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tcttcctatctGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCTGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCGGCGTGTCTTTCACCGCAGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCCCGCGGTGCACCGCC < 1:146838/287‑1 gtaggGGAGGGGGGTGGGGCGTCGGTTTTCCCTGGTCGGGCGGAGGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATCCTGCGCGTCGGCCCGCCCGGCGTGGTACGGTTGGCCTTGCCCCACGCATCGTACTGTGGCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCGTTCACCGCAGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACC < 2:258644/293‑1 GGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGATGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGCAGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACCGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACC < 1:634539/298‑1 ACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGCAGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACCTGA > 1:432699/1‑298 ATACTGCCACTGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCGAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/794965‑794676‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acggaAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGCAGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACCTGA < CP006584/794771‑794479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |