑1 (MQ=255) ccgccgTTTTTTATATTTTGCGTTCCGTTTTTGATATTGGTGCCTGTGGCTTTGCCATATTTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTTTGGTTTTTGTGGCGTTTCCAGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCAt < 2:785248/151‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATc > 2:325460/1‑151 (MQ=255) gtttttGATTTTTTGCGTTCCGCTGTTGATTTTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATAAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCa < 1:693587/146‑1 (MQ=255) tttGATTTTTTGCTTTCCGTTGTTGATATTGGTGCTTGTGGCTATGCCAAAATTATTAATTTTCTGTGTGCCACCATTAATTTTGGTTTTTGTCGCGTTTCCTGCAACACCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt < 2:145416/150‑1 (MQ=255) tttGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCttt > 1:10576/1‑150 (MQ=255) tGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGc > 1:390288/1‑151 (MQ=255) tatTTTGCTTTCCGCTGTTGATTTGGGTGCCTGGGGCTTTGCCATAATTATTAATATTCTGGGGCCCACAATTATTTATGGTTTTGGGCGGTTTTCCTGCAACACCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTa < 2:1503425/146‑1 (MQ=255) tatTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTGGTGGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAg < 1:1276807/147‑1 (MQ=255) atTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTg > 2:1161868/1‑151 (MQ=255) tttGCGTTCCGTTTTTGATATTGGGGCCTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACCATTAATTATGTTTTTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTgg < 2:312847/150‑1 (MQ=255) tttGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGTTATCCCATAATTATTAATTTTCTGTGTCCCCCCATTATTTATGTTTTTTGGCGCTTTTCCTGCACCACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTgg < 2:1148769/150‑1 (MQ=255) tttGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGt > 1:871441/1‑151 (MQ=255) tGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGtt > 2:594989/1‑150 (MQ=255) gCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTa > 2:669011/1‑150 (MQ=255) gCGATCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTACTATTCTGTCTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCACCATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTa > 2:744418/1‑150 (MQ=255) tcccGCTTTTGATTTTGGTGCTTGTGGCTATCCCATAATTTTTAATTTTCTGTGTCCCCCCATTAATTTTGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGAAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGtt < 2:1258396/144‑1 (MQ=255) tcccGCTGTTGATTTTGGTGCTTTTGGCTTTGCCATATTTATTAATTTTCTGGGTCCCACCATAAATTTTGTTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaaaa < 2:1298407/148‑1 (MQ=255) ccgtttttGATATTGGCGCCTGTGGATTTGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACAATTATTTATGGTTTTTTTCGCGTTTCTGGCACCACCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTaaa < 2:1313402/141‑1 (MQ=255) ccggttttGATATGGGTGCTTGTGGCTATGCCATATTTTTTAATATTCTGTGCCCCCCCTTTAATTTTGGTTTTTGTCGTTTTTCCCACAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAAc < 2:270248/143‑1 (MQ=255) tGTTGATTTTGGTGCCTGTGGCTATCCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTCCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTg < 2:382269/147‑1 (MQ=255) tGTTGATATTGGGGCCTGTGGCTATGCCAAAATTATTAATTTTCTGTGGGCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCGACAACATCCAAACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACa < 2:1497797/150‑1 (MQ=255) ttGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTGCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAtt < 1:372841/150‑1 (MQ=255) ttGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACAt < 1:813251/149‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATTTTCTGTGTGCCACCTTTATTTATGGTATTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTcc < 1:149504/149‑1 (MQ=255) tGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCttt > 1:1199076/1‑151 (MQ=255) gCCTGTGGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATc < 2:204384/150‑1 (MQ=255) gtgGCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGTTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaa < 1:789960/151‑1 (MQ=255) tgGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaat > 2:1003718/1‑151 (MQ=255) ggCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTTTTTTTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCt < 1:624993/145‑1 (MQ=255) ggCTATGCAATAATTATTAATATTCTGTGTCCCCCCATTAATTATGGTTTTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCttt < 2:437104/147‑1 (MQ=255) gttATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTCCCACAATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaataa < 1:1186507/149‑1 (MQ=255) gCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaata > 1:943462/1‑150 (MQ=255) cTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTaataat > 2:86039/1‑151 (MQ=255) tATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATc > 2:1150795/1‑151 (MQ=255) tATCCCATAATTATAAATATTCTGTGTGCCACCTTTAATTATGGTTTTTGTCGTTTTCCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTaataat < 1:797575/150‑1 (MQ=255) aTGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCg > 1:962888/1‑151 (MQ=255) tGCCATATTTTTTAATTTTCTGTGTCCCACCATTAATTATGGTTTTTGTCGCTTTTCCTCCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCg < 2:340406/150‑1 (MQ=255) tGCCATAATTATTAATTTTTTTTGTCCCACATTTATTTATGGTTTTGGTCGCGTTTCCTGAACAATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaataa < 2:97028/147‑1 (MQ=255) tGCCATAATTATTAATATTCTGAGAGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGt > 2:367007/1‑151 (MQ=255) ccATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCTTTAATTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCAATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTc < 2:1008900/150‑1 (MQ=255) caaTAATTTTTAATATTCTGTGTCCCCCAATTATTTATGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACACCAATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTtaataa < 2:664119/143‑1 (MQ=255) aTAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCtt > 1:57729/1‑150 (MQ=255) aTAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTg > 1:1255335/1‑151 (MQ=255) ttatttttttgtgtgCCACATTAAATTTTGTTTTTTGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTg < 2:831285/139‑1 (MQ=255) ttaATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCg > 2:75671/1‑151 (MQ=255) aaTTTTCTGTGTCCCACCATTAATTATGTTTTTTGTCGTTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGc < 2:631849/147‑1 (MQ=255) atatTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAc > 1:695971/1‑151 (MQ=255) atTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAAcc > 1:903340/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCat > 2:424831/1‑151 (MQ=255) gtgCCACCATTAATTATGTTATTTGTCGTGTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCatat < 2:43179/147‑1 (MQ=255) caTTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGt > 2:596921/1‑150 (MQ=255) 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ttGTCGCTTTTCCTGCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGt < 1:412508/150‑1 (MQ=255) gTCGCTTTTCCTGCAACACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGtt < 1:861464/149‑1 (MQ=255) tggcgTTTCCCACAACATCTAATACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGttt < 2:1247802/147‑1 (MQ=255) tCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTc > 2:204305/1‑151 (MQ=255) cgTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTcc > 1:1176139/1‑149 (MQ=255) tttCCTGCACCATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTc < 2:871362/146‑1 (MQ=255) tttCCTCAAACACCCAAAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGtttt < 2:55243/145‑1 (MQ=255) tcccTCCACCACCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCa < 1:817785/148‑1 (MQ=255) ccggCAACATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCGGCa < 2:539726/145‑1 (MQ=255) ccTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAac > 2:323061/1‑150 (MQ=255) cTGCACCATCCATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAaca < 2:101947/150‑1 (MQ=255) cAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACAtt > 2:933557/1‑151 (MQ=255) cacccATACCCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTc < 1:253019/148‑1 (MQ=255) | GAGGATATAATTGTTGTGTCAGCTTTCCCGCCGCTTTTGATATTTTGCGTTCCGCTGTTGATATTGGTGCCTGTGGCTATGCCATAATTATTAATATTCTGTGTGCCACCATTAATTATGGTATTTGTCGCGTTTCCTGCAACATCCATAACCCCGCCATTATCTATTCGGGTCGCATCAGCTTTAGCATTGGTTAAAACTGACATTGTTCCTTTATCTTTAATAATCGTCTTGTTTGCCGAACCATATGCGTTTATGTCTAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTC > NC_000913/2781495‑2781787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |