New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
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tcttctTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGGTTCGAAACCCCCATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCCGGCGGGCTCCTTTAGCCACCCGGACA‑CCCCA‑CCCAAATGTTTTTCTACCCAACCCCCTGGGGGGGAACGGGGGGCTACtat > 1:992035/1‑149 (MQ=14) tcttTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAg < 2:406726/148‑1 (MQ=255) tttAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGGGTCGAACCCCCCATAAGTTGCCGTATACAA‑A‑CTCTCCAGGCGGGCTCCCTCCGCCCCCCCGACA‑CCCCC‑CCCAAATTTTTTTCTACCAAACCCCCTGGGGGGCAACGGGGCGCCCCTATAggggg > 2:960234/1‑148 (MQ=12) ttAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAg < 2:1265924/149‑1 (MQ=255) ttAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGt < 2:8514/150‑1 (MQ=255) tAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGtt < 1:758233/150‑1 (MQ=255) atatGGCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTgg > 1:1354396/1‑149 (MQ=255) atatGGCGGTGA‑‑GGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGt < 2:1029493/151‑1 (MQ=255) ggCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTaaa < 1:896062/151‑1 (MQ=255) cGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAAc < 1:449614/151‑1 (MQ=255) cGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAAc > 2:1433749/1‑151 (MQ=255) ggTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTTA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACg < 2:1642686/151‑1 (MQ=255) ggTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACg < 1:431209/151‑1 (MQ=255) ggTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACg > 2:959076/1‑151 (MQ=255) gA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGt < 1:1692685/150‑1 (MQ=255) ggggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑C‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaagaa < 1:1442614/151‑1 (MQ=255) ggggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaagaa < 2:503982/151‑1 (MQ=255) gggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaagaag < 1:1532350/151‑1 (MQ=255) ggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaaga > 1:1279095/1‑148 (MQ=255) ttCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAAtt > 2:740217/1‑151 (MQ=255) | GAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA‑GGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACAC‑A‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACA‑CCTCA‑CCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAATT > NC_000913/925751‑926051 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |