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acttgcGGCCTgtttgaatcaaagaggaaagcatcgcgaacaaactttttcagtttagtttgtggcttaatattctatcgttagctttatttatagatttttagatgtcatgaggtggttgttggagagatgaatgaggaagaagcgtcgtgccacagaaacgttagctttacatatagcggatgtgatgttaaattaatttacaagagaaataatttacatatcaaacagttagatgctttttgtcgttttttaatatttttatgcttgagaaaaaatacgtaacttatttagtata < 2:143561‑M1/296‑288 (MQ=255) ggggCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcgcacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatttttatattgcatgaggtggtttttggagagaagaatgaggaagatgcgtcgagccacagaaacgttagctttacatatagcggaggtgatgtgaaattaatttacaagagaaataatttacatatcaaacagttagatgctttttgtcgttttttaatatttttatgcttgagaaaaaatacgtaacttatttatgatatgga < 1:353250‑M1/298‑292 (MQ=255) attttgactcatagaggaaagcatcgcgcacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatttttatattgcatgaggtggtttttggagagaagaatgaggaagatgcgtcgagccacagaaacgttagctttacatatagcggcggtgatgtgaaattaatttacaagagaaataatttacatatcaaacagttagatgctttttgtcgttttttaatatttttatgcttgagaaaaaatacctaacttatttttgaattggtacgttt > 2:418855‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAACTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGACTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTCTTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAAAATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTGCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCAAAAT > CP006584/4739518‑4740112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |