| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | = 3305045 | 7 (0.080) | 119 (1.380) | 94/584 | 0.0 | 94.5% | intergenic (‑351/‑23) | ribB/LY180_15715 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone 4‑phosphate synthase/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | 3344745 = | NA (NA) | coding (164/330 nt) | LY180_15880 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTC > CP006584/3304749‑3305341 | tGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGCATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGCGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGCGTTTATTTACCGCCGGGTGGGAATTTCCCCACCACCTTAGAATAACCGGATTCACTATAACGCTAATCATTAGCCGCAGCACCGCATACCTTCACATCATTCTCTCTAATGACTCACCCCTATACCACACCACAGACACACAACAcc > 2:439391/1‑298 (MQ=255)gagcagctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACAcc > 2:261155‑M1/287‑298 (MQ=255) gcATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatga > 1:638193‑M1/1‑292 (MQ=255) tataGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTTTGACTTACCCTTATCCCATTACAATGGCACTCAACACtaatgaacc > 1:475829‑M1/1‑289 (MQ=255) ccAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatccccta > 1:440295‑M1/1‑284 (MQ=255) gatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTa < 1:143414‑M1/31‑1 (MQ=255) gatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcacgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctaaaaaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccccactagcacaaaatttattcaaacatggttacgttttggggaaattatgaggggatcccccaGCCCTCAACCCATCTCAGCACAGGGAAActc < 2:26442‑M1/31‑2 (MQ=255) atcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACaa > 1:24408‑M1/265‑298 (MQ=255) tCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatca > 1:201819‑M1/1‑265 (MQ=255) ccATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcat < 1:495677‑M1/298‑35 (MQ=255) 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actgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaaaatcaataatcagacaacaagatgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcactcttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacgaatcgaccgat > 2:394637‑M1/1‑2 (MQ=255) actgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggataaacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaaaatcaataatcagacaacaagatgtgcgaactcgatattttacaagactctctttaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacgtgactgtaaaactctcactcttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacgaatcgaccgat < 2:251001‑M1/298‑297 (MQ=255) actgatgaatcccctaatgattttgggaaaaatcattaaggtaagttgaatcaaaatcttgtcatatgatcaaatggttgcctgaaaaatcaataatcagacaacaagatttgctaactcgatattttacacgactctcttgaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcactcttaccgaacttggccgtaacctgccaaccaaagcgagaacaaaacataacatcaaacgaatcgaccgat < 2:125655‑M1/298‑297 (MQ=255) | TGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTC > CP006584/3304749‑3305341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |